MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus 2038 chromosome

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017469	ATAAA	2	10	9005	9014	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017469	TCGCC	2	10	15571	15580	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017469	GCGGG	2	10	15653	15662	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017469	ATTAA	2	10	19506	19515	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017469	CATTG	2	10	26748	26757	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017469	GATAA	2	10	34518	34527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017469	GAAAA	2	10	35622	35631	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017469	TCGTG	2	10	36914	36923	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017469	GGCAG	2	10	37315	37324	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017469	GGGAG	2	10	38128	38137	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017469	TTGAA	2	10	39493	39502	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017469	CTTTT	2	10	40727	40736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017469	GCTTT	2	10	45945	45954	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017469	TCTTA	2	10	58087	58096	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017469	AAGTT	2	10	58268	58277	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017469	TAAAA	2	10	68510	68519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017469	TCTTT	2	10	79241	79250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017469	GATGT	2	10	91549	91558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017469	TAAAA	2	10	102055	102064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017469	CAAAA	2	10	109554	109563	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017469	TATGC	2	10	111924	111933	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017469	ACTTT	2	10	127273	127282	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017469	ATCAA	2	10	129156	129165	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017469	TATTT	2	10	130430	130439	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017469	TATTG	2	10	133602	133611	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017469	GATGA	2	10	143358	143367	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017469	TGCTT	2	10	145593	145602	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017469	ATCTA	2	10	157106	157115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017469	ATTAT	2	10	157275	157284	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017469	GAAAA	2	10	180747	180756	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017469	TGCTT	2	10	180841	180850	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017469	TCTTT	2	10	185421	185430	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017469	GCTTC	2	10	198915	198924	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017469	CAATT	2	10	200150	200159	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017469	TTTCA	2	10	200496	200505	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017469	GGCCA	2	10	200670	200679	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017469	TATTG	2	10	200796	200805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017469	CTCAA	2	10	201059	201068	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017469	AAATT	2	10	209700	209709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017469	CAGGC	2	10	210445	210454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017469	TTTCA	2	10	212084	212093	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017469	TTAAT	2	10	215133	215142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017469	GAATT	2	10	217197	217206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017469	CAAAT	2	10	231380	231389	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017469	GAAAA	2	10	241925	241934	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017469	GAAAA	2	10	241954	241963	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017469	CTTTT	2	10	249899	249908	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017469	GAACT	2	10	254857	254866	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017469	TGATT	3	15	255904	255918	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017469	TTGAT	2	10	255937	255946	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017469	AAAAG	2	10	255961	255970	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017469	TGTGA	2	10	258785	258794	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017469	AAAAG	2	10	267024	267033	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017469	AAAAT	2	10	270796	270805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017469	AAGAA	2	10	272688	272697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017469	CTGGC	2	10	277223	277232	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017469	GCAAG	2	10	277431	277440	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017469	TAAGG	2	10	280942	280951	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017469	TAGAA	2	10	288993	289002	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017469	AAGAG	2	10	294317	294326	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017469	CTCTT	2	10	294331	294340	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017469	AAAAG	2	10	294385	294394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017469	CTTTA	2	10	296038	296047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017469	CTTTT	2	10	321915	321924	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017469	AGGAA	2	10	337395	337404	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017469	ATCAG	2	10	355647	355656	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017469	TAATG	2	10	355964	355973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017469	GACAA	2	10	356686	356695	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017469	TCTAT	2	10	359083	359092	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017469	AGATT	2	10	360190	360199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017469	TCTTT	2	10	375797	375806	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017469	AATAT	2	10	406333	406342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017469	AGGGG	2	10	417323	417332	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017469	TTGAA	2	10	417614	417623	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017469	AAAAT	2	10	426786	426795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017469	GGCCT	2	10	460688	460697	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017469	GCTAC	2	10	460765	460774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017469	AGAGG	2	10	467599	467608	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017469	TTCAT	2	10	468755	468764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017469	AAAAG	2	10	485245	485254	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017469	AACAA	2	10	488323	488332	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017469	TTCTT	2	10	490619	490628	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017469	AGGAA	2	10	492238	492247	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017469	GGGCA	2	10	508410	508419	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017469	TTTTC	2	10	526886	526895	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017469	TAAAT	2	10	529229	529238	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017469	GCAGA	2	10	531020	531029	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017469	AAAAG	2	10	535825	535834	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017469	CTTTT	2	10	549138	549147	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017469	AGCGA	2	10	551363	551372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017469	GTATA	2	10	573585	573594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017469	AATAA	2	10	573665	573674	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017469	CCGGT	2	10	608759	608768	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017469	TTTTA	2	10	630354	630363	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017469	TTTTC	2	10	656381	656390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017469	ACTTT	2	10	659212	659221	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017469	ACAAA	2	10	664073	664082	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017469	TCGGG	2	10	665932	665941	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017469	ATTAA	2	10	666852	666861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017469	TGCAA	2	10	666892	666901	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017469	TTAGC	2	10	667007	667016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017469	TTTTC	2	10	674444	674453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017469	AAGAA	2	10	677191	677200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017469	TGATG	2	10	678847	678856	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017469	TCGTG	2	10	682121	682130	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017469	GGCAG	2	10	682522	682531	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017469	GGGAG	2	10	683337	683346	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017469	TTGAA	2	10	684702	684711	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017469	AGCAA	2	10	685725	685734	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017469	ATTTT	2	10	685980	685989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017469	TGTTT	2	10	687596	687605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017469	ATAGA	2	10	702858	702867	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017469	CTTGC	2	10	711114	711123	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017469	AGCAA	2	10	711331	711340	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017469	AGCCG	2	10	713217	713226	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017469	AAAAT	2	10	715082	715091	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017469	AAATA	2	10	728625	728634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017469	CTTTT	2	10	728662	728671	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017469	CTTTT	2	10	732534	732543	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017469	TACAA	2	10	738415	738424	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017469	CAAGC	2	10	742981	742990	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017469	AATGG	2	10	744674	744683	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017469	CTATG	2	10	744763	744772	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017469	GTAGA	2	10	746362	746371	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017469	ACTCC	2	10	753489	753498	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017469	AAGAA	2	10	754912	754921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017469	TTAAA	2	10	755474	755483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017469	AATGT	2	10	755545	755554	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017469	CAAAA	2	10	757116	757125	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017469	TAAAA	2	10	763765	763774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017469	TTCGT	2	10	766781	766790	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017469	ATATA	2	10	770795	770804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017469	TCTTT	2	10	773964	773973	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017469	GATTT	2	10	775174	775183	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017469	CCCTT	2	10	783701	783710	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017469	TTTTA	2	10	784602	784611	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017469	CCTTG	2	10	784902	784911	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017469	TCGTG	2	10	790253	790262	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017469	GGCAG	2	10	790654	790663	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017469	GGGAG	2	10	791467	791476	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017469	TTGAA	2	10	792832	792841	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017469	AGCAA	2	10	793855	793864	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017469	AGTAA	2	10	805687	805696	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017469	AAAGG	2	10	819820	819829	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017469	GGCAA	2	10	820841	820850	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017469	GAAAA	2	10	820979	820988	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017469	TCGTG	2	10	822274	822283	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_017469	CAATG	2	10	1788763	1788772	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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344	NC_017469	CGGCG	2	10	1817061	1817070	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
345	NC_017469	CTCCC	2	10	1817688	1817697	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
346	NC_017469	CTGCC	2	10	1818740	1818749	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
347	NC_017469	CACGA	2	10	1819141	1819150	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.