MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc sp. C2 chromosome

Total Repeats: 5430

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015734	CGA	2	6	1161360	1161365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_015734	ATTAT	2	10	1161390	1161399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_015734	CT	3	6	1161409	1161414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3004	NC_015734	CAT	2	6	1161520	1161525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_015734	CA	3	6	1161532	1161537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3006	NC_015734	TTG	2	6	1161557	1161562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_015734	G	6	6	1161646	1161651	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_015734	GAC	2	6	1161743	1161748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_015734	A	7	7	1161846	1161852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_015734	CCT	2	6	1161904	1161909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_015734	AT	3	6	1161951	1161956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_015734	CCA	2	6	1162075	1162080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_015734	ACT	2	6	1162106	1162111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_015734	GA	3	6	1162314	1162319	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_015734	TTC	2	6	1162404	1162409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_015734	TC	3	6	1162413	1162418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_015734	CTC	2	6	1162450	1162455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3018	NC_015734	TATG	2	8	1162469	1162476	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_015734	CAGC	2	8	1162499	1162506	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3020	NC_015734	ACT	2	6	1162516	1162521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_015734	GT	3	6	1162566	1162571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_015734	CTT	2	6	1162595	1162600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_015734	TTC	3	9	1162634	1162642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_015734	CACTTC	2	12	1162737	1162748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_015734	TCA	2	6	1162762	1162767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_015734	TAA	2	6	1162790	1162795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_015734	ATCTC	2	10	1162804	1162813	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3028	NC_015734	AAC	2	6	1162889	1162894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_015734	CTC	2	6	1162943	1162948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_015734	ACG	2	6	1162992	1162997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_015734	ACC	2	6	1163187	1163192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3032	NC_015734	GTT	2	6	1163226	1163231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_015734	GCTT	2	8	1163246	1163253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3034	NC_015734	AGG	2	6	1163323	1163328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_015734	GTA	2	6	1163411	1163416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_015734	TTC	2	6	1163454	1163459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_015734	CCTA	2	8	1163464	1163471	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_015734	AGC	2	6	1163481	1163486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_015734	GCC	2	6	1163681	1163686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_015734	TC	3	6	1163910	1163915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3041	NC_015734	A	6	6	1164059	1164064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_015734	GCAC	2	8	1164095	1164102	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_015734	CCT	2	6	1164128	1164133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_015734	TAC	2	6	1164159	1164164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_015734	CAG	2	6	1164335	1164340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_015734	TGG	2	6	1164485	1164490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_015734	AT	3	6	1164549	1164554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_015734	CATA	2	8	1164631	1164638	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_015734	GA	3	6	1164748	1164753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_015734	T	6	6	1164811	1164816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_015734	TCGCTT	2	12	1164927	1164938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_015734	CTT	2	6	1165032	1165037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_015734	CGT	2	6	1165043	1165048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_015734	TCGC	2	8	1165353	1165360	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3055	NC_015734	TTTC	2	8	1165381	1165388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3056	NC_015734	CTG	2	6	1165394	1165399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_015734	TAGT	2	8	1165537	1165544	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_015734	CCA	2	6	1165578	1165583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_015734	TTA	2	6	1165591	1165596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_015734	TGT	2	6	1165690	1165695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_015734	TAA	2	6	1165710	1165715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_015734	ATT	2	6	1165722	1165727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_015734	CCA	2	6	1165783	1165788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_015734	AGG	2	6	1165977	1165982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_015734	CCT	2	6	1166059	1166064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3066	NC_015734	GT	3	6	1166118	1166123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_015734	GT	3	6	1166287	1166292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_015734	ATG	2	6	1166312	1166317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_015734	CGT	2	6	1166324	1166329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_015734	TCC	2	6	1166338	1166343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3071	NC_015734	CACGA	2	10	1166437	1166446	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3072	NC_015734	GAC	3	9	1166450	1166458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_015734	CAC	2	6	1166463	1166468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_015734	TTC	2	6	1166539	1166544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_015734	CCT	2	6	1166678	1166683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_015734	GCC	2	6	1166783	1166788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3077	NC_015734	CGC	2	6	1166791	1166796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3078	NC_015734	TTC	2	6	1166802	1166807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_015734	AT	3	6	1166809	1166814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_015734	AAC	2	6	1166925	1166930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_015734	GCT	2	6	1166993	1166998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_015734	TGGTA	2	10	1167023	1167032	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_015734	TTC	2	6	1167066	1167071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_015734	ACA	2	6	1167076	1167081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_015734	TCA	2	6	1167104	1167109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3086	NC_015734	CA	3	6	1167108	1167113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_015734	TC	3	6	1167216	1167221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_015734	CAT	2	6	1167234	1167239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_015734	AACT	2	8	1167265	1167272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_015734	CACT	2	8	1167422	1167429	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_015734	CGC	2	6	1167481	1167486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_015734	TTGT	2	8	1167608	1167615	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_015734	TC	3	6	1167713	1167718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3094	NC_015734	TAT	2	6	1167730	1167735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_015734	ACT	2	6	1167762	1167767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_015734	CTT	2	6	1167789	1167794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_015734	AT	3	6	1167835	1167840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_015734	ACT	2	6	1167870	1167875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_015734	T	6	6	1167886	1167891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_015734	TCTT	2	8	1167907	1167914	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_015734	CTTT	2	8	1167968	1167975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3102	NC_015734	T	6	6	1167973	1167978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_015734	TTTA	2	8	1167987	1167994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_015734	A	7	7	1168022	1168028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_015734	TAA	2	6	1169471	1169476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_015734	TTG	2	6	1169483	1169488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_015734	T	6	6	1169519	1169524	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_015734	AC	3	6	1169564	1169569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_015734	CAA	2	6	1169579	1169584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_015734	A	6	6	1169583	1169588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_015734	TAT	2	6	1170866	1170871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_015734	GTT	2	6	1170885	1170890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_015734	ATT	2	6	1175487	1175492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_015734	CTT	2	6	1175548	1175553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_015734	CAA	2	6	1175585	1175590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_015734	TAT	2	6	1175602	1175607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_015734	CT	3	6	1178659	1178664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3118	NC_015734	A	6	6	1178709	1178714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_015734	TAAA	2	8	1178726	1178733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_015734	A	6	6	1178731	1178736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_015734	GA	3	6	1178783	1178788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_015734	CCG	2	6	1178804	1178809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_015734	AT	4	8	1178864	1178871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_015734	ATA	2	6	1178899	1178904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_015734	T	6	6	1178917	1178922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_015734	TTTTTG	2	12	1178930	1178941	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_015734	A	6	6	1180215	1180220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_015734	GAC	2	6	1180253	1180258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_015734	A	7	7	1180262	1180268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_015734	T	7	7	1180281	1180287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_015734	GATT	2	8	1180931	1180938	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_015734	ATA	2	6	1180988	1180993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_015734	GAT	2	6	1181006	1181011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_015734	TTA	2	6	1181019	1181024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_015734	TAA	2	6	1181037	1181042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3136	NC_015734	TCC	2	6	1182575	1182580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3137	NC_015734	A	6	6	1182582	1182587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3138	NC_015734	GAC	2	6	1182589	1182594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3139	NC_015734	CGT	3	9	1182595	1182603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3140	NC_015734	GCG	2	6	1185057	1185062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3141	NC_015734	GCT	2	6	1185071	1185076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3142	NC_015734	CTA	2	6	1185104	1185109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3143	NC_015734	TC	3	6	1186197	1186202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3144	NC_015734	ATG	2	6	1186280	1186285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3146	NC_015734	GTC	2	6	1188381	1188386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3147	NC_015734	TGGT	2	8	1188545	1188552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3148	NC_015734	ACT	2	6	1188575	1188580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3149	NC_015734	TCC	2	6	1189595	1189600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3150	NC_015734	TCC	2	6	1192199	1192204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3151	NC_015734	TCA	2	6	1192485	1192490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3153	NC_015734	ATT	2	6	1193506	1193511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3154	NC_015734	TAA	2	6	1193556	1193561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3155	NC_015734	T	7	7	1193579	1193585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3156	NC_015734	GATA	2	8	1193598	1193605	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3164	NC_015734	TTTA	2	8	1195147	1195154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3165	NC_015734	AACT	2	8	1195201	1195208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3166	NC_015734	CTT	2	6	1195218	1195223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3169	NC_015734	AATGG	2	10	1195359	1195368	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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3172	NC_015734	TCAT	2	8	1195438	1195445	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3173	NC_015734	CCT	2	6	1195448	1195453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3175	NC_015734	ATA	2	6	1195540	1195545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3176	NC_015734	TTC	2	6	1197825	1197830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3178	NC_015734	TAA	2	6	1197844	1197849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3179	NC_015734	GAAA	2	8	1197862	1197869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3186	NC_015734	A	7	7	1203967	1203973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3194	NC_015734	TA	3	6	1204267	1204272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3195	NC_015734	A	6	6	1204338	1204343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3199	NC_015734	CT	3	6	1205302	1205307	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3200	NC_015734	CTATA	2	10	1205313	1205322	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3211	NC_015734	T	6	6	1208051	1208056	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3212	NC_015734	T	7	7	1208087	1208093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3213	NC_015734	ACCA	2	8	1208101	1208108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3230	NC_015734	TGT	2	6	1212101	1212106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3232	NC_015734	A	8	8	1212254	1212261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_015734	TA	4	8	1212308	1212315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3237	NC_015734	CTCA	2	8	1215914	1215921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3247	NC_015734	AT	4	8	1216291	1216298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3248	NC_015734	AT	3	6	1216310	1216315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3249	NC_015734	CAT	2	6	1216319	1216324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3251	NC_015734	ATAA	2	8	1216381	1216388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_015734	CAA	2	6	1216397	1216402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3253	NC_015734	TAT	2	6	1216420	1216425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3254	NC_015734	T	7	7	1216425	1216431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_015734	TGA	2	6	1217005	1217010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3257	NC_015734	CACC	2	8	1217134	1217141	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3258	NC_015734	ACT	2	6	1217152	1217157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3260	NC_015734	GGA	2	6	1217276	1217281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_015734	TA	3	6	1218893	1218898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_015734	T	6	6	1218983	1218988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3263	NC_015734	T	7	7	1219028	1219034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_015734	AAT	2	6	1219039	1219044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_015734	AATCA	2	10	1219049	1219058	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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