MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 18237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017465	CGC	2	6	608065	608070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5002	NC_017465	GGC	2	6	608111	608116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_017465	GCC	3	9	608180	608188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5004	NC_017465	GGT	2	6	608221	608226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_017465	GTG	2	6	608303	608308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_017465	ACG	2	6	608396	608401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_017465	CT	3	6	608447	608452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_017465	ACC	2	6	608469	608474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_017465	ACC	2	6	608498	608503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_017465	CTGGC	2	10	608534	608543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5011	NC_017465	GAC	2	6	613182	613187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_017465	ACC	2	6	613232	613237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_017465	TGG	2	6	613269	613274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_017465	GGT	2	6	613339	613344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_017465	GAA	2	6	613346	613351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_017465	GGA	2	6	613369	613374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_017465	ACATCG	2	12	613380	613391	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_017465	GCC	2	6	613435	613440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_017465	ACC	2	6	613460	613465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_017465	CGGGC	2	10	613466	613475	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5021	NC_017465	GCG	2	6	613481	613486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_017465	GGAT	2	8	613518	613525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_017465	ACT	2	6	613532	613537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_017465	AAG	2	6	613593	613598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_017465	GGC	2	6	613696	613701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_017465	TGA	2	6	613747	613752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_017465	TGA	2	6	613762	613767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_017465	CTC	2	6	613781	613786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_017465	GAT	2	6	613792	613797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_017465	GCC	2	6	613838	613843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_017465	CCT	2	6	613891	613896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_017465	GTG	2	6	613934	613939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_017465	AGG	2	6	613980	613985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_017465	CATGAC	2	12	613994	614005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_017465	ACC	2	6	614055	614060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_017465	TCG	2	6	614107	614112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_017465	GGC	2	6	614169	614174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_017465	GAA	2	6	614875	614880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_017465	A	6	6	614900	614905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_017465	ATT	2	6	615018	615023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_017465	TGA	2	6	615034	615039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_017465	CTT	2	6	615053	615058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_017465	GTG	2	6	615132	615137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_017465	CCG	2	6	615235	615240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_017465	CAA	2	6	615320	615325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_017465	GCT	2	6	615333	615338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_017465	GAA	3	9	615345	615353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_017465	GAC	2	6	615384	615389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_017465	AGT	2	6	615415	615420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_017465	CAG	2	6	615429	615434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_017465	GAC	2	6	615840	615845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_017465	GAC	2	6	615912	615917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_017465	TAA	2	6	615926	615931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_017465	CAC	2	6	615957	615962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_017465	ACG	2	6	615967	615972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_017465	AGG	2	6	616075	616080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_017465	ACG	2	6	616140	616145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_017465	TGG	2	6	616159	616164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_017465	GCC	2	6	616179	616184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_017465	CGC	3	9	616193	616201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_017465	GCGGG	2	10	616285	616294	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5062	NC_017465	TTA	2	6	616302	616307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_017465	CTGA	2	8	616335	616342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5064	NC_017465	CGT	2	6	616358	616363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_017465	CGT	2	6	616388	616393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_017465	CAA	2	6	616413	616418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_017465	CCA	2	6	616484	616489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5068	NC_017465	CTGG	2	8	618664	618671	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_017465	AGA	2	6	618685	618690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_017465	GTCCG	2	10	618739	618748	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5071	NC_017465	T	6	6	618759	618764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_017465	AAC	2	6	618785	618790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_017465	G	6	6	618820	618825	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_017465	AACG	2	8	618830	618837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_017465	TCT	2	6	618861	618866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_017465	AGA	2	6	618886	618891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_017465	CGC	2	6	619054	619059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_017465	GTTCA	2	10	619067	619076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5079	NC_017465	ATC	2	6	619079	619084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_017465	AGG	2	6	621796	621801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_017465	TGAG	2	8	621810	621817	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_017465	TGA	2	6	621856	621861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_017465	GAA	2	6	621872	621877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_017465	GAA	2	6	621950	621955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_017465	ACG	2	6	621957	621962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_017465	AGG	2	6	621963	621968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_017465	GCCTTT	2	12	621980	621991	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_017465	GAA	2	6	621992	621997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_017465	AGA	3	9	622006	622014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_017465	GGA	2	6	622130	622135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_017465	AGT	2	6	622189	622194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_017465	GGC	2	6	622327	622332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_017465	CGA	2	6	622425	622430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_017465	GTG	2	6	622486	622491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_017465	AAT	2	6	622518	622523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_017465	TCAA	2	8	622553	622560	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5097	NC_017465	TGG	2	6	622575	622580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_017465	AGGT	2	8	622688	622695	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_017465	T	6	6	622753	622758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_017465	CGG	2	6	622800	622805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_017465	GCC	2	6	622817	622822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_017465	GTG	2	6	622823	622828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_017465	GACC	2	8	622873	622880	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_017465	CGG	2	6	622893	622898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_017465	AGCC	2	8	622902	622909	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_017465	CGT	2	6	622941	622946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_017465	GGC	2	6	622960	622965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_017465	TTGG	2	8	622969	622976	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_017465	CCGG	2	8	623058	623065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_017465	T	6	6	624085	624090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_017465	GAAAA	2	10	624103	624112	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_017465	CTCG	2	8	624178	624185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_017465	AAG	2	6	624316	624321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_017465	GGT	2	6	624402	624407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_017465	GTG	2	6	624457	624462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_017465	GCCAAG	2	12	624610	624621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_017465	GGC	3	9	624624	624632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_017465	CAC	2	6	627057	627062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_017465	GCC	2	6	627074	627079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_017465	GAC	2	6	627134	627139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_017465	TTG	2	6	627149	627154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_017465	GGC	2	6	627157	627162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_017465	GGGC	2	8	627422	627429	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5124	NC_017465	CCA	2	6	627457	627462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5125	NC_017465	TCG	2	6	627489	627494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_017465	GCC	2	6	627515	627520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_017465	T	6	6	628922	628927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_017465	GAT	2	6	628946	628951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_017465	ACGGCG	2	12	628968	628979	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_017465	GCG	2	6	629001	629006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_017465	GGC	2	6	629049	629054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5133	NC_017465	CCA	2	6	629097	629102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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