MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 6560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	AAAT	2	8	7	14	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017470	GGA	2	6	32	37	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017470	T	6	6	1456	1461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017470	CTT	2	6	1489	1494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017470	CTA	4	12	1522	1533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017470	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017470	TAAA	2	8	1548	1555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017470	A	6	6	1553	1558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017470	AGG	2	6	1577	1582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017470	ATTAAG	2	12	2733	2744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017470	CTT	2	6	2745	2750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017470	T	7	7	2779	2785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017470	T	6	6	2787	2792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017470	TTC	2	6	2827	2832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017470	T	6	6	2853	2858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017470	A	7	7	2859	2865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017470	TA	3	6	2926	2931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017470	A	7	7	8750	8756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017470	A	6	6	8758	8763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017470	A	7	7	8775	8781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017470	T	6	6	8791	8796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017470	TAA	2	6	8800	8805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017470	A	7	7	8818	8824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017470	T	6	6	8857	8862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017470	AGG	2	6	8946	8951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017470	AGGAA	2	10	9284	9293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017470	AAAT	2	8	9826	9833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017470	T	6	6	10136	10141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017470	GATTT	2	10	10167	10176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017470	T	6	6	10174	10179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017470	TAA	2	6	10207	10212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017470	AGGA	2	8	10246	10253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017470	T	6	6	14195	14200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017470	TTA	2	6	14203	14208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017470	ATAAA	2	10	14261	14270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017470	AAT	2	6	14280	14285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017470	ATAAAT	2	12	14287	14298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017470	TGA	2	6	14356	14361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017470	ATTA	2	8	14367	14374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017470	T	6	6	14376	14381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017470	GGA	2	6	14382	14387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017470	ATT	2	6	15352	15357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017470	T	6	6	15370	15375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017470	T	7	7	15388	15394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017470	ATTA	2	8	16390	16397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017470	CATA	2	8	16398	16405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017470	T	6	6	16429	16434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017470	AC	3	6	17379	17384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017470	AAGA	2	8	17424	17431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017470	T	6	6	17445	17450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017470	GTA	2	6	17474	17479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017470	TTA	2	6	17501	17506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017470	GTA	2	6	17720	17725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017470	GAA	2	6	17747	17752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017470	AAT	2	6	18033	18038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017470	ATC	2	6	19310	19315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017470	TAA	2	6	19326	19331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017470	ATT	2	6	19345	19350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017470	AAAT	2	8	19358	19365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017470	T	8	8	20143	20150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017470	T	7	7	20154	20160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017470	A	6	6	20162	20167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017470	TAA	2	6	20196	20201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017470	TGT	2	6	20206	20211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017470	ATG	2	6	20270	20275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017470	TAA	2	6	20307	20312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017470	T	6	6	20347	20352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017470	TTA	2	6	20371	20376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017470	GGA	2	6	20393	20398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017470	AGA	2	6	20788	20793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017470	GT	3	6	21662	21667	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017470	GTTT	2	8	21744	21751	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017470	T	6	6	21760	21765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017470	CTC	2	6	21766	21771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017470	TAA	2	6	21773	21778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017470	TAA	2	6	21814	21819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017470	A	6	6	21845	21850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017470	GAAAAA	2	12	22462	22473	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017470	TAA	2	6	22475	22480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017470	CTA	2	6	22493	22498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017470	TGT	2	6	23808	23813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017470	AGC	2	6	23833	23838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017470	ATT	2	6	23839	23844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017470	TAAA	2	8	23866	23873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017470	AAT	2	6	23879	23884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017470	AGG	2	6	23928	23933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017470	T	7	7	25370	25376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017470	A	6	6	25403	25408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017470	TTTG	2	8	25414	25421	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017470	GAA	2	6	25461	25466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017470	A	6	6	25509	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017470	TAA	2	6	26908	26913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017470	CT	3	6	26940	26945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017470	TTA	2	6	26951	26956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017470	AT	3	6	26960	26965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017470	TCT	2	6	29307	29312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017470	ATT	3	9	31572	31580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017470	TATG	2	8	31597	31604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017470	TAA	2	6	31701	31706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017470	A	6	6	31712	31717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017470	A	6	6	31751	31756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017470	A	6	6	31793	31798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017470	T	6	6	33440	33445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017470	TAC	2	6	33673	33678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017470	GA	3	6	33688	33693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017470	TGC	2	6	33708	33713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017470	A	6	6	33720	33725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017470	A	6	6	35182	35187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017470	TAA	2	6	35209	35214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017470	TAAAA	2	10	35224	35233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017470	CTAA	2	8	35669	35676	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017470	A	6	6	35687	35692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017470	ATT	2	6	35739	35744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017470	TAT	2	6	36911	36916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017470	T	6	6	36935	36940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017470	TAT	2	6	36997	37002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017470	A	6	6	39745	39750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017470	A	7	7	39779	39785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017470	TTA	2	6	39795	39800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017470	T	6	6	39817	39822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017470	TAA	2	6	39876	39881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017470	AAC	2	6	39891	39896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017470	GATT	2	8	39918	39925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017470	ATT	2	6	39966	39971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017470	TGT	2	6	39972	39977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017470	TTA	2	6	39994	39999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017470	T	6	6	40016	40021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017470	AAGGA	2	10	40064	40073	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017470	TATCT	2	10	40809	40818	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017470	T	8	8	40833	40840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017470	CTT	2	6	42781	42786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017470	AT	3	6	42799	42804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017470	GAAA	2	8	42815	42822	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017470	ATG	2	6	42841	42846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017470	GAA	2	6	44862	44867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017470	CAAA	2	8	45480	45487	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017470	A	6	6	45485	45490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017470	T	6	6	45513	45518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017470	ATTT	2	8	45529	45536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017470	TTA	2	6	46572	46577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017470	CAA	2	6	46613	46618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017470	A	6	6	46624	46629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017470	T	6	6	46635	46640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017470	TAAAA	2	10	46660	46669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017470	ATT	2	6	46691	46696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017470	TA	3	6	46699	46704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017470	TAT	2	6	46768	46773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017470	CAA	2	6	46797	46802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017470	AGAT	2	8	46807	46814	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017470	AAG	2	6	46818	46823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017470	TCT	2	6	46832	46837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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