MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017473	TCGCA	2	10	260606	260615	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1002	NC_017473	TAAG	2	8	260728	260735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017473	CGG	2	6	260812	260817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_017473	AGAA	2	8	260858	260865	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017473	TAG	2	6	260879	260884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017473	GCGA	2	8	260887	260894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_017473	GCTT	2	8	260919	260926	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017473	CGG	2	6	261057	261062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_017473	GGA	2	6	261089	261094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017473	AGC	2	6	261751	261756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_017473	ATA	2	6	261827	261832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017473	TCC	2	6	262006	262011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_017473	AGG	2	6	262114	262119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017473	AGC	2	6	262154	262159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_017473	TAG	2	6	262223	262228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017473	GAG	2	6	262310	262315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017473	GAGC	2	8	262329	262336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_017473	GAA	2	6	262380	262385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017473	AAC	2	6	262426	262431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017473	GAT	2	6	262468	262473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017473	CGG	2	6	262559	262564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017473	GA	3	6	262657	262662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017473	TAGG	2	8	262775	262782	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017473	TGG	2	6	262821	262826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017473	TAC	2	6	262829	262834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017473	CCT	2	6	262917	262922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_017473	GGT	2	6	263053	263058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_017473	CGT	2	6	263248	263253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017473	GAG	2	6	263297	263302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017473	GCC	2	6	263356	263361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_017473	C	6	6	263424	263429	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1032	NC_017473	GAGAT	2	10	263432	263441	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017473	GA	3	6	263472	263477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017473	TGGAAG	2	12	263495	263506	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017473	CTGCGA	2	12	263584	263595	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017473	GCA	2	6	263629	263634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017473	GTG	2	6	263681	263686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017473	AAG	2	6	263695	263700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017473	CTT	2	6	263737	263742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_017473	AGT	2	6	263752	263757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017473	TGG	2	6	263758	263763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017473	CTGC	2	8	263768	263775	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_017473	T	7	7	263826	263832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017473	TAAG	2	8	263842	263849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017473	GGC	2	6	265004	265009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017473	CCG	2	6	265548	265553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_017473	AACC	2	8	265877	265884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_017473	AGG	2	6	265898	265903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017473	TTG	3	9	265972	265980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017473	CCGA	2	8	265992	265999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_017473	T	6	6	266087	266092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017473	GAG	2	6	267362	267367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_017473	CGA	2	6	268296	268301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_017473	ATT	2	6	268402	268407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017473	TTA	2	6	268427	268432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017473	ATC	2	6	268501	268506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017473	CGC	2	6	268523	268528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_017473	ATT	2	6	268666	268671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017473	AAT	2	6	268672	268677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017473	CTG	2	6	268697	268702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017473	TG	3	6	268754	268759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017473	TTCA	2	8	268783	268790	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_017473	CGGG	2	8	268795	268802	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_017473	CG	3	6	268804	268809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_017473	TGA	3	9	268824	268832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017473	CAT	2	6	268968	268973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_017473	TTGCT	2	10	268982	268991	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1068	NC_017473	TCG	2	6	268997	269002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_017473	GTA	2	6	269018	269023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017473	CGG	2	6	269042	269047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_017473	CAT	2	6	269058	269063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017473	TGC	2	6	269072	269077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017473	TTA	2	6	269152	269157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017473	CAAGCG	2	12	269178	269189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_017473	AGC	2	6	269205	269210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_017473	GGCTT	2	10	270754	270763	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1077	NC_017473	T	6	6	270840	270845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_017473	T	7	7	273128	273134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017473	AGT	2	6	273180	273185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017473	AAAG	2	8	273197	273204	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_017473	ATG	2	6	273213	273218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017473	TAT	2	6	273965	273970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_017473	GCTT	2	8	274050	274057	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_017473	ACCAT	2	10	274153	274162	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1085	NC_017473	TGA	2	6	274181	274186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_017473	TCT	2	6	274212	274217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_017473	AGATA	2	10	274220	274229	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_017473	T	7	7	276940	276946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017473	GGA	2	6	277047	277052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_017473	AAATT	2	10	278562	278571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017473	T	8	8	278598	278605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_017473	T	7	7	278608	278614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017473	A	6	6	278626	278631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017473	ATGG	2	8	278758	278765	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017473	CAT	2	6	278822	278827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_017473	TTG	2	6	278909	278914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017473	CTG	2	6	278946	278951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_017473	TAGA	2	8	278969	278976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017473	GGC	2	6	279017	279022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_017473	T	6	6	279026	279031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017473	TGC	2	6	279059	279064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_017473	TCG	2	6	279069	279074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_017473	ACG	2	6	279100	279105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_017473	A	6	6	279106	279111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017473	TC	3	6	279154	279159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_017473	T	6	6	279192	279197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017473	CAT	2	6	279285	279290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017473	TCC	2	6	279491	279496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_017473	CAC	2	6	279676	279681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_017473	T	6	6	279893	279898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017473	TAC	2	6	279912	279917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_017473	CAG	2	6	279943	279948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_017473	ATA	2	6	280149	280154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017473	GCA	2	6	280178	280183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017473	CGA	2	6	280246	280251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_017473	A	6	6	280251	280256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_017473	T	6	6	280276	280281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017473	AAC	2	6	280346	280351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017473	A	7	7	280379	280385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017473	CCT	2	6	280586	280591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_017473	T	6	6	280674	280679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017473	AAG	2	6	280731	280736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017473	TAG	2	6	280740	280745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017473	GAT	2	6	280752	280757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017473	AAAG	2	8	282180	282187	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017473	TTA	2	6	282244	282249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_017473	A	6	6	282285	282290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017473	CTTG	2	8	286223	286230	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_017473	GTTA	2	8	286236	286243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017473	ACAT	2	8	286254	286261	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_017473	CCGG	2	8	286332	286339	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_017473	ATA	2	6	286429	286434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017473	CGG	2	6	286458	286463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_017473	AAG	2	6	287815	287820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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