MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR581

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015700	TAA	2	6	13	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015700	TATT	2	8	20	27	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015700	A	6	6	92	97	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015700	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015700	CTT	2	6	556	561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015700	AT	3	6	1241	1246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015700	AT	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015700	AAC	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015700	AACCT	2	10	1330	1339	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_015700	T	6	6	1354	1359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015700	G	8	8	1360	1367	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015700	TA	4	8	1995	2002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015700	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015700	GTT	2	6	2137	2142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015700	AT	3	6	2143	2148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015700	GGA	2	6	2150	2155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015700	AAT	2	6	2164	2169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015700	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015700	AAG	2	6	2427	2432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015700	TGT	2	6	2452	2457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015700	CT	3	6	2493	2498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_015700	TCC	2	6	4490	4495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_015700	CAG	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015700	GAT	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015700	A	6	6	4660	4665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015700	TTTA	2	8	4723	4730	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015700	T	6	6	4749	4754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015700	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015700	TTC	2	6	4823	4828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015700	CTG	2	6	4884	4889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015700	TTGG	2	8	4896	4903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015700	GTG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015700	AGAA	2	8	4971	4978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015700	AT	3	6	4979	4984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015700	GGGA	2	8	4992	4999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015700	CCG	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_015700	TAGTG	2	10	5081	5090	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015700	TCTA	2	8	5098	5105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015700	TTGC	2	8	5116	5123	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015700	ATA	2	6	5431	5436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015700	TTAT	2	8	5437	5444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015700	ATA	2	6	5459	5464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015700	TAT	2	6	6180	6185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015700	ATAA	2	8	6207	6214	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015700	AAAT	2	8	6609	6616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015700	AGT	2	6	8099	8104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015700	TAA	2	6	8158	8163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015700	TTA	2	6	8164	8169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015700	GAA	2	6	8254	8259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015700	TATT	2	8	9765	9772	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015700	TAA	3	9	9829	9837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015700	A	6	6	9874	9879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015700	A	6	6	9892	9897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015700	CAT	2	6	12049	12054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015700	TAA	2	6	12069	12074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015700	GTCG	2	8	12135	12142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015700	CTG	2	6	12145	12150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.