MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017465	GCT	2	6	54727	54732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017465	G	6	6	54762	54767	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017465	CCG	2	6	54780	54785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_017465	GGT	2	6	54834	54839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017465	GAA	2	6	54868	54873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017465	TAG	2	6	54911	54916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017465	TCT	2	6	55013	55018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017465	CCA	2	6	55026	55031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_017465	TGG	2	6	55178	55183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017465	AAC	2	6	56000	56005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017465	GTA	2	6	56030	56035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017465	AGT	2	6	56090	56095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017465	T	7	7	57419	57425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017465	T	6	6	57466	57471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017465	ATT	2	6	57488	57493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017465	CCA	2	6	57500	57505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_017465	AAGTT	2	10	57560	57569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017465	GT	3	6	57582	57587	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017465	AAC	2	6	57663	57668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017465	ATT	2	6	57675	57680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017465	AGG	2	6	57682	57687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017465	T	6	6	59143	59148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017465	GGC	2	6	59200	59205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017465	GCCCC	2	10	59222	59231	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
525	NC_017465	ATA	2	6	59245	59250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017465	GCC	2	6	59306	59311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_017465	G	6	6	59323	59328	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017465	ATT	2	6	59424	59429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017465	AAC	2	6	59518	59523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017465	TGA	2	6	59573	59578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017465	CCA	2	6	59582	59587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_017465	ACC	2	6	59593	59598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_017465	GAC	2	6	59667	59672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_017465	GGC	2	6	59699	59704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_017465	GGCC	2	8	59727	59734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_017465	GAA	2	6	59853	59858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017465	TAAA	2	8	59894	59901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017465	AGG	2	6	60005	60010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017465	CAAG	2	8	60060	60067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_017465	ACCA	2	8	60110	60117	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_017465	TAC	2	6	60142	60147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_017465	ACC	2	6	60285	60290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_017465	CGC	2	6	60293	60298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_017465	G	6	6	60300	60305	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017465	ATG	2	6	60312	60317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017465	GCG	3	9	60350	60358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_017465	ACG	2	6	60424	60429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_017465	CGC	2	6	60471	60476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_017465	GGC	2	6	60489	60494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017465	AAG	2	6	60524	60529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017465	CTT	2	6	60561	60566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017465	GAC	2	6	60607	60612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_017465	GGT	2	6	60621	60626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017465	CGGC	2	8	60672	60679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
555	NC_017465	ACC	2	6	60817	60822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_017465	CGC	2	6	60992	60997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_017465	GAA	2	6	61008	61013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017465	GAT	2	6	61025	61030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017465	CGA	2	6	61115	61120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_017465	CTG	2	6	61122	61127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_017465	GTG	2	6	61194	61199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017465	GCC	2	6	61245	61250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_017465	TAA	2	6	61377	61382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017465	AG	3	6	61432	61437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017465	CCG	2	6	61443	61448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_017465	AAG	2	6	61527	61532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017465	CTT	2	6	61585	61590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_017465	TTA	2	6	61691	61696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017465	GGT	2	6	61708	61713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017465	CTG	2	6	61763	61768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017465	GTGG	2	8	61832	61839	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017465	TAAT	2	8	61878	61885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017465	GGAT	2	8	61917	61924	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017465	TGTT	2	8	61957	61964	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017465	AT	3	6	61986	61991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017465	CTT	2	6	62002	62007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_017465	GAT	2	6	62089	62094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017465	A	7	7	62100	62106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017465	TGTCAT	2	12	62220	62231	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
580	NC_017465	TTG	2	6	62286	62291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017465	GTG	2	6	62305	62310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017465	T	6	6	62325	62330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017465	A	7	7	62345	62351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017465	CCA	2	6	62356	62361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
585	NC_017465	ACGG	2	8	63588	63595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
586	NC_017465	A	6	6	63665	63670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017465	GGC	2	6	63671	63676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017465	GCC	3	9	63694	63702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_017465	TATT	2	8	64048	64055	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017465	CGA	2	6	64202	64207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_017465	C	6	6	64256	64261	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
592	NC_017465	CCAAA	2	10	64282	64291	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
593	NC_017465	GGT	2	6	64293	64298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017465	T	6	6	64378	64383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017465	ATT	3	9	64395	64403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017465	CCT	2	6	64433	64438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_017465	CGC	2	6	64472	64477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_017465	CAA	2	6	64484	64489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_017465	AGGA	2	8	64554	64561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017465	CGA	2	6	64562	64567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017465	ATA	2	6	64589	64594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017465	GGTTT	2	10	66262	66271	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017465	TTA	2	6	66286	66291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017465	T	6	6	66303	66308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017465	CAC	2	6	66314	66319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
606	NC_017465	GGCCT	2	10	66351	66360	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
607	NC_017465	AAC	2	6	66390	66395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017465	GGGT	2	8	66463	66470	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017465	CGA	2	6	66485	66490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017465	TAC	2	6	66552	66557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_017465	CGGG	2	8	66561	66568	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017465	CTA	2	6	66623	66628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017465	CTT	2	6	66698	66703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017465	CTT	3	9	66728	66736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017465	CTT	2	6	66773	66778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_017465	CCGG	2	8	66785	66792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_017465	TGGC	2	8	66847	66854	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_017465	GCGG	2	8	66858	66865	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
619	NC_017465	GAC	2	6	66868	66873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_017465	AG	3	6	67737	67742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017465	TGG	2	6	67751	67756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017465	TAGT	2	8	67806	67813	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017465	GAG	2	6	67857	67862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017465	GGT	2	6	67889	67894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017465	GGT	2	6	67905	67910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017465	T	7	7	67954	67960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017465	GA	3	6	67977	67982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017465	A	6	6	67990	67995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017465	GAA	2	6	68016	68021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017465	CGT	2	6	68043	68048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_017465	GGTT	2	8	68071	68078	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017465	G	7	7	70058	70064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017465	GGC	2	6	70110	70115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_017465	TTTGG	2	10	70132	70141	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017465	GGT	2	6	70154	70159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017465	CGG	2	6	70249	70254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017465	CTT	2	6	70286	70291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_017465	CAAGTC	2	12	70299	70310	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_017465	CTA	2	6	70363	70368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_017465	CAT	2	6	70376	70381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_017465	ATTG	2	8	70448	70455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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643	NC_017465	TTG	2	6	70569	70574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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