MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR584

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015701	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015701	TAA	2	6	56	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015701	ACC	2	6	102	107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015701	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015701	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015701	TAT	2	6	331	336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015701	ACA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_015701	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015701	CAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015701	AAC	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015701	TCA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015701	CAC	2	6	1813	1818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015701	CGG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015701	ACT	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015701	AGT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015701	CTT	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015701	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015701	TAT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015701	TTA	2	6	3740	3745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015701	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015701	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015701	TCC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015701	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015701	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015701	ATT	3	9	4378	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015701	ATG	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015701	CAT	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015701	TGC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015701	CAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_015701	AAC	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015701	ACA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015701	TAT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015701	CAT	3	9	5801	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015701	ACA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015701	ATC	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015701	TAA	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015701	ATA	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015701	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015701	TAG	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015701	CTT	2	6	6075	6080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015701	TGT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015701	GTA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015701	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015701	GTA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015701	ATA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015701	GTA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015701	TAC	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015701	TAC	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015701	GTA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015701	ATT	2	6	6674	6679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015701	ATT	2	6	6694	6699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015701	TAC	2	6	6709	6714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015701	GTA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015701	TAT	3	9	6841	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015701	TAC	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015701	TAG	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015701	TAA	2	6	8888	8893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015701	GAA	2	6	8894	8899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015701	ATA	2	6	8900	8905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015701	GTT	2	6	13727	13732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015701	CCA	2	6	13736	13741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_015701	TAC	2	6	13751	13756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015701	CCA	2	6	13804	13809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_015701	TCC	2	6	13980	13985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015701	TTA	2	6	14004	14009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015701	TCA	2	6	14691	14696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015701	GCA	2	6	17309	17314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015701	TCC	2	6	17782	17787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_015701	TTA	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015701	AAT	2	6	17853	17858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015701	ATA	2	6	17905	17910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015701	TCT	2	6	18008	18013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015701	TCC	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015701	ATA	2	6	19038	19043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.