MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015978	TAT	2	6	1023221	1023226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015978	GTC	2	6	1023250	1023255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_015978	TAAT	2	8	1023299	1023306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015978	GGT	2	6	1023351	1023356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015978	TTC	2	6	1023411	1023416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015978	CAT	2	6	1023435	1023440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_015978	GCT	2	6	1023579	1023584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015978	TAAAT	2	10	1023611	1023620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015978	TGT	2	6	1023696	1023701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015978	TG	3	6	1023857	1023862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015978	CGC	2	6	1023956	1023961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_015978	CTG	2	6	1024012	1024017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_015978	GCC	2	6	1024151	1024156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_015978	CAA	2	6	1027606	1027611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015978	A	7	7	1027610	1027616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015978	ACC	2	6	1027657	1027662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_015978	TTAT	2	8	1027663	1027670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015978	TC	3	6	1027689	1027694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_015978	ACCA	2	8	1027802	1027809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_015978	TAC	2	6	1027837	1027842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015978	GTTTT	2	10	1027855	1027864	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_015978	A	6	6	1027888	1027893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015978	A	6	6	1027896	1027901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015978	T	7	7	1027907	1027913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_015978	AAT	2	6	1027918	1027923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015978	AAT	2	6	1027979	1027984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015978	AATC	2	8	1027991	1027998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_015978	AAT	2	6	1028562	1028567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015978	TTAAG	2	10	1028643	1028652	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015978	TAAT	2	8	1028671	1028678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015978	A	6	6	1028687	1028692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015978	AGT	2	6	1028704	1028709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015978	TCC	2	6	1031752	1031757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_015978	A	6	6	1031784	1031789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015978	GATT	2	8	1031804	1031811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015978	CT	3	6	1033759	1033764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_015978	TACT	2	8	1033793	1033800	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_015978	ATAA	2	8	1033803	1033810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015978	ATTTT	2	10	1035122	1035131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015978	TTC	2	6	1035149	1035154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_015978	TTTA	2	8	1035175	1035182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015978	AAT	2	6	1035225	1035230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015978	T	6	6	1035274	1035279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015978	AGG	2	6	1035288	1035293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015978	AAATT	2	10	1036688	1036697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015978	AAT	2	6	1038117	1038122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015978	CAT	2	6	1038144	1038149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015978	GATC	2	8	1038196	1038203	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_015978	AGG	2	6	1038208	1038213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015978	ATT	2	6	1038271	1038276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015978	ATC	2	6	1040627	1040632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015978	GTT	2	6	1040641	1040646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015978	TGC	2	6	1041255	1041260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015978	TAA	2	6	1041287	1041292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015978	CA	3	6	1041299	1041304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4056	NC_015978	AAC	2	6	1041312	1041317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015978	ATC	2	6	1041330	1041335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015978	GAC	3	9	1041343	1041351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_015978	TGC	2	6	1041360	1041365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015978	AATA	2	8	1041413	1041420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015978	TAA	2	6	1041435	1041440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015978	ATTT	2	8	1041450	1041457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015978	CTTT	2	8	1041500	1041507	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_015978	TTGA	2	8	1041538	1041545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015978	TTAAA	2	10	1041589	1041598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015978	TTA	2	6	1041622	1041627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015978	CTG	2	6	1043223	1043228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_015978	TGA	2	6	1043624	1043629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015978	AAT	2	6	1043635	1043640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015978	ATC	2	6	1044014	1044019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015978	TTCAG	2	10	1044030	1044039	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4072	NC_015978	TCA	2	6	1044051	1044056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_015978	ACT	2	6	1044068	1044073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_015978	CTG	2	6	1044119	1044124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_015978	AATT	2	8	1044134	1044141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015978	CTT	2	6	1044172	1044177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_015978	CATT	2	8	1044211	1044218	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4078	NC_015978	TTGT	2	8	1044242	1044249	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015978	TA	3	6	1044317	1044322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_015978	CTC	2	6	1044356	1044361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_015978	AAC	2	6	1044375	1044380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_015978	AATT	2	8	1044386	1044393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015978	GTT	2	6	1044398	1044403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015978	T	7	7	1044402	1044408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015978	T	6	6	1044932	1044937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015978	TTA	2	6	1044947	1044952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_015978	CTAA	2	8	1046195	1046202	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4088	NC_015978	AAT	2	6	1046751	1046756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_015978	TTA	2	6	1046775	1046780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015978	A	6	6	1046790	1046795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015978	ACA	2	6	1046877	1046882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_015978	AGTT	2	8	1046956	1046963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015978	A	6	6	1047013	1047018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015978	T	6	6	1047049	1047054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015978	CAA	2	6	1047069	1047074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_015978	ATTCA	2	10	1047113	1047122	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4097	NC_015978	A	7	7	1047129	1047135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_015978	CAG	2	6	1047151	1047156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_015978	TTG	2	6	1047202	1047207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015978	CTT	2	6	1047577	1047582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_015978	CAT	2	6	1047627	1047632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_015978	AGT	2	6	1047697	1047702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015978	GGT	2	6	1047715	1047720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015978	AGG	2	6	1047754	1047759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015978	ACT	2	6	1048138	1048143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_015978	GA	3	6	1048180	1048185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015978	TACT	2	8	1048202	1048209	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_015978	ATT	2	6	1048285	1048290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015978	TAAA	2	8	1048306	1048313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015978	TTTA	2	8	1048330	1048337	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015978	TGA	2	6	1048431	1048436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015978	TGA	2	6	1048450	1048455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015978	GAATTT	2	12	1048510	1048521	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015978	T	7	7	1048569	1048575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015978	AAT	2	6	1048591	1048596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_015978	GTT	2	6	1048603	1048608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_015978	AATT	2	8	1048625	1048632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_015978	TTC	2	6	1048655	1048660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_015978	TCA	2	6	1048779	1048784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_015978	ATC	2	6	1048805	1048810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_015978	GTCA	2	8	1048811	1048818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4122	NC_015978	CAG	2	6	1048825	1048830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_015978	GC	3	6	1048858	1048863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_015978	AT	3	6	1048891	1048896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015978	CAGTC	2	10	1048967	1048976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4126	NC_015978	AAT	2	6	1048988	1048993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015978	TGA	2	6	1049047	1049052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015978	GAAC	2	8	1049086	1049093	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_015978	T	6	6	1049118	1049123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015978	TGA	2	6	1049137	1049142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_015978	TGCT	2	8	1049145	1049152	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4133	NC_015978	A	6	6	1049256	1049261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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