MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila ATCC 43290 chromosome

Total Repeats: 473

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016811	ACTTA	2	10	6332	6341	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016811	CTTTC	2	10	10661	10670	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016811	CCTAT	2	10	26401	26410	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016811	ATAAA	2	10	29722	29731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016811	GTTAA	2	10	44063	44072	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016811	TGATT	2	10	50600	50609	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016811	CTTTT	2	10	59257	59266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016811	ATCTT	2	10	70751	70760	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016811	ATATA	2	10	78200	78209	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016811	ATTAG	2	10	118625	118634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016811	TTGTA	2	10	119326	119335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016811	TCAAC	2	10	122789	122798	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016811	GATTT	2	10	123010	123019	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016811	GATAA	2	10	123179	123188	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016811	ATATA	2	10	136299	136308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016811	GTTTA	2	10	137645	137654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016811	GATTA	2	10	137748	137757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016811	TTGAT	2	10	146249	146258	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016811	CAAAT	2	10	155074	155083	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016811	CAAGA	2	10	177409	177418	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016811	TGACC	2	10	179067	179076	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016811	AATCT	2	10	179093	179102	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016811	AATTA	2	10	183705	183714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016811	TGAAA	2	10	193732	193741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016811	ATTGA	2	10	194061	194070	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016811	GTTTG	2	10	199683	199692	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016811	AGTAA	2	10	209275	209284	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016811	ATTAA	2	10	213624	213633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016811	TACTT	2	10	226351	226360	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016811	AAATT	2	10	227759	227768	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016811	CTGAT	2	10	227882	227891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016811	ATCTA	2	10	231622	231631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016811	TAGAG	2	10	233164	233173	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016811	AGTAT	2	10	269007	269016	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016811	TAAAA	2	10	274751	274760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016811	TAAAT	2	10	281462	281471	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016811	AGATG	2	10	284219	284228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016811	GCGTT	2	10	284426	284435	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016811	AAAAT	2	10	289133	289142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016811	TATCG	2	10	302817	302826	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016811	CCAAA	2	10	346126	346135	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016811	TTTCA	2	10	349937	349946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016811	TCGTG	2	10	365084	365093	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016811	TTTTA	2	10	368993	369002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016811	TAAAT	2	10	369059	369068	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016811	ATTTT	2	10	397619	397628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016811	ACAGC	2	10	402619	402628	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016811	TAAGT	2	10	408651	408660	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016811	AATAT	2	10	411580	411589	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016811	TTCTT	2	10	412678	412687	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016811	ATTAT	2	10	416024	416033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016811	TAAGA	2	10	417388	417397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016811	TCAAT	2	10	427572	427581	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016811	TTAAA	2	10	437176	437185	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016811	CTTTT	2	10	438821	438830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016811	TGAAA	2	10	449082	449091	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016811	CTTTG	2	10	451876	451885	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016811	AAATA	2	10	453100	453109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016811	CATTT	2	10	457662	457671	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016811	GTAGA	2	10	465024	465033	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016811	ATTCT	2	10	466542	466551	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016811	TTTTG	2	10	470619	470628	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016811	TTTAT	2	10	477023	477032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016811	CTTCT	2	10	481131	481140	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016811	ATTTC	2	10	484242	484251	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016811	AATTT	2	10	496613	496622	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016811	ATTAA	2	10	521642	521651	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016811	AAGTT	2	10	531375	531384	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016811	ACCAT	2	10	560527	560536	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_016811	AAATT	2	10	561751	561760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016811	AATAT	2	10	579409	579418	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016811	TAATG	2	10	584911	584920	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016811	TTTTG	2	10	585627	585636	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016811	TTTTG	2	10	585802	585811	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016811	ATTTT	2	10	596145	596154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016811	TTATG	2	10	598451	598460	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016811	AATGA	2	10	601941	601950	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016811	CGTTT	2	10	606181	606190	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016811	AGATA	2	10	606281	606290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016811	TCGTG	2	10	613444	613453	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016811	AAAAT	2	10	619456	619465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016811	ATTAA	2	10	624622	624631	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016811	GCGAT	2	10	630250	630259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016811	GCAAA	2	10	647895	647904	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016811	GAAAG	2	10	651389	651398	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016811	TACAT	2	10	656774	656783	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016811	TATCA	2	10	663786	663795	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016811	ATTTG	2	10	664397	664406	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016811	TAAAC	2	10	678122	678131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016811	CAAAT	2	10	689843	689852	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016811	TTTTC	2	10	705997	706006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_016811	AGAAC	2	10	708701	708710	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016811	TTTAA	2	10	740353	740362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016811	TGGTA	2	10	748918	748927	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016811	GTTTA	2	10	757311	757320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016811	TAAAA	2	10	777448	777457	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016811	AATTG	2	10	794863	794872	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016811	TCCTT	2	10	795414	795423	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016811	TTGCA	2	10	798162	798171	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016811	GTGAT	2	10	799565	799574	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016811	ATTAG	2	10	810149	810158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016811	ATCTT	2	10	817291	817300	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016811	TAATA	2	10	818995	819004	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016811	TCAAT	2	10	836914	836923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016811	AAACT	2	10	838646	838655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_016811	ATGGT	2	10	896299	896308	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016811	CTACT	2	10	907204	907213	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_016811	ATCAA	2	10	915650	915659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016811	CTTTT	2	10	923657	923666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016811	TAAAT	2	10	948421	948430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016811	ATTGG	2	10	957967	957976	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016811	TTGTT	2	10	958089	958098	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016811	TTTAA	2	10	965289	965298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016811	TATTT	2	10	974447	974456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016811	CCATG	2	10	976756	976765	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016811	TATTT	2	10	976880	976889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016811	TCAAT	2	10	977019	977028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016811	ATTAT	2	10	977030	977039	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016811	TTTAT	2	10	985382	985391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016811	CCAGG	2	10	990506	990515	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016811	TGAGA	2	10	995651	995660	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016811	TGAGT	2	10	1014159	1014168	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016811	GAGAT	2	10	1015092	1015101	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016811	TGATT	2	10	1020966	1020975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016811	TTAAT	2	10	1026164	1026173	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016811	TTGGG	2	10	1034256	1034265	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016811	TTATA	2	10	1037921	1037930	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016811	ATCAT	2	10	1037977	1037986	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016811	TTTAA	2	10	1041375	1041384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016811	CTTTT	2	10	1044387	1044396	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016811	TAAAG	2	10	1045532	1045541	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016811	ACCAG	2	10	1049372	1049381	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016811	TTTTG	2	10	1050311	1050320	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016811	ATTTT	2	10	1058765	1058774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016811	ATTTT	2	10	1085863	1085872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016811	TTAAA	2	10	1085876	1085885	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016811	GTTTT	2	10	1091215	1091224	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016811	AATCA	2	10	1092007	1092016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016811	ATAAA	2	10	1092140	1092149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016811	GTTGT	2	10	1095764	1095773	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016811	TTAAA	2	10	1095851	1095860	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016811	GACAA	2	10	1098266	1098275	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_016811	AAATA	2	10	1100440	1100449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016811	GTTAT	2	10	1127454	1127463	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016811	TACCA	2	10	1133015	1133024	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_016811	TTTCT	2	10	1137750	1137759	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_016811	TGAGA	2	10	2028416	2028425	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_016811	TTAAT	2	10	2115330	2115339	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016811	AATTA	2	10	2115344	2115353	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_016811	TAAAG	2	10	2122270	2122279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016811	TTAAA	2	10	2128864	2128873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016811	TGAAT	2	10	2128919	2128928	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_016811	TGAAT	2	10	2132852	2132861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016811	TAAAA	2	10	2137473	2137482	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_016811	TTAAA	2	10	2149870	2149879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_016811	TTAAA	2	10	2155095	2155104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_016811	TTTTA	2	10	2172340	2172349	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_016811	TAAAT	2	10	2188165	2188174	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_016811	AATTC	2	10	2932985	2932994	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
408	NC_016811	ACACA	2	10	2938558	2938567	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
409	NC_016811	CGGTT	2	10	2939116	2939125	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
410	NC_016811	AAATG	2	10	2947448	2947457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_016811	TAAAA	2	10	2951000	2951009	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_016811	TAAAA	2	10	2973864	2973873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_016811	GATTC	2	10	2984571	2984580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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417	NC_016811	TATGA	2	10	3002400	3002409	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
418	NC_016811	TAATT	2	10	3006035	3006044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_016811	CATCT	2	10	3009058	3009067	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
420	NC_016811	TTTTA	2	10	3025020	3025029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_016811	CGCAT	2	10	3025519	3025528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
422	NC_016811	ATCAT	2	10	3028453	3028462	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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462	NC_016811	ATTTA	2	10	3289572	3289581	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_016811	TATTG	2	10	3324585	3324594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.