MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017465	GCT	2	6	125662	125667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_017465	AGA	2	6	125724	125729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017465	AATTT	2	10	125769	125778	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_017465	GA	3	6	125814	125819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_017465	TGT	2	6	125848	125853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017465	GTT	2	6	125933	125938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017465	TTCGT	2	10	126214	126223	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1008	NC_017465	TGT	2	6	126317	126322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017465	CTT	2	6	126384	126389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_017465	AAT	2	6	126494	126499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017465	AGT	2	6	126632	126637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017465	GTT	2	6	126660	126665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017465	TTA	2	6	126667	126672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017465	TGACGG	2	12	127978	127989	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1015	NC_017465	GAT	2	6	128001	128006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017465	TGA	2	6	128024	128029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017465	GTA	2	6	128036	128041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017465	GTG	2	6	128056	128061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017465	A	6	6	128114	128119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_017465	GAA	2	6	128160	128165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017465	ATT	2	6	128227	128232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017465	ATG	2	6	128243	128248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_017465	ATC	2	6	128312	128317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_017465	AGGGG	2	10	128469	128478	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_017465	TGA	2	6	128549	128554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_017465	TTA	2	6	128563	128568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017465	GCC	2	6	128589	128594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_017465	AAC	2	6	128636	128641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_017465	GAT	2	6	128643	128648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017465	TTG	2	6	128665	128670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017465	ATT	2	6	129514	129519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_017465	TAC	2	6	129531	129536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017465	ACA	2	6	129545	129550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017465	CCT	2	6	129556	129561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_017465	TAGTT	2	10	129588	129597	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_017465	AGGTG	2	10	129658	129667	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017465	GGC	2	6	129686	129691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_017465	ATG	2	6	129729	129734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017465	G	6	6	129863	129868	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017465	CCG	2	6	129943	129948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_017465	AGGT	2	8	129965	129972	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017465	TCA	2	6	129980	129985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_017465	A	6	6	129985	129990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_017465	ATC	2	6	130078	130083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_017465	TCT	2	6	130109	130114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_017465	AAGGT	2	10	130193	130202	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017465	CAT	2	6	130218	130223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017465	GTC	2	6	130285	130290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_017465	TGA	2	6	130302	130307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017465	TGA	2	6	130343	130348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017465	GGT	2	6	130388	130393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017465	CAA	2	6	130431	130436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_017465	TTA	2	6	130456	130461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_017465	AAC	2	6	130488	130493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_017465	TC	3	6	130541	130546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_017465	TCA	2	6	130558	130563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_017465	GTG	2	6	130596	130601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017465	AAT	2	6	130701	130706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017465	TTG	2	6	130728	130733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_017465	CAC	2	6	130760	130765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_017465	TCC	2	6	130832	130837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_017465	ATTA	2	8	130865	130872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017465	TAAA	2	8	130905	130912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017465	A	6	6	130910	130915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017465	AGG	2	6	130936	130941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017465	TGA	2	6	130992	130997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017465	CTT	2	6	131001	131006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_017465	AGG	2	6	131024	131029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_017465	AGG	2	6	131100	131105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_017465	GCCG	2	8	131137	131144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_017465	CAG	2	6	131169	131174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_017465	CGT	2	6	131247	131252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017465	AAG	2	6	131315	131320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_017465	ACC	2	6	131400	131405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_017465	TTGG	2	8	131453	131460	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_017465	CCT	2	6	131471	131476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_017465	GGCA	2	8	131483	131490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_017465	TGA	2	6	131677	131682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_017465	TGA	2	6	131817	131822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_017465	CTC	2	6	131869	131874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_017465	CGA	2	6	131944	131949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_017465	GCG	2	6	132007	132012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_017465	CGA	2	6	132187	132192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017465	CAA	2	6	132212	132217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_017465	GTC	2	6	132224	132229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_017465	GCC	2	6	132281	132286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1088	NC_017465	TAA	2	6	132347	132352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_017465	CCT	2	6	132370	132375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_017465	ATT	2	6	132514	132519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_017465	CGGG	2	8	132561	132568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_017465	AGA	2	6	132569	132574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_017465	T	6	6	132583	132588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_017465	ATT	2	6	132604	132609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_017465	GAT	2	6	132654	132659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1097	NC_017465	TTG	2	6	132766	132771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_017465	TGG	2	6	132796	132801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_017465	GAAA	2	8	135144	135151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_017465	ATT	2	6	135168	135173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_017465	GGA	2	6	135177	135182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_017465	ATCAA	2	10	135202	135211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_017465	TGTC	2	8	135261	135268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_017465	CTT	2	6	135335	135340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_017465	TCT	2	6	135355	135360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_017465	G	7	7	135363	135369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017465	CTT	3	9	135434	135442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_017465	GGC	2	6	136374	136379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_017465	GGC	2	6	136419	136424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_017465	TGG	2	6	136442	136447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017465	GA	3	6	136502	136507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_017465	T	6	6	136511	136516	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_017465	ATG	2	6	136557	136562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_017465	AAG	2	6	136565	136570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_017465	AAG	2	6	136730	136735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017465	CGGTA	2	10	136781	136790	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1117	NC_017465	TGG	2	6	136828	136833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017465	TCA	2	6	136857	136862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_017465	TG	3	6	136872	136877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017465	CCA	2	6	136892	136897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_017465	CCTA	2	8	136925	136932	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_017465	ATT	2	6	136975	136980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017465	TAG	2	6	136989	136994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_017465	TTA	2	6	137080	137085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_017465	TGA	2	6	137207	137212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_017465	CTTA	2	8	137219	137226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_017465	CG	3	6	137243	137248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_017465	GAC	2	6	137251	137256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_017465	AGG	2	6	137273	137278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017465	GGC	2	6	137340	137345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_017465	GGA	2	6	137361	137366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017465	TCAAA	2	10	137367	137376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1390	NC_017465	G	6	6	165355	165360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1391	NC_017465	GTG	2	6	165376	165381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1395	NC_017465	AGC	2	6	165488	165493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1396	NC_017465	CCA	3	9	165494	165502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1397	NC_017465	AATTT	2	10	165533	165542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1398	NC_017465	AGG	2	6	165588	165593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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