MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc sp. C2 chromosome

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015734	TATAA	2	10	1511	1520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015734	TTTTA	2	10	19761	19770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015734	ATAGA	2	10	40638	40647	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015734	TTCTT	2	10	47978	47987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_015734	AAAAT	2	10	52668	52677	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015734	TTGCA	2	10	58736	58745	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_015734	TTTTG	2	10	61973	61982	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015734	AATTA	2	10	85436	85445	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015734	TGTCT	2	10	91838	91847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015734	TGTCG	2	10	96491	96500	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_015734	AATTA	2	10	113998	114007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015734	TTAGA	2	10	119854	119863	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015734	TAATT	2	10	119882	119891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015734	ACTGA	2	10	151697	151706	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015734	ATTAA	2	10	154584	154593	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015734	GTAAA	2	10	166453	166462	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015734	ATTTT	2	10	182247	182256	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015734	GTTTT	2	10	182769	182778	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015734	TTCCT	2	10	182968	182977	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_015734	CTTTT	2	10	204220	204229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015734	TGAAA	2	10	213118	213127	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015734	TTATT	2	10	238409	238418	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015734	TATAT	2	10	238570	238579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015734	ATAAA	2	10	243346	243355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015734	AAAAT	2	10	262428	262437	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015734	TCACC	2	10	274125	274134	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
27	NC_015734	ATAAA	2	10	275394	275403	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015734	TAAAA	2	10	276115	276124	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015734	TAAAA	2	10	292519	292528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015734	CACAA	2	10	316512	316521	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015734	AAAGA	2	10	316796	316805	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015734	ATAAA	2	10	323105	323114	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015734	TTTGA	2	10	362239	362248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015734	AATTA	2	10	368569	368578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015734	ATTTT	2	10	378530	378539	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015734	AATTA	2	10	389001	389010	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015734	TATCA	2	10	390242	390251	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015734	ATAAA	2	10	390325	390334	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015734	CAAAG	2	10	390343	390352	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_015734	TACAA	2	10	391965	391974	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015734	ATTAA	2	10	411933	411942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015734	CAAAT	2	10	412202	412211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_015734	ATGTA	2	10	421488	421497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015734	CATGT	2	10	425307	425316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_015734	ATTTG	2	10	437838	437847	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015734	TTTGA	2	10	440178	440187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015734	AACTG	2	10	441270	441279	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_015734	TTTAG	2	10	442444	442453	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015734	TAAAA	2	10	447013	447022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015734	ATATT	2	10	447100	447109	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015734	TGATT	2	10	448005	448014	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015734	TAAAA	2	10	452751	452760	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015734	TTAAT	2	10	455306	455315	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015734	TAATT	2	10	456624	456633	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015734	TTGTT	2	10	472695	472704	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015734	CCAAT	2	10	473727	473736	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_015734	TAATA	2	10	474856	474865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015734	AAATA	2	10	475389	475398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015734	TTGAA	2	10	481937	481946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015734	TACAA	2	10	482304	482313	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_015734	TTTGA	2	10	496326	496335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015734	CTTGA	2	10	496521	496530	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015734	ACAAT	2	10	521726	521735	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_015734	TATCA	2	10	524975	524984	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_015734	AACTT	2	10	534811	534820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015734	CTTTC	2	10	536040	536049	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015734	TTAAA	2	10	562187	562196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015734	TATGA	2	10	570792	570801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015734	GAAAC	2	10	577075	577084	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_015734	ACAAA	2	10	584990	584999	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015734	TAAAT	2	10	585038	585047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015734	TTTAA	2	10	591060	591069	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015734	TTTAT	2	10	608911	608920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015734	ATTTT	2	10	613667	613676	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015734	ATTGA	2	10	617157	617166	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015734	CATAA	2	10	618684	618693	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015734	TAATT	2	10	624629	624638	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015734	TTTAA	2	10	629479	629488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015734	TAAAA	2	10	633642	633651	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015734	TTATT	2	10	643116	643125	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015734	AGATG	2	10	669159	669168	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015734	AATTT	2	10	670744	670753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015734	AATAA	2	10	673917	673926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015734	GCCGA	2	10	674571	674580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015734	CACAT	2	10	680836	680845	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_015734	AAAGT	2	10	708251	708260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015734	CTTTT	2	10	714892	714901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_015734	ACTTA	2	10	718047	718056	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015734	TAGAA	2	10	718073	718082	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015734	CCAAG	2	10	735264	735273	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015734	AATTT	2	10	750257	750266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015734	AAAAT	2	10	762645	762654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015734	TAAGT	2	10	771098	771107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015734	ATGTA	2	10	786481	786490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015734	TTTAC	2	10	788591	788600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_015734	TTTTA	2	10	794303	794312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015734	GAAAG	2	10	799761	799770	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015734	AAATC	2	10	853901	853910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015734	CATAA	2	10	855001	855010	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_015734	TTAAC	2	10	861666	861675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_015734	CTTTT	2	10	878043	878052	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_015734	AAATT	2	10	882110	882119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015734	CTAAA	2	10	890901	890910	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_015734	TAAAA	2	10	896300	896309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015734	AAAAT	2	10	898001	898010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015734	CATTG	2	10	917379	917388	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_015734	TAAAA	2	10	918326	918335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015734	CAAAC	2	10	922281	922290	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_015734	TATAG	2	10	956256	956265	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015734	TTTAT	2	10	961456	961465	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015734	TTTTA	2	10	969970	969979	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015734	ATTAT	2	10	970096	970105	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015734	TAAAA	2	10	973205	973214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015734	TTATA	2	10	985052	985061	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015734	TCATA	2	10	990374	990383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_015734	TTTTA	2	10	1024743	1024752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015734	ATTAT	2	10	1026358	1026367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015734	CACTA	2	10	1026421	1026430	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_015734	CAATA	2	10	1032490	1032499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015734	TCCTT	2	10	1035910	1035919	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_015734	TTAAA	2	10	1049150	1049159	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015734	TTTAT	2	10	1049302	1049311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015734	CTTTT	2	10	1063502	1063511	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_015734	CTTTA	2	10	1064885	1064894	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015734	AGCAC	2	10	1071365	1071374	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_015734	TCCTG	2	10	1071399	1071408	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_015734	ATTTA	2	10	1074391	1074400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015734	AACAT	2	10	1087313	1087322	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_015734	TATAT	2	10	1089379	1089388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015734	TTATT	2	10	1091360	1091369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015734	TGTTT	2	10	1098975	1098984	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015734	CTGGA	2	10	1101199	1101208	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_015734	AAAAT	2	10	1101340	1101349	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015734	TATAA	2	10	1101646	1101655	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015734	TTAAA	2	10	1101659	1101668	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015734	GCATT	2	10	1113324	1113333	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015734	GCTTA	2	10	1113350	1113359	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015734	CTGCT	25	125	1121382	1121506	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_015734	TTAAT	2	10	1122902	1122911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015734	TTATA	2	10	1155379	1155388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015734	GTAAA	2	10	1160568	1160577	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015734	ATTAT	2	10	1161390	1161399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015734	ATCTC	2	10	1162804	1162813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_015734	CACGA	2	10	1166437	1166446	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_015734	TGGTA	2	10	1167023	1167032	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015734	ACAAA	2	10	1193687	1193696	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015734	ACACA	2	10	1195035	1195044	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_015734	AATGG	2	10	1195359	1195368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015734	CTATA	2	10	1205313	1205322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_015734	AATCA	2	10	1219049	1219058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_015734	CTTTT	2	10	1226508	1226517	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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162	NC_015734	ATTAT	2	10	1292570	1292579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_015734	ATTCT	2	10	1346908	1346917	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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177	NC_015734	TAAAA	2	10	1366401	1366410	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015734	TTTTA	2	10	1377009	1377018	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_015734	TTTTG	2	10	1427430	1427439	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015734	CACAA	2	10	1430560	1430569	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_015734	TTTTA	2	10	1528263	1528272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015734	ATCTC	2	10	1532670	1532679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.