MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 9608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9501	NC_015975	GTTTA	2	10	2060355	2060364	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9502	NC_015975	GTC	2	6	2060545	2060550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9503	NC_015975	CGC	2	6	2060567	2060572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9504	NC_015975	GTC	2	6	2060623	2060628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9505	NC_015975	CTG	2	6	2060672	2060677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9506	NC_015975	TTCAGA	2	12	2060704	2060715	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9507	NC_015975	CTGA	2	8	2060718	2060725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9508	NC_015975	CCG	2	6	2060731	2060736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9509	NC_015975	TTC	2	6	2060776	2060781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9510	NC_015975	TTCC	2	8	2060933	2060940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9511	NC_015975	CTGA	2	8	2060977	2060984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9512	NC_015975	TGA	2	6	2061035	2061040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9513	NC_015975	TCT	2	6	2061083	2061088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9514	NC_015975	TCG	2	6	2061122	2061127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9515	NC_015975	TCG	2	6	2061179	2061184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9516	NC_015975	TGCC	2	8	2061200	2061207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9517	NC_015975	AAAC	2	8	2061245	2061252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9518	NC_015975	ACGCT	2	10	2061257	2061266	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9519	NC_015975	TCT	2	6	2061290	2061295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9520	NC_015975	AAC	2	6	2061318	2061323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9521	NC_015975	CGTC	2	8	2061394	2061401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9522	NC_015975	TTGA	2	8	2061421	2061428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9523	NC_015975	GTC	2	6	2061493	2061498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9524	NC_015975	GTC	2	6	2061589	2061594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9525	NC_015975	ATT	2	6	2061651	2061656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9526	NC_015975	CTT	2	6	2061696	2061701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9527	NC_015975	ATA	2	6	2061714	2061719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9528	NC_015975	TAG	2	6	2061817	2061822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9529	NC_015975	CGT	2	6	2061839	2061844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9530	NC_015975	TCG	2	6	2061845	2061850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9531	NC_015975	ACG	2	6	2061952	2061957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9532	NC_015975	CGA	2	6	2062001	2062006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9533	NC_015975	CTG	2	6	2062008	2062013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9534	NC_015975	TCGTA	2	10	2062121	2062130	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9535	NC_015975	CCG	2	6	2062168	2062173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9536	NC_015975	GTT	2	6	2062302	2062307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9537	NC_015975	GAT	2	6	2062359	2062364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9538	NC_015975	GTC	2	6	2062429	2062434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9539	NC_015975	GAA	2	6	2062478	2062483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9540	NC_015975	CAA	2	6	2062502	2062507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9541	NC_015975	GCCG	2	8	2062704	2062711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9542	NC_015975	TTC	2	6	2062719	2062724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9543	NC_015975	TCA	2	6	2062774	2062779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9544	NC_015975	GTT	2	6	2062809	2062814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9545	NC_015975	GAT	2	6	2062818	2062823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9546	NC_015975	ATT	2	6	2062851	2062856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9547	NC_015975	CCGA	2	8	2062948	2062955	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9548	NC_015975	CTG	2	6	2062998	2063003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9549	NC_015975	TC	3	6	2063068	2063073	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9550	NC_015975	AGA	2	6	2063103	2063108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9551	NC_015975	CTG	2	6	2063175	2063180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9552	NC_015975	CGC	2	6	2063213	2063218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9553	NC_015975	TCA	2	6	2063293	2063298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9554	NC_015975	GCA	2	6	2063368	2063373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9555	NC_015975	ATC	2	6	2063379	2063384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9556	NC_015975	AGC	2	6	2063390	2063395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9557	NC_015975	CATG	2	8	2063516	2063523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9558	NC_015975	T	6	6	2063641	2063646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9559	NC_015975	AAT	2	6	2063712	2063717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9560	NC_015975	CGCC	2	8	2063771	2063778	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9561	NC_015975	GAA	2	6	2063791	2063796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9562	NC_015975	ATA	2	6	2063805	2063810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9563	NC_015975	GCT	2	6	2063925	2063930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9564	NC_015975	T	6	6	2063939	2063944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9565	NC_015975	CCTG	2	8	2063948	2063955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9566	NC_015975	GGTT	2	8	2064027	2064034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9567	NC_015975	CGTC	2	8	2064098	2064105	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9568	NC_015975	CTG	2	6	2064129	2064134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9569	NC_015975	TTGA	2	8	2064139	2064146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9570	NC_015975	GAT	2	6	2064229	2064234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9571	NC_015975	ACG	2	6	2064241	2064246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9572	NC_015975	ACCGC	2	10	2064298	2064307	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9573	NC_015975	TGC	2	6	2064318	2064323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9574	NC_015975	TTC	2	6	2064376	2064381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9575	NC_015975	CAA	2	6	2064413	2064418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9576	NC_015975	ACT	2	6	2064419	2064424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9577	NC_015975	ATA	3	9	2064432	2064440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9578	NC_015975	ATCA	2	8	2064459	2064466	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9579	NC_015975	T	6	6	2064467	2064472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9580	NC_015975	ATTTT	2	10	2064474	2064483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9581	NC_015975	ATA	2	6	2064517	2064522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9582	NC_015975	A	6	6	2064528	2064533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9583	NC_015975	TAATT	2	10	2064584	2064593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9584	NC_015975	TTTA	2	8	2064594	2064601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9585	NC_015975	ATT	2	6	2064603	2064608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9586	NC_015975	TCT	2	6	2064654	2064659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9587	NC_015975	CGAA	2	8	2064677	2064684	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9588	NC_015975	CGAT	2	8	2064687	2064694	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9589	NC_015975	T	6	6	2064721	2064726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9590	NC_015975	TGC	2	6	2064756	2064761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9591	NC_015975	GC	3	6	2064855	2064860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9592	NC_015975	CAT	2	6	2064881	2064886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9593	NC_015975	A	7	7	2064895	2064901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9594	NC_015975	GAT	2	6	2064905	2064910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9595	NC_015975	ATC	2	6	2064927	2064932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9596	NC_015975	TTC	2	6	2064936	2064941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9597	NC_015975	T	6	6	2064956	2064961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9598	NC_015975	CT	3	6	2064968	2064973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9599	NC_015975	TCA	2	6	2064974	2064979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9600	NC_015975	TAT	2	6	2064980	2064985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9601	NC_015975	AG	3	6	2065794	2065799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9602	NC_015975	TAA	2	6	2065843	2065848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9603	NC_015975	CAA	2	6	2065871	2065876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9604	NC_015975	A	8	8	2066313	2066320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9605	NC_015975	AC	3	6	2066543	2066548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9606	NC_015975	CAT	2	6	2066553	2066558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9607	NC_015975	T	7	7	2066570	2066576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9608	NC_015975	ATC	2	6	2066584	2066589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.