MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017473	CAA	2	6	874681	874686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017473	TAA	2	6	876219	876224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017473	TCA	2	6	876230	876235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017473	TGA	2	6	876261	876266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_017473	GCT	2	6	877641	877646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017473	A	7	7	877656	877662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_017473	CAT	2	6	877663	877668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_017473	GAA	2	6	877748	877753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017473	GTG	2	6	878071	878076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_017473	AACA	2	8	878121	878128	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_017473	TA	3	6	878298	878303	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017473	GAG	2	6	878360	878365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017473	GTTT	2	8	880786	880793	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_017473	CCGC	2	8	880796	880803	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3015	NC_017473	GC	3	6	880833	880838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_017473	TATT	2	8	880859	880866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_017473	CA	3	6	882296	882301	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_017473	AGG	2	6	882304	882309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017473	GCAA	2	8	884384	884391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_017473	T	7	7	884439	884445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_017473	TAT	2	6	885146	885151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017473	TA	3	6	886748	886753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017473	AGC	2	6	886838	886843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_017473	GCTGG	2	10	886897	886906	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3025	NC_017473	TAC	2	6	886909	886914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_017473	AATGA	2	10	887583	887592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017473	T	7	7	887994	888000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017473	GAATA	2	10	888019	888028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017473	ATG	2	6	888041	888046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_017473	T	6	6	888117	888122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_017473	TTG	3	9	888156	888164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_017473	CAAAA	2	10	888166	888175	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3033	NC_017473	AATA	2	8	888252	888259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_017473	A	7	7	888270	888276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_017473	GTC	2	6	888330	888335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017473	AAC	2	6	888431	888436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_017473	GGC	2	6	888501	888506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_017473	TGA	2	6	888541	888546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_017473	TGGA	2	8	888713	888720	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017473	GAT	2	6	888766	888771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017473	GCA	2	6	888839	888844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_017473	CGC	2	6	888886	888891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3043	NC_017473	GTGA	2	8	888892	888899	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_017473	TGT	2	6	888925	888930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_017473	AGA	2	6	889148	889153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017473	AT	3	6	889192	889197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_017473	GAA	2	6	889199	889204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017473	GGC	2	6	889218	889223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_017473	GTCTG	2	10	889225	889234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_017473	GAA	2	6	889462	889467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017473	GA	3	6	889500	889505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_017473	GGT	2	6	889536	889541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_017473	GTC	2	6	889550	889555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_017473	TCGTG	2	10	889559	889568	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3055	NC_017473	GGA	2	6	889662	889667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_017473	ATC	2	6	889686	889691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3058	NC_017473	ATGG	2	8	889727	889734	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_017473	CGC	2	6	889852	889857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3060	NC_017473	AC	3	6	889882	889887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3061	NC_017473	GAGC	2	8	889946	889953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3062	NC_017473	CCT	2	6	890026	890031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_017473	CA	3	6	890069	890074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_017473	TCGCA	2	10	890219	890228	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3065	NC_017473	TAAG	2	8	890341	890348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_017473	CGG	2	6	890425	890430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_017473	AGAA	2	8	890471	890478	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017473	TAG	2	6	890492	890497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017473	GCGA	2	8	890500	890507	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_017473	GCTT	2	8	890532	890539	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3071	NC_017473	CGG	2	6	890670	890675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3072	NC_017473	GGA	2	6	890702	890707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017473	AGC	2	6	891364	891369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017473	ATA	2	6	891440	891445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3078	NC_017473	TAG	2	6	891836	891841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017473	GAG	2	6	891923	891928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_017473	GAGC	2	8	891942	891949	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3081	NC_017473	GAA	2	6	891993	891998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017473	AAC	2	6	892039	892044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_017473	GAT	2	6	892081	892086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_017473	CGG	2	6	892172	892177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_017473	GA	3	6	892270	892275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017473	TAGG	2	8	892388	892395	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_017473	TGG	2	6	892434	892439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017473	TAC	2	6	892442	892447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017473	CCT	2	6	892530	892535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_017473	GGT	2	6	892666	892671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017473	CGT	2	6	892861	892866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017473	GAG	2	6	892910	892915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_017473	GCC	2	6	892969	892974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_017473	C	6	6	893037	893042	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3095	NC_017473	GAGAT	2	10	893045	893054	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_017473	GA	3	6	893085	893090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_017473	TGGAAG	2	12	893108	893119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_017473	CTGCGA	2	12	893197	893208	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017473	GCA	2	6	893242	893247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017473	GTG	2	6	893294	893299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_017473	AAG	2	6	893308	893313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017473	CTT	2	6	893350	893355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_017473	AGT	2	6	893365	893370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017473	TGG	2	6	893371	893376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_017473	CTGC	2	8	893381	893388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_017473	GGA	2	6	893418	893423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017473	TCC	2	6	893484	893489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_017473	ATT	2	6	893570	893575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_017473	GGC	2	6	893586	893591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_017473	AAT	2	6	893687	893692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017473	AGT	2	6	893718	893723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_017473	TGG	2	6	893749	893754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_017473	C	7	7	894083	894089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3114	NC_017473	GGT	2	6	894188	894193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017473	TGTTAT	2	12	894215	894226	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017473	TCG	2	6	894251	894256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017473	GCCT	2	8	894334	894341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_017473	TGT	2	6	894518	894523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017473	GGT	2	6	894613	894618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017473	CCT	2	6	894743	894748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3121	NC_017473	CGG	2	6	894796	894801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_017473	TCG	2	6	894966	894971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017473	GCCT	2	8	895049	895056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_017473	TC	4	8	895097	895104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_017473	GA	3	6	895109	895114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017473	CGG	2	6	895187	895192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_017473	GGA	2	6	895217	895222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_017473	CGG	2	6	895242	895247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017473	TCC	2	6	895291	895296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3130	NC_017473	CTA	2	6	895363	895368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_017473	AC	3	6	895407	895412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3132	NC_017473	TCG	2	6	895625	895630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3133	NC_017473	AG	3	6	895671	895676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_017473	TAT	2	6	895679	895684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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