MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017468	ATA	2	6	65	70	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017468	AAT	2	6	174	179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017468	AGT	2	6	235	240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017468	ATA	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017468	ATT	2	6	1825	1830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017468	TAC	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017468	AAC	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017468	GTT	2	6	2115	2120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017468	AAT	2	6	2540	2545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017468	ATT	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017468	TAT	2	6	2655	2660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017468	TCG	2	6	2799	2804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017468	TAA	2	6	2811	2816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017468	GAA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017468	CTT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017468	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017468	GGT	2	6	4738	4743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017468	TTG	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017468	TTA	2	6	4930	4935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017468	TAT	2	6	5016	5021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017468	GTT	2	6	9599	9604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017468	TGT	2	6	13418	13423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017468	CTG	2	6	13517	13522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017468	CCT	2	6	14978	14983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017468	ATT	2	6	15001	15006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017468	TCT	2	6	15049	15054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017468	AAC	2	6	15093	15098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017468	CAA	3	9	16588	16596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017468	ATT	2	6	16844	16849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017468	CTT	2	6	16933	16938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017468	TTA	2	6	18392	18397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017468	AAT	2	6	19717	19722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017468	GCT	2	6	19738	19743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017468	AAG	2	6	19934	19939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017468	ATA	2	6	19953	19958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017468	AGT	2	6	20019	20024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017468	TCT	2	6	20185	20190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017468	TCC	2	6	20221	20226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_017468	GTA	2	6	20247	20252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017468	GAT	2	6	20338	20343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017468	TAT	2	6	20368	20373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017468	TTA	2	6	20429	20434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017468	TTA	2	6	20448	20453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017468	TAC	2	6	20483	20488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017468	GAA	2	6	20505	20510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017468	TGA	2	6	20587	20592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017468	TTA	2	6	20611	20616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017468	AAG	2	6	20786	20791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017468	CAG	2	6	20865	20870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017468	TAA	2	6	21028	21033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017468	TCC	2	6	22151	22156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017468	ATG	2	6	22234	22239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017468	TGC	2	6	22285	22290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017468	ATA	2	6	22291	22296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017468	ATT	2	6	23659	23664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017468	AAT	2	6	24744	24749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017468	ATT	2	6	26429	26434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.