MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferrooxidans C2-3

Total Repeats: 263

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017094	CCTGA	2	10	2612	2621	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017094	GATTG	2	10	17384	17393	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017094	AAAAC	2	10	20993	21002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017094	GGGAA	2	10	32911	32920	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017094	CATAT	2	10	32996	33005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017094	GTATC	2	10	55545	55554	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017094	GAAGG	2	10	66500	66509	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017094	ATCGT	2	10	77014	77023	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017094	CTTTT	2	10	79658	79667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017094	TTTCC	2	10	80065	80074	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017094	AATTC	2	10	84315	84324	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017094	CTCTT	2	10	100077	100086	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017094	CCTTT	2	10	101990	101999	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017094	GAATC	2	10	105546	105555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017094	GGTCC	2	10	111586	111595	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017094	ATTTT	2	10	115558	115567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017094	GTTTT	2	10	124913	124922	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017094	GATGG	2	10	128305	128314	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017094	TTTTC	2	10	131957	131966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017094	CCTTG	2	10	134862	134871	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017094	CCTTC	2	10	147111	147120	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017094	TGTCC	2	10	167882	167891	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017094	TGTTC	2	10	171120	171129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017094	TTCCC	2	10	171318	171327	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017094	TCCGG	2	10	184918	184927	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017094	ATGGA	2	10	209746	209755	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017094	CTGTT	2	10	211579	211588	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017094	GTCAG	2	10	220529	220538	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017094	TATAG	2	10	225819	225828	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017094	CTATA	2	10	225833	225842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017094	ATGAA	2	10	227945	227954	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017094	CAGGA	2	10	269697	269706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017094	CTGCT	2	10	289230	289239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017094	TTTCC	2	10	290885	290894	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017094	AGGCT	2	10	290990	290999	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017094	GCCAG	2	10	291070	291079	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017094	GAAAA	2	10	307641	307650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017094	CGACC	2	10	326056	326065	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017094	TTTTC	2	10	331030	331039	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017094	GCCAA	2	10	338613	338622	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_017094	TTTGA	2	10	349017	349026	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017094	GTGTC	2	10	354387	354396	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017094	AAAAT	2	10	356365	356374	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017094	GATTT	2	10	368542	368551	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017094	CTCTT	2	10	374706	374715	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017094	GTTTT	2	10	384818	384827	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017094	AGAAA	2	10	392998	393007	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017094	GAAGG	2	10	399837	399846	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017094	TGTGG	2	10	406148	406157	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017094	ATTTT	2	10	413045	413054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017094	TGATT	2	10	413179	413188	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017094	GAAAG	2	10	414997	415006	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017094	GAAAT	2	10	450559	450568	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017094	TAAAA	2	10	450822	450831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017094	CTTTC	2	10	457574	457583	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017094	TGTTT	2	10	459832	459841	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017094	ACTTG	2	10	481471	481480	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017094	TTTTG	2	10	513747	513756	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017094	TTCCA	2	10	520843	520852	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017094	AGGGG	2	10	521433	521442	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017094	CAACA	2	10	522842	522851	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_017094	GGGTT	2	10	525120	525129	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017094	CACAA	2	10	583946	583955	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017094	TCACC	2	10	596317	596326	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017094	ATTCC	2	10	612332	612341	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017094	GAAAA	2	10	612362	612371	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017094	AAATC	2	10	618213	618222	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017094	ATGAC	2	10	618323	618332	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017094	ATGGC	2	10	632882	632891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017094	CGAGT	2	10	648103	648112	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017094	TTTTC	2	10	655790	655799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017094	TCTCC	2	10	672855	672864	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_017094	ATCGG	2	10	679743	679752	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017094	TTGTT	2	10	681202	681211	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017094	GAAAA	2	10	699155	699164	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017094	CTGTT	2	10	705873	705882	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017094	CTGGA	2	10	709633	709642	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017094	GAATC	2	10	709699	709708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017094	CTGGA	2	10	709759	709768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017094	GAATC	2	10	709825	709834	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017094	CTGGA	2	10	709885	709894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017094	CTGGA	2	10	710137	710146	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017094	CTGGA	2	10	710263	710272	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017094	CTGGA	2	10	710389	710398	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017094	CTGGA	2	10	710515	710524	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017094	TAGAA	2	10	711439	711448	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017094	AAGAC	2	10	716557	716566	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017094	GACAA	2	10	721271	721280	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017094	TTTAT	2	10	722000	722009	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017094	ATTAT	2	10	743063	743072	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017094	GATAT	2	10	748583	748592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017094	GGAGG	2	10	748621	748630	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017094	TGGAA	2	10	752725	752734	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017094	TTGTT	2	10	752953	752962	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017094	TTTTG	2	10	755610	755619	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017094	TATTT	2	10	765922	765931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017094	ATTCG	2	10	766033	766042	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017094	CAGAT	2	10	801148	801157	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017094	TGGGT	2	10	828798	828807	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017094	GTTTT	2	10	830285	830294	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017094	ATACA	2	10	830327	830336	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017094	ATCAT	2	10	834447	834456	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017094	CTTTT	2	10	834482	834491	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017094	TGCTT	2	10	834657	834666	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017094	CTTTC	2	10	849105	849114	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017094	GAGGT	2	10	910958	910967	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017094	GTTTT	2	10	924308	924317	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017094	ATTGG	2	10	932717	932726	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017094	GTGTG	2	10	980207	980216	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017094	AAGGG	2	10	981991	982000	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017094	GAAGG	2	10	1056660	1056669	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017094	AGGAA	2	10	1060412	1060421	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017094	CGAAG	2	10	1061342	1061351	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017094	CGGGA	2	10	1063386	1063395	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017094	AAGAT	2	10	1063432	1063441	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017094	CTTTC	2	10	1063867	1063876	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_017094	AGGAA	2	10	1069021	1069030	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017094	CGAAG	2	10	1069951	1069960	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017094	CGGGA	2	10	1071995	1072004	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017094	AAGAT	2	10	1072041	1072050	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017094	CCATC	2	10	1072472	1072481	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017094	TGTTT	2	10	1076608	1076617	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017094	AGGGA	2	10	1107501	1107510	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017094	ATTGA	2	10	1112587	1112596	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017094	TTTTA	2	10	1112626	1112635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017094	ATACT	2	10	1120546	1120555	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017094	CAGGG	2	10	1125517	1125526	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017094	TGACT	2	10	1127881	1127890	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017094	CGGCC	2	10	1132699	1132708	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_017094	ATCAG	2	10	1133096	1133105	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017094	CCGGA	2	10	1152573	1152582	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_017094	ATGGT	2	10	1167448	1167457	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017094	GTCCG	2	10	1171641	1171650	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017094	ACCAA	2	10	1192323	1192332	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_017094	TTTCA	2	10	1195185	1195194	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017094	CTCTG	2	10	1199876	1199885	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017094	GCACT	2	10	1201947	1201956	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017094	AGGAA	2	10	1215855	1215864	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017094	CGAAG	2	10	1216785	1216794	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017094	CGGGA	2	10	1218829	1218838	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017094	AAGAT	2	10	1218875	1218884	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017094	ATCTG	2	10	1236883	1236892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017094	CCCTT	2	10	1239959	1239968	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
144	NC_017094	ATTTA	2	10	1265531	1265540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017094	TCCCC	2	10	1266855	1266864	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
146	NC_017094	GACAG	2	10	1270944	1270953	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017094	CCCTC	2	10	1277142	1277151	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
148	NC_017094	AATTA	2	10	1286761	1286770	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017094	TGTGA	2	10	1294491	1294500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017094	TTTCC	2	10	1299101	1299110	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_017094	TTCCC	2	10	1311430	1311439	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
152	NC_017094	AATGG	2	10	1315218	1315227	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017094	CAAAA	2	10	1315319	1315328	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_017094	TCAGG	2	10	1395574	1395583	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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172	NC_017094	TTCCA	2	10	1552316	1552325	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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177	NC_017094	TGCCC	2	10	1585026	1585035	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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179	NC_017094	ATTTT	2	10	1589491	1589500	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017094	ACCCC	2	10	1606575	1606584	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
184	NC_017094	TTGCC	2	10	1616696	1616705	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_017094	TCTCT	2	10	2507610	2507619	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_017094	GATCA	2	10	2514725	2514734	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017094	GACAG	2	10	2534656	2534665	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.