MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 9608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015975	TTGAT	2	10	95328	95337	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
502	NC_015975	GCT	2	6	95412	95417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015975	T	6	6	95417	95422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_015975	CTG	3	9	95442	95450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_015975	CG	3	6	95453	95458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
506	NC_015975	A	6	6	95473	95478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015975	GCC	2	6	95507	95512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_015975	CG	3	6	95600	95605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
509	NC_015975	CTG	2	6	95653	95658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_015975	A	6	6	95695	95700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_015975	A	6	6	95769	95774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015975	A	6	6	95843	95848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_015975	GCC	2	6	95877	95882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015975	CG	3	6	95896	95901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
515	NC_015975	CCG	2	6	95949	95954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_015975	C	6	6	95958	95963	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
517	NC_015975	CTCAA	2	10	95972	95981	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
518	NC_015975	TTCT	2	8	95992	95999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_015975	TCT	2	6	96057	96062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_015975	CAA	2	6	96073	96078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_015975	TTG	2	6	96112	96117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_015975	T	6	6	96142	96147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_015975	TA	3	6	96149	96154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_015975	TA	3	6	96190	96195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_015975	T	6	6	96794	96799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_015975	CG	3	6	96837	96842	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
527	NC_015975	C	6	6	96901	96906	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
528	NC_015975	CCA	2	6	96923	96928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_015975	C	6	6	96964	96969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
530	NC_015975	GTT	2	6	97038	97043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_015975	CCTCA	2	10	97084	97093	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
532	NC_015975	CCT	2	6	97123	97128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_015975	TAT	2	6	97196	97201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_015975	AGG	2	6	97208	97213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_015975	GAAG	2	8	97238	97245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_015975	TAC	2	6	97254	97259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_015975	A	6	6	97287	97292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_015975	A	6	6	97329	97334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_015975	TTG	2	6	97335	97340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_015975	TGG	2	6	97355	97360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_015975	A	7	7	97394	97400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_015975	AGC	2	6	97416	97421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_015975	T	6	6	97423	97428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_015975	T	7	7	97441	97447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_015975	ATG	2	6	99342	99347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_015975	CCT	2	6	99349	99354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_015975	CTT	2	6	99385	99390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_015975	ATT	2	6	99407	99412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_015975	T	6	6	99419	99424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_015975	CA	3	6	99435	99440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
551	NC_015975	ATA	2	6	99448	99453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_015975	A	6	6	99467	99472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_015975	TAT	2	6	99500	99505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_015975	TAGT	2	8	100483	100490	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015975	ATAA	2	8	100498	100505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_015975	AAT	2	6	100530	100535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_015975	ATT	2	6	100658	100663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015975	TA	3	6	100680	100685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_015975	T	6	6	100709	100714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_015975	GAG	2	6	100784	100789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_015975	TGA	2	6	103143	103148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015975	GTT	2	6	103150	103155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_015975	TA	3	6	103176	103181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_015975	ACG	2	6	103203	103208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_015975	GA	3	6	106060	106065	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_015975	GA	3	6	108081	108086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_015975	TTGG	2	8	109861	109868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_015975	AT	3	6	109869	109874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_015975	AGG	2	6	109880	109885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_015975	TA	3	6	111617	111622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_015975	T	6	6	113147	113152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_015975	ACT	2	6	114221	114226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015975	ATT	2	6	114227	114232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_015975	T	8	8	114231	114238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_015975	ATC	2	6	117912	117917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_015975	TAAAT	2	10	117938	117947	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_015975	GT	3	6	117993	117998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_015975	CAT	2	6	118002	118007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015975	TGC	2	6	119036	119041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_015975	TAA	2	6	119044	119049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_015975	CA	3	6	119051	119056	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
582	NC_015975	AGCA	2	8	119073	119080	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_015975	T	6	6	119254	119259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_015975	ATA	2	6	119279	119284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_015975	A	6	6	119292	119297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_015975	TCA	2	6	119417	119422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_015975	A	6	6	119435	119440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_015975	AAGAA	2	10	119454	119463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
589	NC_015975	CAA	2	6	119503	119508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015975	AG	3	6	119530	119535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_015975	A	6	6	119548	119553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_015975	TCA	2	6	119564	119569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_015975	CGTTG	2	10	119596	119605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
594	NC_015975	AT	3	6	119612	119617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_015975	ATAA	2	8	119746	119753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015975	ATA	3	9	119788	119796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015975	AC	3	6	119817	119822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_015975	T	6	6	122621	122626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015975	TGG	2	6	122747	122752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_015975	ATCC	2	8	122787	122794	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
601	NC_015975	TTC	2	6	122879	122884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015975	T	6	6	122887	122892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015975	AAG	2	6	122895	122900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_015975	AGA	2	6	122912	122917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_015975	T	7	7	122931	122937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_015975	T	7	7	122959	122965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_015975	CTT	2	6	122978	122983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_015975	TGA	2	6	122987	122992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_015975	T	7	7	123006	123012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_015975	ATT	2	6	123039	123044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_015975	T	7	7	123043	123049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_015975	ATA	2	6	123059	123064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_015975	A	6	6	123064	123069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015975	AC	3	6	123074	123079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_015975	TAC	2	6	124676	124681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015975	AT	3	6	124704	124709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_015975	TCA	2	6	124711	124716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_015975	TAA	2	6	124727	124732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_015975	T	7	7	124764	124770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_015975	T	7	7	124784	124790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_015975	ATG	2	6	124802	124807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_015975	CGT	2	6	124827	124832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_015975	T	7	7	124868	124874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015975	TGA	3	9	124920	124928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015975	GCA	2	6	124944	124949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_015975	TGA	2	6	124992	124997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
627	NC_015975	TGA	2	6	125067	125072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015975	CGG	2	6	125080	125085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_015975	TGAT	2	8	125100	125107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_015975	AGA	2	6	125127	125132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_015975	AATC	2	8	125160	125167	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
632	NC_015975	T	6	6	125181	125186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_015975	ATT	2	6	125230	125235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_015975	TAT	2	6	125319	125324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015975	GTT	2	6	125343	125348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_015975	AGA	2	6	125394	125399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015975	AG	3	6	126289	126294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015975	TTTG	2	8	127326	127333	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_015975	AAT	2	6	128884	128889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_015975	T	7	7	128950	128956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015975	ATTT	2	8	128959	128966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015975	GATT	2	8	128978	128985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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