MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR585

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015698	TTAT	2	8	6	13	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015698	T	7	7	47	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015698	CG	3	6	62	67	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_015698	T	6	6	86	91	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015698	TG	3	6	97	102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015698	TGG	2	6	153	158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015698	TATT	2	8	197	204	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015698	ATA	2	6	253	258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015698	A	7	7	270	276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015698	TGAC	2	8	278	285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015698	AAT	2	6	291	296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015698	GTCA	2	8	307	314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_015698	AGG	2	6	383	388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015698	A	6	6	3570	3575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015698	A	6	6	3654	3659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015698	ATA	2	6	4308	4313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015698	TTTG	2	8	5347	5354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015698	TGA	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015698	ACA	2	6	5527	5532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015698	TCG	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015698	AGC	2	6	6459	6464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015698	AGTG	2	8	6477	6484	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015698	T	7	7	6501	6507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015698	CCT	2	6	7155	7160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015698	TCT	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015698	TA	3	6	7212	7217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015698	AAC	2	6	7220	7225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015698	TAA	2	6	7236	7241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015698	TAAA	2	8	7243	7250	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015698	T	6	6	7277	7282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015698	A	6	6	7286	7291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015698	A	6	6	7302	7307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015698	A	7	7	7325	7331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015698	G	6	6	7345	7350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015698	TAC	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015698	AGGG	2	8	7371	7378	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015698	GTT	2	6	8530	8535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015698	AAG	2	6	8546	8551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015698	CCT	2	6	9038	9043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_015698	ATTGCT	2	12	9071	9082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_015698	TAAA	2	8	9141	9148	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015698	AATT	2	8	9249	9256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015698	AGA	2	6	9259	9264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015698	GCC	2	6	9332	9337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_015698	GGC	2	6	9351	9356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015698	CAG	2	6	9388	9393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015698	TAA	2	6	9459	9464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015698	ATA	2	6	9496	9501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015698	AGA	2	6	9578	9583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015698	AACC	2	8	9611	9618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_015698	ACAAGG	2	12	9628	9639	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_015698	GA	3	6	9730	9735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015698	GA	3	6	9780	9785	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015698	CTC	2	6	9818	9823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015698	ATGG	2	8	9827	9834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015698	AAT	2	6	9836	9841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015698	CAT	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015698	TAA	2	6	12139	12144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015698	ACA	2	6	12261	12266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015698	CAA	2	6	12268	12273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015698	CTT	2	6	12681	12686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015698	AC	3	6	13356	13361	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_015698	A	6	6	13368	13373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015698	TA	4	8	14106	14113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.