MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR584

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015701	ATT	2	6	4	9	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015701	TAA	2	6	56	61	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015701	ACC	2	6	102	107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_015701	CA	3	6	159	164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_015701	A	6	6	170	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015701	CG	3	6	194	199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_015701	A	7	7	208	214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015701	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015701	TAT	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015701	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015701	TAT	2	6	331	336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015701	A	6	6	1331	1336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015701	ACAA	2	8	1380	1387	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015701	A	6	6	1392	1397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015701	A	6	6	1436	1441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015701	T	6	6	1457	1462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015701	CCAA	2	8	1515	1522	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015701	ACA	2	6	1535	1540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015701	T	6	6	1542	1547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015701	TCA	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015701	CAA	2	6	1589	1594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015701	AAC	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015701	TCA	2	6	1683	1688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015701	GC	3	6	1741	1746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015701	CAC	2	6	1813	1818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_015701	CGTA	2	8	1819	1826	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_015701	CGG	2	6	1839	1844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015701	ACT	2	6	3300	3305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015701	AGT	2	6	3473	3478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015701	AGTT	2	8	3511	3518	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015701	CTT	2	6	3534	3539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015701	CTTC	2	8	3568	3575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_015701	ACT	2	6	3623	3628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015701	AAAAAG	2	12	3682	3693	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015701	TAT	2	6	3700	3705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015701	CTTTT	2	10	3714	3723	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015701	TTA	2	6	3740	3745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015701	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015701	AT	3	6	3751	3756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015701	T	6	6	3764	3769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015701	ATT	2	6	3778	3783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015701	TCC	2	6	4191	4196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015701	T	7	7	4230	4236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015701	CTAC	2	8	4270	4277	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_015701	T	6	6	4296	4301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015701	CAT	2	6	4302	4307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015701	TAA	2	6	4328	4333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015701	A	6	6	4363	4368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015701	ATT	3	9	4378	4386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015701	ATG	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015701	AAACT	2	10	4438	4447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_015701	T	7	7	4450	4456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015701	CAT	2	6	4457	4462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015701	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015701	TGC	2	6	4529	4534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015701	A	7	7	4535	4541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015701	TAAAA	2	10	4624	4633	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015701	TTAAAA	2	12	4658	4669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015701	CAC	2	6	4693	4698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_015701	AAC	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015701	ACA	2	6	4740	4745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015701	A	7	7	4752	4758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015701	TAT	2	6	5663	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015701	CAT	3	9	5801	5809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015701	ACA	2	6	5845	5850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015701	ATC	2	6	5869	5874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015701	AATC	2	8	5875	5882	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015701	TAA	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015701	ATA	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015701	CAGA	2	8	5922	5929	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_015701	ATT	2	6	5958	5963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015701	TAG	2	6	6036	6041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015701	CTT	2	6	6075	6080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015701	GT	3	6	6149	6154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015701	CA	3	6	6220	6225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_015701	T	6	6	6247	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015701	TAAT	2	8	6299	6306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015701	ATAG	2	8	6309	6316	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015701	TGT	2	6	6360	6365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015701	CTTTTT	2	12	6387	6398	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_015701	AAAT	2	8	6420	6427	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015701	TATT	2	8	6454	6461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015701	GTA	2	6	6490	6495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015701	ATT	2	6	6514	6519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015701	GTA	2	6	6524	6529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015701	ATA	2	6	6552	6557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015701	GTA	2	6	6558	6563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015701	TAC	2	6	6575	6580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015701	A	7	7	6609	6615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015701	TAC	2	6	6633	6638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015701	GTA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015701	ATT	2	6	6674	6679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015701	ATT	2	6	6694	6699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015701	TATT	2	8	6701	6708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015701	TAC	2	6	6709	6714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015701	GTA	2	6	6777	6782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015701	T	7	7	6804	6810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015701	TAT	3	9	6841	6849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015701	A	6	6	8143	8148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015701	TAC	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_015701	TAG	2	6	8172	8177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015701	T	6	6	8184	8189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015701	TATTT	2	10	8794	8803	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015701	T	6	6	8801	8806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015701	TAAA	2	8	8819	8826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015701	A	7	7	8824	8830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015701	CATAA	2	10	8871	8880	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_015701	TAA	2	6	8888	8893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015701	GAA	2	6	8894	8899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015701	ATA	2	6	8900	8905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015701	GTT	2	6	13727	13732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015701	CCA	2	6	13736	13741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015701	TAC	2	6	13751	13756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015701	CGAG	2	8	13771	13778	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_015701	CCA	2	6	13804	13809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015701	CT	3	6	13814	13819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_015701	ACGA	2	8	13834	13841	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_015701	TCC	2	6	13980	13985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_015701	T	7	7	13987	13993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015701	TTA	2	6	14004	14009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015701	AT	3	6	14047	14052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015701	A	6	6	14053	14058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015701	TTGT	2	8	14613	14620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015701	TCA	2	6	14691	14696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_015701	ATATA	2	10	14721	14730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015701	ATGA	2	8	17241	17248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015701	GCA	2	6	17309	17314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015701	TCC	2	6	17782	17787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_015701	TTA	2	6	17829	17834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015701	AAT	2	6	17853	17858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015701	A	7	7	17891	17897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015701	ATA	2	6	17905	17910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015701	AT	3	6	17932	17937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015701	TCT	2	6	18008	18013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015701	TCC	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_015701	ATA	2	6	19038	19043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015701	AT	4	8	19049	19056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.