MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 309

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	AGA	2	6	26	31	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017472	ATG	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017472	AAT	2	6	87	92	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017472	ATT	2	6	152	157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017472	AGA	2	6	158	163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017472	GAA	2	6	303	308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017472	AGT	2	6	323	328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017472	GAA	3	9	342	350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017472	AAG	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017472	AGA	2	6	487	492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017472	GAA	2	6	540	545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017472	ATG	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017472	AGA	2	6	617	622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017472	ACT	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017472	ATT	2	6	844	849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017472	GAA	3	9	948	956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017472	TGA	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017472	GAA	2	6	1080	1085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017472	GAA	2	6	1188	1193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017472	CAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017472	AAT	2	6	1418	1423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017472	CTT	2	6	1475	1480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017472	TTA	2	6	1494	1499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017472	AGT	2	6	2796	2801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017472	CCT	2	6	3670	3675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017472	AGC	2	6	3759	3764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017472	TGT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017472	AAT	2	6	4081	4086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017472	TAT	2	6	4120	4125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017472	TTA	2	6	4136	4141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017472	TAA	2	6	4290	4295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017472	GAA	2	6	4381	4386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017472	TTA	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017472	GCT	2	6	4418	4423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017472	GCT	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017472	GAA	2	6	4596	4601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017472	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017472	CGT	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017472	TAC	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017472	TGA	2	6	4811	4816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017472	CTT	2	6	4891	4896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017472	CAA	2	6	4980	4985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017472	AGC	2	6	5087	5092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017472	TAT	2	6	5107	5112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017472	AAT	2	6	5164	5169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017472	TGC	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017472	TCA	2	6	5318	5323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017472	TAT	2	6	5335	5340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017472	TAA	2	6	5408	5413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017472	AGT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017472	TAA	2	6	5451	5456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017472	TTA	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017472	ATT	2	6	6029	6034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017472	TAG	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017472	ATA	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017472	GAA	2	6	14318	14323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017472	ACA	2	6	14353	14358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017472	AGT	2	6	14365	14370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017472	TTC	2	6	14476	14481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017472	CAA	2	6	14557	14562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017472	TTA	2	6	14966	14971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017472	AAT	2	6	15048	15053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017472	AAT	2	6	16225	16230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017472	TCC	2	6	16594	16599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017472	TAT	2	6	16617	16622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017472	TAT	2	6	17579	17584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017472	TTA	2	6	17585	17590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017472	TAC	2	6	17682	17687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017472	ATC	2	6	19650	19655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017472	GTG	2	6	19661	19666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017472	TTG	2	6	19685	19690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017472	TAG	2	6	19714	19719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017472	ACA	2	6	19730	19735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017472	TTA	2	6	19831	19836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017472	TGA	2	6	19939	19944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017472	TAG	2	6	19970	19975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017472	TGA	2	6	20495	20500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017472	CTT	2	6	20602	20607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017472	TTA	2	6	20646	20651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017472	TAA	2	6	20711	20716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017472	TAT	2	6	20726	20731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017472	ATA	2	6	22298	22303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017472	AAT	2	6	22440	22445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017472	GAT	2	6	22455	22460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017472	TAT	2	6	22609	22614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017472	TAA	2	6	22678	22683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017472	TAA	2	6	22822	22827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017472	TGG	2	6	22835	22840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017472	TGA	2	6	22851	22856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017472	TAA	2	6	22962	22967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017472	GCT	2	6	23072	23077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017472	TTA	2	6	23149	23154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017472	CTC	2	6	23794	23799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017472	AGC	2	6	23867	23872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017472	GCT	2	6	23880	23885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017472	TAA	2	6	23896	23901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017472	TAA	2	6	24911	24916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017472	ATA	2	6	25365	25370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017472	TTG	2	6	25771	25776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017472	TAA	2	6	25862	25867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017472	ATT	2	6	26125	26130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017472	CAA	2	6	26169	26174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017472	CAA	2	6	26217	26222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017472	TAA	2	6	26251	26256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017472	ATA	2	6	26340	26345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017472	AGG	2	6	26372	26377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017472	ATT	3	9	27927	27935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017472	ATT	2	6	27954	27959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017472	ACA	2	6	28982	28987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017472	AGA	2	6	29145	29150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017472	AAT	2	6	29169	29174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017472	AGG	2	6	29360	29365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017472	GAT	2	6	29384	29389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017472	TTC	2	6	29454	29459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017472	CAT	2	6	29474	29479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017472	ATG	2	6	29583	29588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017472	GTA	2	6	29628	29633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017472	AGT	2	6	29643	29648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017472	TAT	2	6	29734	29739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017472	GAA	2	6	29969	29974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017472	TGA	2	6	30050	30055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017472	TAA	2	6	30306	30311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017472	TAT	2	6	30333	30338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017472	AAT	2	6	30409	30414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017472	TAT	2	6	30615	30620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017472	TAC	2	6	30640	30645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017472	ATA	2	6	32277	32282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017472	CCT	2	6	32605	32610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_017472	ATT	2	6	32618	32623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017472	TCA	2	6	32797	32802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017472	AAT	2	6	32870	32875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017472	TAT	2	6	32903	32908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017472	GTG	2	6	32919	32924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017472	ATT	2	6	32956	32961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017472	AAC	2	6	32977	32982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017472	ATT	2	6	34766	34771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017472	ATT	2	6	34971	34976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017472	GAA	2	6	34996	35001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017472	GCT	2	6	35294	35299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017472	TCT	2	6	35608	35613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017472	TCA	2	6	35640	35645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017472	GTC	2	6	36200	36205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017472	TGC	2	6	36207	36212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.