MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 9184

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017473	TGAA	2	8	1810475	1810482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017473	ATC	2	6	1810506	1810511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_017473	AGC	2	6	1810548	1810553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_017473	AGG	3	9	1810606	1810614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017473	TA	3	6	1814807	1814812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017473	TCC	2	6	1815235	1815240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5507	NC_017473	TCAAA	2	10	1815241	1815250	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5508	NC_017473	TCC	2	6	1815471	1815476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_017473	GTT	2	6	1816060	1816065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017473	A	6	6	1816088	1816093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017473	AAC	2	6	1817450	1817455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_017473	ATGA	2	8	1817462	1817469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017473	AAT	2	6	1818070	1818075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017473	TTCC	2	8	1818146	1818153	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_017473	TTGA	2	8	1818158	1818165	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017473	T	6	6	1820167	1820172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017473	GAA	2	6	1820174	1820179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017473	A	6	6	1820183	1820188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_017473	TCCG	2	8	1820596	1820603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_017473	CAT	2	6	1820631	1820636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_017473	GAT	2	6	1823029	1823034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_017473	TTA	2	6	1823536	1823541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_017473	GCT	2	6	1827687	1827692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_017473	AGTT	2	8	1827707	1827714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_017473	ATG	2	6	1828592	1828597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_017473	GTCA	2	8	1828604	1828611	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5527	NC_017473	TAT	2	6	1828629	1828634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_017473	CAA	2	6	1828674	1828679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_017473	AAT	2	6	1832526	1832531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_017473	AAAAG	2	10	1832606	1832615	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_017473	T	6	6	1832641	1832646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_017473	ATG	2	6	1833733	1833738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017473	CAA	2	6	1833786	1833791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017473	CA	3	6	1833801	1833806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_017473	AGA	2	6	1833831	1833836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017473	TCA	2	6	1833905	1833910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_017473	T	6	6	1834996	1835001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_017473	ATGA	2	8	1835003	1835010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017473	CTTG	2	8	1835012	1835019	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5540	NC_017473	GCA	2	6	1835023	1835028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_017473	ACT	2	6	1835811	1835816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_017473	AGAGC	2	10	1835917	1835926	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5543	NC_017473	TGATA	2	10	1838047	1838056	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017473	A	6	6	1838079	1838084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017473	GCA	2	6	1838102	1838107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_017473	ATTA	2	8	1838931	1838938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017473	TG	3	6	1838962	1838967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017473	TAG	2	6	1838998	1839003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017473	TG	3	6	1839038	1839043	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017473	AATT	2	8	1839986	1839993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_017473	AATG	2	8	1840029	1840036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017473	TTGT	2	8	1840045	1840052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017473	A	7	7	1840060	1840066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017473	ACTG	2	8	1840132	1840139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_017473	GTC	2	6	1841117	1841122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5557	NC_017473	AAGG	2	8	1841180	1841187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_017473	TGGT	2	8	1841301	1841308	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_017473	CAC	2	6	1841326	1841331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5562	NC_017473	TG	3	6	1844869	1844874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017473	TTG	2	6	1844909	1844914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5565	NC_017473	TTG	2	6	1845423	1845428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5567	NC_017473	TCC	2	6	1847261	1847266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5571	NC_017473	GC	3	6	1847382	1847387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5581	NC_017473	AATCG	2	10	1848398	1848407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5582	NC_017473	AAT	2	6	1848606	1848611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_017473	A	6	6	1851397	1851402	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5587	NC_017473	GTATA	2	10	1852853	1852862	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_017473	T	6	6	1852905	1852910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5593	NC_017473	GGT	2	6	1853853	1853858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5597	NC_017473	TGC	2	6	1857383	1857388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5601	NC_017473	CTTC	2	8	1857545	1857552	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5602	NC_017473	AGT	2	6	1859397	1859402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017473	CAA	2	6	1859442	1859447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_017473	GCAA	2	8	1859462	1859469	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5605	NC_017473	T	6	6	1859483	1859488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017473	CCTT	2	8	1860114	1860121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5610	NC_017473	GTA	2	6	1860213	1860218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5612	NC_017473	ATGCT	2	10	1860280	1860289	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5613	NC_017473	AGCC	2	8	1863090	1863097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_017473	ATTC	2	8	1863111	1863118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5617	NC_017473	T	6	6	1864414	1864419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_017473	CTT	2	6	1864536	1864541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_017473	CTTT	2	8	1874540	1874547	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5626	NC_017473	A	7	7	1875420	1875426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_017473	CCT	2	6	1875428	1875433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5629	NC_017473	TTG	2	6	1875568	1875573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5630	NC_017473	ACC	2	6	1877080	1877085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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