MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 1052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015697	TAAT	2	8	1150	1157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015697	TAAT	2	8	11844	11851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015697	CAAT	2	8	13410	13417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015697	AGTA	2	8	29114	29121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015697	TATG	2	8	29144	29151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015697	CAAT	2	8	32149	32156	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015697	CGTA	2	8	33583	33590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015697	AAAT	2	8	36661	36668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015697	CAAT	2	8	36858	36865	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015697	CTTT	2	8	41249	41256	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_015697	TCCT	2	8	43773	43780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015697	ATTT	2	8	43804	43811	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015697	ATGA	2	8	43887	43894	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015697	CTAT	2	8	45011	45018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_015697	CATA	2	8	45215	45222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_015697	CTGT	2	8	45585	45592	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015697	CCTA	2	8	45821	45828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015697	GGCT	2	8	46194	46201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_015697	TGCA	2	8	47324	47331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_015697	TCGC	2	8	47710	47717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015697	TTTC	2	8	47738	47745	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_015697	GCTA	2	8	47793	47800	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_015697	TTAA	2	8	48016	48023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015697	CACG	2	8	49254	49261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_015697	CAAA	2	8	49514	49521	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015697	CACT	2	8	49620	49627	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_015697	ATCA	2	8	49659	49666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_015697	ATTA	2	8	49920	49927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015697	TAAA	2	8	50082	50089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015697	TATC	2	8	50110	50117	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_015697	ATTT	2	8	57352	57359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015697	GAAC	2	8	58694	58701	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_015697	GCAA	2	8	63177	63184	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_015697	CAGT	2	8	69617	69624	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015697	GAAC	2	8	70300	70307	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015697	GTGA	2	8	72276	72283	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015697	TAAA	2	8	75013	75020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015697	CAAA	2	8	75107	75114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_015697	CGAG	2	8	75316	75323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015697	TCCT	2	8	77695	77702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_015697	TCTA	2	8	78279	78286	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_015697	ATAA	2	8	78416	78423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015697	ATTC	2	8	78939	78946	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015697	TTGA	2	8	78999	79006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015697	TATT	2	8	79096	79103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015697	AAAT	2	8	79118	79125	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015697	ATTA	2	8	81211	81218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015697	CAAA	2	8	82067	82074	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015697	ATAA	2	8	82335	82342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015697	GACA	2	8	82687	82694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_015697	TTCC	2	8	84858	84865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_015697	CGTA	2	8	84916	84923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_015697	GCTT	2	8	86174	86181	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015697	CTTC	2	8	86389	86396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_015697	AAAG	2	8	86609	86616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015697	TAAT	2	8	94017	94024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015697	TTAA	2	8	95120	95127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015697	TAAT	2	8	95131	95138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015697	CATC	2	8	95181	95188	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_015697	TAGC	2	8	98851	98858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_015697	AAAT	2	8	101433	101440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015697	TGAC	2	8	113192	113199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_015697	GTCA	2	8	113299	113306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_015697	TAAA	2	8	113416	113423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015697	CGTT	2	8	114852	114859	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_015697	TCTA	2	8	117556	117563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015697	CTAA	2	8	119813	119820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015697	TAAA	2	8	121351	121358	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015697	CGTA	2	8	125367	125374	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_015697	AGTT	2	8	127059	127066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015697	CTTC	2	8	127116	127123	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015697	GAAA	2	8	127242	127249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015697	CGAA	2	8	127948	127955	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015697	CACT	2	8	130005	130012	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_015697	AATT	2	8	131346	131353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015697	GCAA	2	8	133485	133492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015697	AGTT	2	8	133764	133771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015697	GAAC	2	8	134381	134388	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_015697	CTTT	2	8	136181	136188	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015697	ATTT	2	8	142220	142227	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015697	TCAA	2	8	143700	143707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015697	ATCA	2	8	145279	145286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015697	GAAG	2	8	145311	145318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015697	GAAA	2	8	145320	145327	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015697	AATT	2	8	145617	145624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015697	CAAC	2	8	147435	147442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015697	GATC	2	8	148882	148889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_015697	ACTA	2	8	151067	151074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_015697	ACCC	2	8	165743	165750	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_015697	AATT	2	8	165758	165765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015697	TAAT	2	8	168318	168325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015697	TTTC	2	8	168356	168363	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_015697	CTTT	2	8	175666	175673	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015697	TATT	2	8	180266	180273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015697	TTGC	2	8	180350	180357	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015697	ATGT	2	8	180366	180373	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015697	ATTT	2	8	188313	188320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015697	GATC	2	8	193756	193763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_015697	TCGC	2	8	194728	194735	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_015697	AATA	2	8	197625	197632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015697	ATTT	2	8	199790	199797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015697	CTTT	2	8	201187	201194	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_015697	ACTA	2	8	202447	202454	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015697	ATCT	2	8	205686	205693	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_015697	TTTA	2	8	207020	207027	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015697	ATAA	2	8	210238	210245	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015697	TTTA	2	8	210454	210461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015697	TTAT	2	8	210468	210475	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015697	CTTT	2	8	217096	217103	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015697	TTAA	2	8	226286	226293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015697	TAAT	2	8	226695	226702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015697	TCGT	2	8	229691	229698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015697	TAAA	2	8	231415	231422	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015697	AAAG	2	8	233917	233924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015697	TCAT	2	8	242789	242796	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_015697	TTTC	2	8	242850	242857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015697	AAAT	2	8	254203	254210	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015697	ATCC	2	8	254235	254242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015697	GAAG	2	8	255545	255552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015697	AATA	2	8	256197	256204	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015697	TTAT	2	8	258292	258299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015697	AGCA	2	8	258455	258462	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_015697	TACT	2	8	258469	258476	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_015697	CGTA	2	8	261926	261933	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_015697	AGTT	2	8	263618	263625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015697	CTTC	2	8	263675	263682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015697	TAAA	2	8	264863	264870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015697	CTTA	2	8	273393	273400	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_015697	TTTG	2	8	274429	274436	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015697	TAAC	2	8	276426	276433	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_015697	TTAG	2	8	276446	276453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015697	GCAA	2	8	276792	276799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_015697	TGCA	2	8	276962	276969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015697	AGTT	2	8	281668	281675	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015697	CAGG	2	8	282165	282172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_015697	ACTA	2	8	282244	282251	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_015697	TTTA	2	8	282301	282308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015697	CGTA	2	8	283966	283973	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_015697	TTAG	2	8	284068	284075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015697	GCTT	2	8	285494	285501	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_015697	CTTC	2	8	285709	285716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_015697	TAAT	2	8	287931	287938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015697	TAAA	2	8	292599	292606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015697	CAAC	2	8	299701	299708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_015697	AAAT	2	8	300296	300303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015697	TCAA	2	8	307471	307478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015697	CTTT	2	8	308002	308009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_015697	TTTA	2	8	311767	311774	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015697	TAAA	2	8	312084	312091	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015697	CGTA	2	8	314029	314036	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_015697	TTAG	2	8	314131	314138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015697	AGTT	2	8	315721	315728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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