MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 340

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	AT	3	6	281	286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015978	AT	3	6	15767	15772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015978	GT	3	6	21865	21870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015978	TA	3	6	31449	31454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015978	CT	3	6	34851	34856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015978	TA	3	6	37747	37752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015978	AT	3	6	40527	40532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015978	AT	3	6	41432	41437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015978	AG	3	6	41879	41884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015978	AC	3	6	41953	41958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_015978	AC	3	6	42122	42127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015978	CT	3	6	42333	42338	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_015978	TA	4	8	42393	42400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015978	AG	3	6	42855	42860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015978	AC	3	6	42916	42921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015978	TC	3	6	43347	43352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_015978	AT	3	6	43547	43552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015978	TG	3	6	43996	44001	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015978	GA	3	6	44185	44190	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015978	GA	3	6	45465	45470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015978	CA	3	6	49878	49883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015978	AT	6	12	51722	51733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015978	AC	3	6	52562	52567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_015978	TA	3	6	55706	55711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015978	TA	3	6	67692	67697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015978	TA	3	6	69729	69734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015978	TA	3	6	78259	78264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015978	TA	3	6	81618	81623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015978	TA	3	6	84646	84651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015978	AT	3	6	84753	84758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015978	AT	3	6	90029	90034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015978	CT	3	6	101504	101509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015978	TA	3	6	101655	101660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015978	CT	3	6	105801	105806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_015978	TC	3	6	106436	106441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015978	TA	3	6	117096	117101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015978	TA	3	6	120853	120858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015978	AT	3	6	120946	120951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015978	AT	3	6	121857	121862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015978	AG	3	6	122304	122309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015978	AC	3	6	122378	122383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015978	AC	3	6	122547	122552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015978	TA	4	8	122909	122916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015978	AG	3	6	123371	123376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015978	AC	3	6	123432	123437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015978	TC	3	6	123863	123868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015978	AT	3	6	124063	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015978	TG	3	6	124512	124517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015978	GA	3	6	124701	124706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015978	GA	3	6	125981	125986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015978	AG	3	6	126279	126284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015978	AG	3	6	132453	132458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015978	TA	3	6	139759	139764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015978	AT	3	6	148011	148016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015978	CA	3	6	148201	148206	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_015978	AT	3	6	148766	148771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015978	AT	3	6	149134	149139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015978	CT	3	6	156561	156566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015978	TC	3	6	157712	157717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015978	AT	3	6	157801	157806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015978	TA	4	8	165755	165762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015978	TA	3	6	166571	166576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015978	TG	3	6	166635	166640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015978	AT	3	6	169409	169414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015978	TA	3	6	169417	169422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015978	TA	3	6	172639	172644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015978	AT	3	6	172754	172759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015978	CA	3	6	176210	176215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_015978	AG	3	6	176769	176774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015978	AT	4	8	177157	177164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015978	AG	3	6	177395	177400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015978	CT	3	6	177425	177430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015978	AT	3	6	181958	181963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015978	GA	3	6	181994	181999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015978	AC	3	6	183576	183581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015978	TA	3	6	196105	196110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015978	AT	3	6	205133	205138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015978	TA	3	6	211120	211125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015978	AC	3	6	214085	214090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015978	TA	3	6	214313	214318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015978	GA	3	6	215706	215711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015978	CT	3	6	215730	215735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015978	TA	3	6	218895	218900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015978	AT	6	12	218946	218957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015978	AG	3	6	219628	219633	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015978	GC	3	6	221253	221258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015978	TG	3	6	232828	232833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015978	TA	3	6	242325	242330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015978	TC	3	6	242461	242466	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_015978	TA	3	6	243404	243409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015978	GT	3	6	243461	243466	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015978	AT	3	6	243469	243474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015978	TG	3	6	244547	244552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015978	GA	3	6	250597	250602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015978	GA	3	6	259723	259728	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015978	AT	3	6	260923	260928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015978	TA	3	6	272428	272433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015978	TA	3	6	274348	274353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015978	TA	3	6	280252	280257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015978	GA	3	6	281888	281893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015978	AT	3	6	293972	293977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015978	TA	3	6	296116	296121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015978	CG	3	6	309420	309425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_015978	CT	3	6	309536	309541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_015978	TC	3	6	315954	315959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_015978	TG	3	6	327079	327084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015978	AT	3	6	328803	328808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015978	GA	3	6	334170	334175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015978	CA	3	6	337172	337177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_015978	AG	3	6	337731	337736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015978	GA	3	6	338990	338995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015978	TA	3	6	340422	340427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015978	TA	3	6	360301	360306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015978	AT	3	6	361268	361273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015978	AG	3	6	361715	361720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015978	AC	3	6	361789	361794	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015978	AC	3	6	361958	361963	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_015978	TA	4	8	362318	362325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015978	AG	3	6	362780	362785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015978	AC	3	6	362841	362846	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_015978	TC	3	6	363272	363277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_015978	AT	3	6	363472	363477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015978	TG	3	6	363921	363926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015978	GA	3	6	364110	364115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015978	GA	3	6	365390	365395	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015978	TA	3	6	365581	365586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015978	AT	3	6	367138	367143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015978	AT	3	6	368044	368049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015978	AG	3	6	368491	368496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015978	AC	3	6	368565	368570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_015978	AC	3	6	368734	368739	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_015978	TA	4	8	369094	369101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015978	AG	3	6	369556	369561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015978	AC	3	6	369617	369622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_015978	TC	3	6	370048	370053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_015978	AT	3	6	370248	370253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015978	TG	3	6	370697	370702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015978	GA	3	6	370886	370891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015978	GA	3	6	372166	372171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015978	AG	3	6	375428	375433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015978	CT	3	6	398885	398890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015978	GT	3	6	400894	400899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015978	AG	3	6	405075	405080	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015978	TA	3	6	421825	421830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015978	GA	3	6	421836	421841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015978	AT	3	6	422817	422822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015978	AG	3	6	423264	423269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015978	AC	3	6	423338	423343	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_015978	AC	3	6	423507	423512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_015978	TA	3	6	423997	424002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015978	AG	3	6	424457	424462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015978	AC	3	6	424518	424523	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015978	TC	3	6	424949	424954	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_015978	AT	3	6	425150	425155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.