MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017473	TTGC	2	8	90373	90380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
502	NC_017473	CT	3	6	90445	90450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_017473	GGC	2	6	90539	90544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_017473	ATA	2	6	90628	90633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017473	ATT	2	6	90652	90657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017473	ACA	2	6	90730	90735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017473	CCA	2	6	90778	90783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_017473	TGAAT	2	10	90867	90876	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017473	GTT	2	6	90911	90916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017473	GGCAAT	2	12	91032	91043	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_017473	TATT	2	8	91117	91124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017473	ATA	2	6	91126	91131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017473	TCCCCA	2	12	91136	91147	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_017473	TATC	2	8	91181	91188	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
515	NC_017473	GTTTTT	2	12	91195	91206	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017473	A	6	6	91258	91263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017473	GTA	2	6	91288	91293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017473	GTC	2	6	91332	91337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017473	GAC	2	6	93467	93472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017473	A	6	6	93496	93501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017473	TGC	2	6	93507	93512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017473	GCA	2	6	93525	93530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017473	CCT	2	6	93531	93536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
524	NC_017473	GAG	2	6	93573	93578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017473	TAAA	2	8	94186	94193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017473	TAGTTA	2	12	94199	94210	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017473	TTTC	2	8	94247	94254	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_017473	CCA	2	6	94325	94330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_017473	CAAT	2	8	94344	94351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_017473	ATG	2	6	94472	94477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017473	A	6	6	94480	94485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017473	CCT	2	6	96193	96198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017473	CCCAG	2	10	96211	96220	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
534	NC_017473	ACT	2	6	96305	96310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017473	TAA	2	6	97482	97487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017473	TCC	2	6	99558	99563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_017473	CAAA	2	8	99619	99626	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
538	NC_017473	GC	3	6	99731	99736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
539	NC_017473	TCA	2	6	99768	99773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_017473	GTTG	2	8	99804	99811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017473	TAA	2	6	99840	99845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017473	AAAT	2	8	99861	99868	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017473	GA	3	6	99872	99877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017473	CG	3	6	99987	99992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_017473	GTCT	2	8	100008	100015	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
546	NC_017473	AGG	2	6	100249	100254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017473	A	6	6	103886	103891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017473	TGA	2	6	104329	104334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017473	TCA	2	6	104355	104360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017473	AT	3	6	104391	104396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017473	TAA	2	6	104403	104408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017473	GGCA	2	8	104425	104432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
553	NC_017473	CT	3	6	104447	104452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_017473	TCA	2	6	104466	104471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_017473	GTGA	2	8	104480	104487	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017473	CAT	2	6	104510	104515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_017473	G	7	7	104562	104568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017473	TTA	2	6	105901	105906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017473	CTTT	2	8	105925	105932	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017473	TTG	2	6	105956	105961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017473	TGC	2	6	105985	105990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_017473	AT	3	6	105991	105996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017473	TAA	2	6	106001	106006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017473	AT	3	6	106120	106125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017473	ATA	2	6	106164	106169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017473	TAG	2	6	106184	106189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017473	TAA	2	6	106201	106206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017473	ATCA	2	8	106860	106867	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_017473	AGA	2	6	106880	106885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017473	ATGGC	2	10	107390	107399	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
571	NC_017473	TTG	2	6	107421	107426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017473	AGA	2	6	110049	110054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017473	GAT	2	6	110063	110068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017473	CAG	2	6	110132	110137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_017473	TTGT	2	8	110159	110166	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017473	A	6	6	110237	110242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017473	AGG	2	6	110262	110267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017473	AAGA	2	8	111672	111679	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017473	T	9	9	112930	112938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017473	GAG	2	6	113116	113121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017473	T	6	6	114458	114463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017473	GCT	2	6	114468	114473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017473	TGG	2	6	114488	114493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017473	T	7	7	114497	114503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017473	CAT	2	6	114516	114521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_017473	AGG	2	6	114573	114578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017473	CGT	2	6	114586	114591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017473	GAT	2	6	114681	114686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017473	AT	3	6	114685	114690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017473	CA	3	6	117060	117065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017473	ACC	2	6	117069	117074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_017473	GGT	2	6	117096	117101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017473	T	6	6	117101	117106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017473	ATC	2	6	119551	119556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_017473	AAC	2	6	120805	120810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_017473	TGT	2	6	120835	120840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017473	CAA	2	6	120927	120932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_017473	TTG	2	6	120947	120952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017473	ATG	2	6	120973	120978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017473	AAC	2	6	121053	121058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017473	TA	3	6	122246	122251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017473	AAT	2	6	122269	122274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017473	TTG	2	6	124222	124227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017473	CAA	2	6	124243	124248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017473	CGT	2	6	124341	124346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017473	AAC	2	6	124367	124372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017473	AAT	2	6	124375	124380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_017473	AC	3	6	124386	124391	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017473	TA	3	6	124392	124397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017473	CTG	2	6	124452	124457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017473	A	7	7	126741	126747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017473	T	7	7	126765	126771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017473	TCAAA	2	10	126868	126877	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_017473	TGA	2	6	128486	128491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017473	ATTA	2	8	128497	128504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017473	ATA	2	6	128506	128511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017473	GTT	2	6	128524	128529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017473	A	6	6	128531	128536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017473	TTAG	2	8	128547	128554	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017473	TGAC	2	8	129973	129980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
621	NC_017473	TGT	2	6	130000	130005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017473	ATT	2	6	130867	130872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017473	CAC	2	6	131039	131044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017473	TCC	2	6	132449	132454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_017473	T	7	7	132460	132466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017473	TGGT	2	8	132469	132476	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017473	A	6	6	132499	132504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017473	TCA	3	9	132509	132517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017473	GTC	2	6	132524	132529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_017473	TTA	2	6	132547	132552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017473	GCT	2	6	132556	132561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017473	AT	3	6	132593	132598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017473	ATT	2	6	132601	132606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017473	TAA	2	6	132613	132618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017473	GCT	2	6	132633	132638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017473	T	6	6	132658	132663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017473	TTA	2	6	134116	134121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017473	CTG	2	6	134126	134131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017473	A	6	6	134238	134243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017473	TGTT	2	8	134250	134257	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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