MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus garvieae ATCC 49156

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015930	GTATAT	2	12	23958	23969	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015930	AGGTCA	2	12	54365	54376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_015930	TTATAA	2	12	64771	64782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015930	AAAAAG	2	12	91449	91460	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015930	CGTAAT	2	12	142105	142116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_015930	AATTGT	2	12	167318	167329	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015930	ATAGAG	2	12	168076	168087	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015930	TTTTCT	2	12	169987	169998	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015930	AGTTGA	2	12	245670	245681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015930	ATTTTT	2	12	260110	260121	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015930	AAAAAG	2	12	297671	297682	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015930	TAATAT	2	12	332333	332344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015930	AGAAAA	2	12	354963	354974	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015930	AATATA	2	12	386074	386085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015930	GGAGTT	2	12	397054	397065	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015930	GAAAAA	2	12	453833	453844	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015930	AATATT	2	12	488688	488699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015930	AAAAAT	2	12	509334	509345	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015930	CTAAAA	2	12	538217	538228	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015930	TTAAAA	2	12	545977	545988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015930	AAAAGA	2	12	572740	572751	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015930	TTGTTA	2	12	574667	574678	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015930	AAATAA	2	12	608664	608675	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015930	AAAATA	2	12	649450	649461	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015930	GTCAAT	2	12	657891	657902	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015930	AAGCTT	2	12	699858	699869	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015930	TTTTAA	2	12	708423	708434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015930	TTTTAA	2	12	717950	717961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015930	TGTAGT	2	12	724792	724803	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015930	TAAAAA	2	12	752392	752403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015930	GCAGTC	2	12	753126	753137	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015930	ATTTTA	2	12	758298	758309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015930	CTTTTT	2	12	770439	770450	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015930	TCTCTT	2	12	786766	786777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015930	TCGAAC	2	12	830262	830273	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015930	TTTTTA	2	12	831843	831854	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015930	AACAAG	2	12	831868	831879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_015930	TAAAAA	2	12	857783	857794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015930	TAAAAA	2	12	862298	862309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015930	CTTTAT	2	12	863175	863186	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015930	TTATAA	2	12	879226	879237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015930	TAAAAT	2	12	888589	888600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015930	ATAAAT	2	12	890295	890306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015930	ATTTCT	2	12	890603	890614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015930	TAAAAA	2	12	893191	893202	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015930	CTTCAC	2	12	898373	898384	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_015930	TAGTTA	2	12	918162	918173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015930	ACTCCA	2	12	933070	933081	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_015930	TATTTT	2	12	936953	936964	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015930	TGTGAA	2	12	967518	967529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015930	AAAAAC	2	12	975691	975702	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015930	CTTTAC	2	12	982707	982718	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015930	TTTTAT	2	12	994403	994414	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015930	TTTAAT	2	12	1007075	1007086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015930	TAAAAA	2	12	1010322	1010333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015930	TTATTT	2	12	1025405	1025416	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015930	TTAAAC	2	12	1068559	1068570	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015930	ATTTTT	2	12	1077870	1077881	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015930	TAATTT	2	12	1079429	1079440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015930	CATTCC	2	12	1080425	1080436	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_015930	TCCTTC	2	12	1099749	1099760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015930	AGAAAT	2	12	1107027	1107038	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015930	TTAGTT	2	12	1127535	1127546	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015930	AGAAAA	2	12	1166836	1166847	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015930	AATAAA	2	12	1171364	1171375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015930	AAAAAC	2	12	1199686	1199697	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_015930	TAAGCT	2	12	1201037	1201048	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_015930	TCTTTC	2	12	1208869	1208880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015930	CTATTT	2	12	1211737	1211748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_015930	TAAAAT	2	12	1247657	1247668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015930	TAAATG	2	12	1253415	1253426	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015930	TTTTTA	2	12	1255131	1255142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015930	TAAAAA	2	12	1302112	1302123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015930	TTGCAA	2	12	1322211	1322222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015930	CATTTT	2	12	1381342	1381353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_015930	TATATT	2	12	1389506	1389517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015930	TGAGCT	2	12	1488810	1488821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015930	TTCACT	2	12	1492996	1493007	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015930	TACCTC	2	12	1509882	1509893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015930	CTTAGG	2	12	1510565	1510576	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015930	CTTTTT	2	12	1539783	1539794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_015930	ACTTCC	2	12	1565961	1565972	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015930	AAGCCA	2	12	1572912	1572923	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015930	AACGTT	2	12	1579288	1579299	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_015930	ATTTTT	2	12	1620417	1620428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015930	CAAGTG	2	12	1620910	1620921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_015930	ACTCTT	2	12	1639720	1639731	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015930	ATTTTT	2	12	1641738	1641749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015930	TTTTTA	2	12	1693967	1693978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015930	AGTAAC	2	12	1696858	1696869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015930	TTTATC	2	12	1723624	1723635	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_015930	TTTTAC	2	12	1740367	1740378	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_015930	AAATAA	2	12	1760102	1760113	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015930	GTAAAT	2	12	1771848	1771859	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015930	ACTTCC	2	12	1806180	1806191	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_015930	ACTTCC	2	12	1838672	1838683	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_015930	TTATAA	2	12	1879572	1879583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015930	TCAACT	2	12	1882857	1882868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015930	ATTATA	2	12	1915950	1915961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015930	CCCGAA	2	12	1919092	1919103	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_015930	ACTTCC	2	12	1919517	1919528	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_015930	TTTTAT	2	12	1927030	1927041	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015930	TAAAAA	2	12	1931145	1931156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015930	ACTTCC	2	12	1944025	1944036	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.