MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc sp. C2 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015734	AATACA	2	12	53724	53735	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_015734	ATTTGA	2	12	64793	64804	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015734	CATTAT	2	12	141537	141548	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_015734	TCAACA	2	12	152423	152434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015734	TTATAA	2	12	175082	175093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015734	TTTTTA	2	12	176473	176484	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015734	TTTGAA	2	12	202623	202634	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015734	AGGATC	2	12	207053	207064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_015734	TTGTAT	2	12	210518	210529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015734	TTAAAT	2	12	213253	213264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015734	TGTTAA	2	12	287650	287661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015734	TTGAAG	2	12	316469	316480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015734	TTATAA	2	12	329072	329083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015734	AATTGT	2	12	376039	376050	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015734	GATATG	2	12	376370	376381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015734	GTTTGA	2	12	388844	388855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015734	TTTAAA	2	12	419235	419246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015734	AAATTT	2	12	434267	434278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015734	ATCAAT	2	12	437353	437364	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_015734	CATCAG	2	12	496703	496714	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015734	TTGTAT	2	12	497561	497572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015734	GAATAA	2	12	498976	498987	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015734	CTGATT	2	12	500149	500160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_015734	TTTTAA	2	12	523715	523726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015734	TCTTTT	2	12	562434	562445	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_015734	ACATGA	2	12	607870	607881	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_015734	TATTAA	2	12	688747	688758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015734	CTATTA	2	12	715283	715294	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_015734	CTATCA	2	12	723952	723963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015734	AAAATA	2	12	774146	774157	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015734	ATAAAC	2	12	853382	853393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_015734	AAAATT	2	12	880038	880049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015734	GCATAA	2	12	890850	890861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_015734	AAATTA	2	12	920291	920302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015734	GTATAA	2	12	922385	922396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015734	TCTTAA	2	12	982212	982223	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_015734	ATTAAT	2	12	1012141	1012152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015734	GTCTAC	2	12	1055736	1055747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015734	TATTAC	2	12	1099136	1099147	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_015734	TGATTT	2	12	1101286	1101297	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015734	ACACAT	2	12	1121582	1121593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015734	CACTTC	2	12	1162737	1162748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_015734	TCGCTT	2	12	1164927	1164938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015734	TTTTTG	2	12	1178930	1178941	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015734	TTCAGT	2	12	1222047	1222058	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_015734	TAACAT	2	12	1234496	1234507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_015734	ATATTT	2	12	1252047	1252058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015734	TAAAAA	2	12	1261239	1261250	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015734	TTTATA	2	12	1272108	1272119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015734	GAGATT	2	12	1289628	1289639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015734	CACTTC	2	12	1293917	1293928	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015734	TCGCTT	2	12	1296106	1296117	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015734	TACGAT	2	12	1320744	1320755	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_015734	AAAATT	2	12	1338067	1338078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015734	TTCATA	2	12	1347674	1347685	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_015734	ATTTGT	2	12	1385450	1385461	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015734	CAATAG	2	12	1390406	1390417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_015734	AAAAAT	2	12	1430821	1430832	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015734	AGATTA	2	12	1442315	1442326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015734	TAAATG	2	12	1443500	1443511	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015734	CTTTTT	2	12	1458238	1458249	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_015734	ATTTTT	2	12	1511999	1512010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015734	TACATT	2	12	1521691	1521702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_015734	CACTTC	2	12	1532604	1532615	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_015734	TCGCTT	2	12	1534793	1534804	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015734	AAAATA	2	12	1621236	1621247	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015734	TTAATT	2	12	1683604	1683615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015734	TATTTT	2	12	1706812	1706823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015734	AAAATA	2	12	1728038	1728049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015734	TATTGT	2	12	1745751	1745762	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015734	GATAAT	2	12	1856101	1856112	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015734	ATATAA	2	12	1857035	1857046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015734	AAGCGA	2	12	1874978	1874989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015734	GAAGTG	2	12	1877167	1877178	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.