MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 5422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015978	TTG	2	6	1224360	1224365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015978	TGC	2	6	1224372	1224377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_015978	GAT	2	6	1224391	1224396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015978	AGC	3	9	1224408	1224416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_015978	TTG	2	6	1224417	1224422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015978	TGC	2	6	1224429	1224434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015978	GAT	2	6	1224445	1224450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015978	AGC	3	9	1224462	1224470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_015978	TTG	2	6	1224471	1224476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015978	TGC	2	6	1224483	1224488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_015978	GCT	2	6	1224508	1224513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_015978	TTG	2	6	1224525	1224530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_015978	GCT	2	6	1224559	1224564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_015978	AGT	2	6	1224573	1224578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015978	CAA	2	6	1224587	1224592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_015978	GTT	2	6	1224657	1224662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015978	CAG	2	6	1224785	1224790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015978	CAG	2	6	1224794	1224799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_015978	ATAAA	2	10	1224835	1224844	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_015978	TGT	2	6	1224888	1224893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015978	TATT	2	8	1224946	1224953	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_015978	TAATT	2	10	1225024	1225033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_015978	A	7	7	1225071	1225077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015978	ATG	2	6	1225128	1225133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015978	A	6	6	1225146	1225151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015978	ACT	2	6	1225167	1225172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_015978	TACT	2	8	1225231	1225238	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_015978	CAC	2	6	1226895	1226900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5029	NC_015978	AGG	2	6	1226961	1226966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_015978	ATA	2	6	1227537	1227542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015978	CA	3	6	1227596	1227601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5032	NC_015978	T	7	7	1227643	1227649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015978	TAAA	2	8	1228959	1228966	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015978	ATT	2	6	1229000	1229005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015978	TA	3	6	1229043	1229048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_015978	TAT	2	6	1229055	1229060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_015978	GTTT	2	8	1229077	1229084	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_015978	CTA	2	6	1229096	1229101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_015978	ATT	2	6	1229161	1229166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_015978	ATT	2	6	1230181	1230186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_015978	ATT	2	6	1230190	1230195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015978	TAT	2	6	1230207	1230212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015978	CAA	2	6	1230229	1230234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_015978	CAAA	2	8	1230308	1230315	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_015978	TAA	2	6	1232115	1232120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_015978	A	7	7	1232119	1232125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_015978	AACT	2	8	1232139	1232146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_015978	ATG	2	6	1232194	1232199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015978	GCAAA	2	10	1232263	1232272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5050	NC_015978	ATC	2	6	1232295	1232300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_015978	TA	4	8	1232337	1232344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_015978	ATTT	2	8	1232355	1232362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015978	T	6	6	1232382	1232387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015978	TTAA	2	8	1234207	1234214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_015978	ATAG	2	8	1234242	1234249	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_015978	AAT	2	6	1234671	1234676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_015978	ACA	2	6	1234680	1234685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_015978	TCT	2	6	1234700	1234705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_015978	A	6	6	1236985	1236990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_015978	AAG	2	6	1237042	1237047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015978	ACGA	2	8	1237065	1237072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5062	NC_015978	ATC	2	6	1237077	1237082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_015978	A	6	6	1237086	1237091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015978	TCA	2	6	1237228	1237233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015978	A	6	6	1237290	1237295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015978	CTT	2	6	1237358	1237363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_015978	ATT	2	6	1237385	1237390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015978	TGG	2	6	1237405	1237410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015978	TTAC	2	8	1237511	1237518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_015978	CTTCT	2	10	1237532	1237541	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5071	NC_015978	GATG	2	8	1237575	1237582	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_015978	TGG	2	6	1237621	1237626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_015978	TGA	2	6	1237675	1237680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_015978	ACT	3	9	1237709	1237717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_015978	GGT	2	6	1237775	1237780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_015978	TTC	2	6	1237807	1237812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015978	CAA	2	6	1237844	1237849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_015978	CTT	2	6	1237876	1237881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_015978	GCT	2	6	1237916	1237921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_015978	TGT	2	6	1237963	1237968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015978	TAT	2	6	1238065	1238070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015978	GCA	2	6	1238096	1238101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_015978	TTA	2	6	1238171	1238176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_015978	AACT	2	8	1238233	1238240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_015978	TTC	2	6	1238267	1238272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_015978	TTC	2	6	1238351	1238356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_015978	GAA	2	6	1238405	1238410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015978	ACA	2	6	1238427	1238432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_015978	A	6	6	1238435	1238440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_015978	ATA	2	6	1238442	1238447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_015978	A	6	6	1238457	1238462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015978	T	7	7	1238484	1238490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_015978	ATT	2	6	1243712	1243717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015978	A	6	6	1243740	1243745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015978	TAT	2	6	1244926	1244931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015978	AAT	2	6	1246261	1246266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_015978	ATC	2	6	1246273	1246278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_015978	TTA	2	6	1246295	1246300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015978	ATT	2	6	1246352	1246357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015978	ATT	2	6	1246393	1246398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_015978	GAG	2	6	1246410	1246415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5102	NC_015978	A	7	7	1246431	1246437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015978	A	6	6	1246441	1246446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_015978	GTT	2	6	1246447	1246452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015978	A	6	6	1247371	1247376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_015978	GTTT	2	8	1248362	1248369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015978	ATT	2	6	1248397	1248402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015978	ATC	2	6	1249621	1249626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_015978	GAT	2	6	1249695	1249700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015978	GTT	2	6	1249746	1249751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_015978	TA	3	6	1249771	1249776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015978	CTT	2	6	1249806	1249811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015978	AATT	2	8	1249834	1249841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_015978	T	7	7	1249886	1249892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_015978	ATTC	2	8	1249908	1249915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5116	NC_015978	CTCA	2	8	1249975	1249982	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_015978	GCT	2	6	1250081	1250086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_015978	CTC	2	6	1250123	1250128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_015978	A	6	6	1251189	1251194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_015978	GAA	2	6	1251198	1251203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_015978	AGC	2	6	1251447	1251452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_015978	TCG	2	6	1251521	1251526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_015978	TTGG	2	8	1251545	1251552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_015978	ATG	2	6	1251757	1251762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_015978	CAA	2	6	1251874	1251879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015978	ATA	2	6	1251893	1251898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_015978	ATT	2	6	1251904	1251909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015978	GTTT	2	8	1252097	1252104	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015978	TGT	3	9	1252124	1252132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015978	TCA	2	6	1252136	1252141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_015978	ATA	2	6	1252189	1252194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_015978	ATC	2	6	1252213	1252218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5136	NC_015978	CTA	2	6	1252335	1252340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5143	NC_015978	GCTG	2	8	1252669	1252676	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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