MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015978	A	6	6	109246	109251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015978	TTG	2	6	109931	109936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_015978	T	6	6	109940	109945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015978	T	6	6	110386	110391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_015978	AAG	2	6	112468	112473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_015978	TTA	2	6	112486	112491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015978	TAT	2	6	112597	112602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015978	AAAG	2	8	112606	112613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_015978	A	6	6	112988	112993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015978	ATT	2	6	113018	113023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015978	T	6	6	113079	113084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015978	GAA	2	6	113093	113098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015978	GAAA	2	8	113104	113111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_015978	CCT	2	6	113183	113188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_015978	GTG	2	6	113249	113254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015978	AGTA	2	8	114911	114918	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
517	NC_015978	AGT	2	6	114977	114982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015978	CAAA	2	8	115766	115773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015978	ATT	2	6	115797	115802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_015978	TTAC	2	8	116998	117005	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
521	NC_015978	AAAT	2	8	117019	117026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015978	ATTA	2	8	117037	117044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015978	AATT	2	8	117078	117085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015978	TA	3	6	117096	117101	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015978	AATA	2	8	117105	117112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015978	CTTA	2	8	118928	118935	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_015978	ATT	2	6	118936	118941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_015978	AGTTT	2	10	118968	118977	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
529	NC_015978	TAA	2	6	120240	120245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_015978	T	7	7	120840	120846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015978	TA	3	6	120853	120858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015978	TTG	2	6	120867	120872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_015978	AAAT	2	8	120890	120897	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015978	A	6	6	120904	120909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015978	TTAA	2	8	120911	120918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015978	AT	3	6	120946	120951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015978	TAA	2	6	120952	120957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015978	ATAA	2	8	121090	121097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015978	GGC	2	6	121157	121162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_015978	CGAA	2	8	121182	121189	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_015978	GAT	2	6	121222	121227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015978	AGA	2	6	121280	121285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_015978	AAC	2	6	121323	121328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015978	TGGA	2	8	121378	121385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015978	ATA	2	6	121413	121418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015978	GCA	2	6	121504	121509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015978	CGC	2	6	121551	121556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_015978	GTGA	2	8	121557	121564	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015978	TGT	2	6	121590	121595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015978	AGA	2	6	121599	121604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_015978	CAG	2	6	121672	121677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015978	TTA	2	6	121743	121748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015978	AT	3	6	121857	121862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015978	GGC	2	6	121883	121888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_015978	GAA	2	6	122127	122132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015978	TCT	2	6	122151	122156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_015978	GGT	2	6	122201	122206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015978	GTC	2	6	122215	122220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015978	TCGTG	2	10	122224	122233	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
560	NC_015978	AG	3	6	122304	122309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015978	GGA	2	6	122327	122332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015978	ATC	2	6	122351	122356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_015978	AC	3	6	122378	122383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_015978	AC	3	6	122547	122552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_015978	CCG	2	6	122613	122618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_015978	GAT	2	6	122633	122638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015978	CCT	2	6	122689	122694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_015978	AAT	2	6	122703	122708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015978	CTTG	2	8	122794	122801	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_015978	ATA	2	6	122878	122883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015978	TAA	2	6	122894	122899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015978	TA	4	8	122909	122916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_015978	T	6	6	122953	122958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015978	AAT	2	6	122984	122989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015978	GTTAA	2	10	123011	123020	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
576	NC_015978	AACT	2	8	123069	123076	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
577	NC_015978	GCG	2	6	123256	123261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_015978	AG	3	6	123371	123376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_015978	AC	3	6	123432	123437	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_015978	CGT	2	6	123444	123449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015978	GGA	2	6	123459	123464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015978	TGCA	2	8	123644	123651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_015978	TC	3	6	123863	123868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
584	NC_015978	TCG	2	6	124019	124024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015978	AT	3	6	124063	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015978	AGC	2	6	124122	124127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015978	ACT	2	6	124275	124280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_015978	TG	3	6	124512	124517	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015978	GAT	2	6	124571	124576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_015978	TAGT	2	8	124633	124640	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015978	AATT	2	8	124641	124648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015978	GAG	2	6	124678	124683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015978	GA	3	6	124701	124706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_015978	GAA	2	6	124748	124753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015978	CGG	2	6	124927	124932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_015978	GAA	2	6	125054	125059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015978	TAGG	2	8	125143	125150	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
598	NC_015978	TAC	2	6	125197	125202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_015978	CCT	2	6	125285	125290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_015978	AAGC	2	8	125360	125367	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_015978	GGT	2	6	125421	125426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_015978	CGT	2	6	125616	125621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_015978	GAG	2	6	125665	125670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015978	GCC	2	6	125724	125729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_015978	TATG	2	8	125749	125756	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015978	GAT	2	6	125844	125849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015978	ACTAAT	2	12	125895	125906	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
608	NC_015978	GAA	2	6	125956	125961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015978	GA	3	6	125981	125986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015978	A	6	6	126000	126005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015978	GTG	2	6	126010	126015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015978	AGT	2	6	126081	126086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015978	GAAA	2	8	126130	126137	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015978	T	7	7	126161	126167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_015978	TAAAA	2	10	126173	126182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_015978	A	7	7	126179	126185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015978	TGT	2	6	126193	126198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015978	TATT	2	8	126261	126268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015978	AG	3	6	126279	126284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015978	AGA	2	6	126320	126325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015978	ATCA	2	8	126336	126343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_015978	TCA	2	6	126420	126425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015978	GGT	2	6	126471	126476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015978	TAT	2	6	126499	126504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015978	T	6	6	126516	126521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_015978	TTA	2	6	126524	126529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015978	ATA	2	6	126697	126702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015978	TAT	2	6	129587	129592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015978	ATT	2	6	129601	129606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015978	TAAATT	2	12	129608	129619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015978	ATG	2	6	129646	129651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_015978	TAT	2	6	131592	131597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015978	ATA	2	6	131611	131616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015978	A	6	6	131621	131626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015978	ATA	2	6	131631	131636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015978	ATC	2	6	131929	131934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_015978	GTT	2	6	131945	131950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015978	TAA	2	6	131971	131976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015978	GAA	2	6	131992	131997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015978	TCT	2	6	132017	132022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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