MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 1439

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	TTTA	2	8	2972	2979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017467	AAAG	2	8	9974	9981	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017467	TAAA	2	8	10407	10414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017467	GCCT	2	8	10554	10561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017467	GCCA	2	8	10636	10643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017467	GCAA	2	8	10723	10730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017467	ATCG	2	8	11134	11141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017467	AAAC	2	8	11398	11405	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017467	CGAA	2	8	11573	11580	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017467	ATGA	2	8	12010	12017	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017467	AATT	2	8	12025	12032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017467	AGAA	2	8	12097	12104	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017467	TTTA	2	8	16871	16878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017467	TAAC	2	8	16891	16898	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017467	TTTG	2	8	17736	17743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017467	TCAT	2	8	18920	18927	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017467	AGGA	2	8	18975	18982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017467	TCAT	2	8	23103	23110	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017467	AAGA	2	8	26118	26125	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017467	AAGG	2	8	26252	26259	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017467	AAAC	2	8	26757	26764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017467	AATT	2	8	26812	26819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017467	CAAA	2	8	27397	27404	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017467	GTTT	2	8	29192	29199	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017467	GAAA	2	8	29215	29222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017467	ATTT	2	8	31606	31613	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017467	TTAA	2	8	32487	32494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017467	AATT	2	8	36848	36855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017467	TTAG	2	8	38658	38665	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017467	TTTA	2	8	39901	39908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017467	TTTA	2	8	41418	41425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017467	TTAA	2	8	41564	41571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017467	AAAC	2	8	41677	41684	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017467	CTTT	2	8	41827	41834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017467	ATTT	2	8	44000	44007	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017467	TTCT	2	8	45661	45668	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017467	TTTG	2	8	45796	45803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017467	TTCA	2	8	46026	46033	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017467	AAAG	2	8	46345	46352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017467	ACTA	2	8	46540	46547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017467	AAAG	2	8	48157	48164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017467	GAAA	2	8	49030	49037	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017467	AATA	2	8	49224	49231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017467	TCAA	2	8	49711	49718	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017467	TTTC	2	8	49977	49984	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017467	CCAA	2	8	50143	50150	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017467	CTGC	2	8	50282	50289	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017467	CAGA	2	8	50294	50301	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017467	TCTT	2	8	51793	51800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017467	AAGA	2	8	51971	51978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017467	ATTA	2	8	52048	52055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017467	ATGC	2	8	52062	52069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017467	TGGA	2	8	52252	52259	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017467	ATTA	2	8	52491	52498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017467	ATCA	2	8	52693	52700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017467	GATA	2	8	54651	54658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017467	TAAA	2	8	62081	62088	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017467	TTTG	2	8	62168	62175	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017467	GATT	2	8	65072	65079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017467	CTTT	2	8	65109	65116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017467	TTGA	2	8	65127	65134	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017467	TAGA	2	8	66306	66313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017467	TTGC	2	8	66398	66405	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017467	TAAA	2	8	66555	66562	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017467	AATT	2	8	68144	68151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017467	ATGA	2	8	69354	69361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017467	ATGC	2	8	69415	69422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017467	GAAA	2	8	71453	71460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017467	GAAA	2	8	71484	71491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017467	TAAT	2	8	74517	74524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017467	TCTT	2	8	74709	74716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017467	ATAA	2	8	76428	76435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017467	ATGA	2	8	76500	76507	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017467	TGCA	2	8	77197	77204	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017467	TTTG	2	8	77211	77218	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017467	GGAA	2	8	84283	84290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017467	GCAA	2	8	85045	85052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017467	CGAG	2	8	85172	85179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017467	GTGA	2	8	85535	85542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017467	AGCG	2	8	85705	85712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017467	AAGC	2	8	86723	86730	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017467	ATAG	2	8	87034	87041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017467	TCAA	2	8	87042	87049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017467	AGAA	2	8	87093	87100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017467	GCGA	2	8	87122	87129	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017467	TAGG	2	8	89001	89008	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017467	CTGC	2	8	89940	89947	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017467	GAAG	2	8	90065	90072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017467	CTTC	2	8	90078	90085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017467	AAGG	2	8	90508	90515	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017467	AGTT	2	8	90974	90981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017467	AATT	2	8	91531	91538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017467	ACTA	3	12	92170	92181	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_017467	GAAA	2	8	92224	92231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017467	ATTT	2	8	98774	98781	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017467	GACT	2	8	101896	101903	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017467	TATT	2	8	102050	102057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017467	GATG	2	8	102203	102210	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017467	AAAT	2	8	102341	102348	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017467	AATC	2	8	103144	103151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017467	CTTT	2	8	104021	104028	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017467	TGAA	2	8	104044	104051	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017467	GTTA	2	8	111279	111286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017467	TTTG	2	8	114431	114438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017467	AGGA	2	8	114670	114677	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017467	GTTT	2	8	119736	119743	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017467	TAAG	2	8	123740	123747	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017467	TTAA	2	8	124341	124348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017467	GTTT	2	8	124415	124422	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017467	TTAT	2	8	124526	124533	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017467	ATTT	2	8	124723	124730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017467	ATTA	2	8	125107	125114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017467	CAAT	2	8	125139	125146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017467	AAGA	2	8	125338	125345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017467	AATC	2	8	125716	125723	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017467	GGCA	2	8	125829	125836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017467	AGTT	2	8	125935	125942	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017467	ACTT	2	8	130751	130758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017467	TAAA	2	8	141634	141641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017467	TTTA	2	8	141653	141660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017467	TTTA	2	8	142759	142766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017467	ATAG	2	8	142826	142833	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017467	TAAT	2	8	144457	144464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017467	TAGT	2	8	156361	156368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017467	TAGT	2	8	156370	156377	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017467	AAAG	2	8	156385	156392	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017467	TATT	2	8	156540	156547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017467	AAGA	2	8	156548	156555	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017467	TTTA	2	8	164222	164229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017467	ATGA	2	8	170519	170526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017467	TAGG	2	8	174032	174039	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017467	ATCA	2	8	175803	175810	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017467	TTTA	2	8	176011	176018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017467	TGCT	2	8	179261	179268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017467	AAAT	2	8	181397	181404	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017467	ACAT	2	8	182245	182252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017467	AAAT	2	8	183530	183537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017467	TAAA	2	8	183953	183960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017467	AATT	2	8	184010	184017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017467	GTAA	2	8	184139	184146	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017467	CTAA	2	8	185686	185693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017467	TTGA	2	8	192355	192362	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017467	AAGC	2	8	192712	192719	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017467	GCAT	2	8	193033	193040	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017467	TCAT	2	8	193105	193112	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017467	TCAT	2	8	194713	194720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017467	TAAA	2	8	199917	199924	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017467	TAAC	2	8	207557	207564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017467	GTGG	2	8	207693	207700	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017467	AAAT	2	8	209055	209062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017467	AATA	2	8	209264	209271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017467	TCAA	2	8	209604	209611	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017467	AATG	2	8	209918	209925	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017467	TTGA	2	8	210027	210034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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