MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	GAAC	2	8	61	68	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_015979	TAAA	2	8	1905	1912	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015979	AATC	2	8	2982	2989	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015979	AAAG	2	8	3105	3112	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015979	ATAA	2	8	3462	3469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015979	TTCC	2	8	3985	3992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015979	TAAA	2	8	5565	5572	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015979	TAAT	2	8	5660	5667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015979	GGAT	2	8	5699	5706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015979	TTAA	2	8	8856	8863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015979	ACTA	2	8	8946	8953	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015979	ATTT	2	8	9074	9081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015979	TATC	2	8	9092	9099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015979	ATTT	2	8	10801	10808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015979	GAAA	2	8	10941	10948	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015979	TAAG	2	8	10979	10986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015979	TAAT	2	8	11964	11971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015979	AGGA	2	8	14929	14936	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015979	CAAA	2	8	14971	14978	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015979	ATTT	2	8	16613	16620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015979	ATTT	2	8	18464	18471	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015979	TCAA	2	8	18677	18684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015979	GATG	2	8	26519	26526	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015979	CTTA	2	8	26539	26546	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_015979	CTTT	2	8	26598	26605	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015979	AGTC	2	8	28174	28181	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015979	AGGA	2	8	28961	28968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015979	ATTT	2	8	30165	30172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015979	AACT	2	8	31788	31795	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015979	TAGA	2	8	32209	32216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015979	TAGA	2	8	32231	32238	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015979	TAGA	2	8	32253	32260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015979	TAGA	2	8	32275	32282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015979	TAGA	2	8	32297	32304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015979	TAGA	2	8	32319	32326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015979	TAGA	2	8	32341	32348	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015979	TAGA	2	8	32363	32370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015979	TAGA	2	8	32385	32392	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015979	TAGA	2	8	32407	32414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015979	TAGA	2	8	32429	32436	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015979	TAGA	2	8	32451	32458	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015979	TAGA	2	8	32473	32480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015979	TAGA	2	8	32495	32502	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015979	TAGA	2	8	32517	32524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015979	TAGA	2	8	32539	32546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015979	TAGA	2	8	32561	32568	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015979	CATT	2	8	33663	33670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015979	ATTA	2	8	33692	33699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015979	ATTA	2	8	33813	33820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015979	AAGG	2	8	34479	34486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015979	CGTA	2	8	37724	37731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_015979	CAAA	2	8	37915	37922	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015979	TAAT	2	8	38219	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015979	CAAG	2	8	39618	39625	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015979	ACCA	2	8	39728	39735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015979	ACTC	2	8	39916	39923	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_015979	GAAA	2	8	41927	41934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015979	CTGA	2	8	45398	45405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015979	GTGA	2	8	45485	45492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015979	AACA	2	8	45870	45877	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015979	ACAG	2	8	45891	45898	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_015979	CAAG	2	8	46055	46062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015979	ATGT	2	8	46482	46489	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015979	TATG	2	8	47215	47222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015979	TAAC	2	8	47368	47375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015979	TCAA	2	8	48199	48206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015979	CCAA	2	8	48318	48325	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_015979	CGAA	2	8	48820	48827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015979	AAAG	2	8	49337	49344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015979	TAAA	2	8	49367	49374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015979	GATT	2	8	49608	49615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015979	GTTT	2	8	52364	52371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015979	AAAT	2	8	53462	53469	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015979	TTCC	2	8	54482	54489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015979	TTAT	3	12	55535	55546	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015979	TACA	2	8	55566	55573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015979	TGTA	2	8	55584	55591	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015979	TATT	2	8	56868	56875	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015979	AAAT	2	8	58483	58490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015979	CATA	2	8	58554	58561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.