MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 9608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_015975	TAT	2	6	580188	580193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015975	A	6	6	581447	581452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_015975	AAAGC	2	10	583006	583015	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3005	NC_015975	TCT	2	6	583032	583037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_015975	CAT	2	6	583038	583043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_015975	T	6	6	583137	583142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015975	A	6	6	583165	583170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_015975	TA	3	6	583171	583176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015975	ATTCA	2	10	583177	583186	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3011	NC_015975	GGA	2	6	583237	583242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015975	AAAG	2	8	583255	583262	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_015975	ATG	2	6	583317	583322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_015975	TGTC	2	8	583410	583417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_015975	GAT	2	6	583421	583426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_015975	TAT	2	6	583489	583494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_015975	TGATGT	2	12	583495	583506	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_015975	AAG	2	6	583580	583585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015975	CAT	2	6	583619	583624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_015975	TGA	2	6	583645	583650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_015975	TCGT	2	8	583685	583692	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3022	NC_015975	TAA	2	6	583705	583710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_015975	GGA	2	6	583741	583746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_015975	TGA	2	6	583879	583884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_015975	TGA	2	6	583959	583964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_015975	GAA	2	6	584011	584016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3031	NC_015975	CGAG	2	8	584160	584167	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3032	NC_015975	CAT	2	6	584233	584238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_015975	TGG	2	6	584277	584282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3036	NC_015975	TGC	2	6	584498	584503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015975	A	6	6	584515	584520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_015975	CTG	2	6	584630	584635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015975	GCA	2	6	584660	584665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_015975	AAG	2	6	584720	584725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_015975	GAA	2	6	584734	584739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015975	TCA	2	6	584757	584762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3044	NC_015975	TGA	2	6	584872	584877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_015975	GC	3	6	584890	584895	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_015975	AAG	2	6	584933	584938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015975	CTA	2	6	585037	585042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3049	NC_015975	GAA	2	6	585146	585151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015975	G	7	7	585152	585158	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3053	NC_015975	GGAT	2	8	587269	587276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_015975	ATC	2	6	587320	587325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3056	NC_015975	CAT	2	6	587375	587380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_015975	AT	3	6	587403	587408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015975	A	6	6	587460	587465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_015975	TAT	2	6	587485	587490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3062	NC_015975	TTC	2	6	587529	587534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_015975	GAT	2	6	587547	587552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_015975	GAG	2	6	587646	587651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015975	A	6	6	588139	588144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_015975	AAG	2	6	588151	588156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015975	GTTG	2	8	588197	588204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015975	GATGT	2	10	588218	588227	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015975	TTA	2	6	588240	588245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_015975	TCG	2	6	588305	588310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3072	NC_015975	TATT	2	8	588358	588365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_015975	TAA	2	6	588465	588470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3075	NC_015975	ACTC	2	8	588487	588494	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_015975	A	6	6	588522	588527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_015975	TTG	2	6	588642	588647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3083	NC_015975	GAG	2	6	589156	589161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_015975	TACT	2	8	590361	590368	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3089	NC_015975	ATGCG	2	10	590386	590395	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3097	NC_015975	A	6	6	591366	591371	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3099	NC_015975	CAT	2	6	591432	591437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_015975	TTG	2	6	591538	591543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015975	G	7	7	591578	591584	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015975	ATG	2	6	591593	591598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015975	AGGA	2	8	591608	591615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015975	AGACG	2	10	591645	591654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3107	NC_015975	ATA	2	6	591681	591686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015975	ATT	2	6	591703	591708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_015975	TAA	2	6	591718	591723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_015975	AATA	2	8	591815	591822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015975	AGC	2	6	591823	591828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_015975	GGA	2	6	591875	591880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015975	T	6	6	592595	592600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015975	AAAAAT	2	12	592629	592640	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_015975	TCC	2	6	593190	593195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3116	NC_015975	ATA	2	6	593206	593211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015975	AT	4	8	593244	593251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_015975	GATT	2	8	593317	593324	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015975	AAGG	2	8	593393	593400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015975	A	6	6	593411	593416	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015975	TGC	2	6	593483	593488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3122	NC_015975	AAG	2	6	593533	593538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_015975	ATT	2	6	593576	593581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015975	TCAAA	2	10	593603	593612	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3125	NC_015975	GAA	2	6	593644	593649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015975	AAG	2	6	593663	593668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015975	CAAT	2	8	593718	593725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3128	NC_015975	GAAG	2	8	593763	593770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_015975	T	7	7	593801	593807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015975	GAT	2	6	593808	593813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015975	ATC	2	6	594141	594146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_015975	T	6	6	594170	594175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015975	T	6	6	594185	594190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015975	TTTTG	2	10	594863	594872	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_015975	TCT	2	6	594885	594890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_015975	CAA	2	6	594923	594928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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