MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 11896

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016011	AG	3	6	226678	226683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_016011	AGT	2	6	226858	226863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_016011	ATT	2	6	227031	227036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016011	CTC	2	6	227103	227108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_016011	TTTG	2	8	227201	227208	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_016011	T	6	6	227209	227214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_016011	AGG	2	6	227263	227268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016011	CCA	2	6	227293	227298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_016011	ATTT	2	8	227300	227307	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_016011	TTA	2	6	227326	227331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016011	TGC	2	6	227356	227361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_016011	CGA	2	6	227371	227376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_016011	AGA	3	9	227405	227413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016011	CAA	2	6	227477	227482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_016011	TAATT	2	10	227493	227502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016011	ATTCAA	2	12	227555	227566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1017	NC_016011	AG	3	6	227579	227584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_016011	GGC	2	6	227611	227616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_016011	CGAA	2	8	227636	227643	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_016011	GGA	2	6	227645	227650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_016011	CCTG	2	8	227703	227710	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_016011	AGT	2	6	227757	227762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016011	TCA	2	6	227771	227776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_016011	GCA	2	6	227932	227937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_016011	CGC	2	6	227979	227984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_016011	GAA	2	6	227991	227996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_016011	TGT	2	6	228018	228023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_016011	AGA	2	6	228027	228032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_016011	CAG	2	6	228100	228105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_016011	GC	4	8	228156	228163	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_016011	AGA	2	6	228241	228246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_016011	GGA	2	6	228291	228296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_016011	CT	3	6	228316	228321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_016011	TGC	2	6	228436	228441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_016011	GAA	2	6	228555	228560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016011	GGT	2	6	228629	228634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_016011	GTC	2	6	228643	228648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_016011	TCGTG	2	10	228652	228661	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_016011	GGA	2	6	228754	228759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_016011	ATC	2	6	228778	228783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016011	AC	3	6	228805	228810	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_016011	ATGG	2	8	228819	228826	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_016011	AC	3	6	228974	228979	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_016011	CAC	2	6	228989	228994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_016011	AGCC	2	8	229037	229044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_016011	CCT	2	6	229116	229121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_016011	AAGGAA	2	12	229126	229137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_016011	TTC	2	6	229153	229158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_016011	TGTT	2	8	229161	229168	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_016011	TTC	2	6	229186	229191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_016011	TGTT	2	8	229199	229206	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_016011	ATC	2	6	229280	229285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_016011	ATC	2	6	229316	229321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_016011	AAC	2	6	229343	229348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_016011	GAA	2	6	229418	229423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_016011	GGA	2	6	229583	229588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016011	AGAA	2	8	229591	229598	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_016011	GCG	2	6	229617	229622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016011	AAG	2	6	229647	229652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_016011	CTT	2	6	229657	229662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_016011	AAAG	2	8	229694	229701	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_016011	CGG	2	6	229791	229796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_016011	GGA	2	6	229823	229828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016011	AGT	2	6	229944	229949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_016011	TTG	2	6	230008	230013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_016011	AAGGT	2	10	230121	230130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_016011	TACT	2	8	230133	230140	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_016011	CACG	2	8	230154	230161	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_016011	TC	3	6	230227	230232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_016011	ACC	2	6	230406	230411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_016011	AT	3	6	230427	230432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_016011	AGC	2	6	230486	230491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_016011	TGG	2	6	230647	230652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016011	AAG	2	6	230689	230694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_016011	TAGGCG	2	12	230781	230792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1076	NC_016011	ACA	2	6	230797	230802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016011	GGAA	2	8	230948	230955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016011	AGT	2	6	231008	231013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_016011	GAG	2	6	231046	231051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_016011	GA	3	6	231069	231074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_016011	GA	3	6	231148	231153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_016011	CGG	2	6	231306	231311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_016011	GA	3	6	231404	231409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_016011	TAGG	2	8	231522	231529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_016011	GAG	2	6	231558	231563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_016011	TGG	2	6	231568	231573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_016011	TAC	2	6	231576	231581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_016011	CCT	2	6	231664	231669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_016011	ATGG	2	8	231705	231712	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016011	GGT	2	6	231800	231805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_016011	TCG	2	6	231915	231920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_016011	CGT	2	6	231995	232000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_016011	GAG	2	6	232044	232049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_016011	AC	3	6	232079	232084	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_016011	GTT	2	6	232098	232103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016011	TG	3	6	232130	232135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_016011	C	6	6	232171	232176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1098	NC_016011	TTC	2	6	232196	232201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_016011	GAT	2	6	232222	232227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_016011	ATCG	2	8	232283	232290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1101	NC_016011	A	6	6	232302	232307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_016011	TCT	2	6	232336	232341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_016011	GA	3	6	232350	232355	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_016011	CAA	2	6	232365	232370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016011	T	7	7	232525	232531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_016011	ATAA	2	8	232542	232549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_016011	AGG	2	6	234663	234668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_016011	ACA	2	6	234671	234676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_016011	AG	3	6	237142	237147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016011	T	6	6	237173	237178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016011	TTAA	2	8	237218	237225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_016011	GAT	2	6	237243	237248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_016011	AAAT	2	8	238663	238670	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_016011	GA	3	6	238675	238680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_016011	ATA	2	6	238745	238750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016011	TATAAA	2	12	238764	238775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016011	A	7	7	240592	240598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_016011	AAT	2	6	240626	240631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016011	C	6	6	242113	242118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1120	NC_016011	TAT	2	6	242131	242136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_016011	G	6	6	242148	242153	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_016011	AT	3	6	242224	242229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016011	GAAT	2	8	242242	242249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016011	TAAAT	2	10	242252	242261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_016011	AG	3	6	242264	242269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_016011	ATT	2	6	242276	242281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_016011	T	7	7	243125	243131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016011	AAAT	2	8	243159	243166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_016011	T	8	8	243168	243175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_016011	GTG	2	6	243192	243197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_016011	TGTGG	2	10	243204	243213	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016011	TACT	2	8	243246	243253	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1133	NC_016011	ATT	2	6	243420	243425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_016011	TGT	2	6	243466	243471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_016011	TAA	3	9	243509	243517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_016011	GGA	2	6	243533	243538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016011	TG	3	6	243560	243565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_016011	T	6	6	310665	310670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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