MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 7083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015697	GTGA	2	8	1304381	1304388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015697	TGT	2	6	1304414	1304419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_015697	GAA	2	6	1304424	1304429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015697	CGTG	2	8	1304430	1304437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_015697	CAG	2	6	1304496	1304501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015697	AGCG	2	8	1304551	1304558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_015697	GAA	2	6	1304602	1304607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015697	AGA	2	6	1304637	1304642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_015697	AT	3	6	1304681	1304686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015697	GAA	2	6	1304688	1304693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015697	GGC	2	6	1304707	1304712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_015697	GTCTG	2	10	1304714	1304723	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4013	NC_015697	G	6	6	1304903	1304908	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_015697	GAA	2	6	1304952	1304957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_015697	GGT	2	6	1305026	1305031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015697	GTC	3	9	1305037	1305045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015697	TCGTG	2	10	1305049	1305058	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4018	NC_015697	GGA	2	6	1305152	1305157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015697	GAC	2	6	1305165	1305170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_015697	ATC	2	6	1305176	1305181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015697	AC	3	6	1305203	1305208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_015697	AC	3	6	1305372	1305377	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4023	NC_015697	GGAG	2	8	1305433	1305440	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_015697	CCT	2	6	1305514	1305519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4025	NC_015697	GAA	2	6	1305550	1305555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_015697	AACAA	2	10	1305630	1305639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4027	NC_015697	TTAA	2	8	1305669	1305676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015697	TAGC	2	8	1305892	1305899	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4029	NC_015697	TAG	2	6	1305930	1305935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_015697	AGAA	2	8	1305946	1305953	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015697	GCG	2	6	1305972	1305977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_015697	CAA	2	6	1306001	1306006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_015697	GCTT	2	8	1306007	1306014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_015697	CT	3	6	1306121	1306126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_015697	CGG	2	6	1306144	1306149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_015697	TGCA	2	8	1306361	1306368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4037	NC_015697	AAG	2	6	1306422	1306427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015697	GGA	2	6	1306496	1306501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015697	TC	3	6	1306582	1306587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_015697	AT	3	6	1306783	1306788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015697	AGC	2	6	1306842	1306847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_015697	GCG	2	6	1306975	1306980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_015697	TGG	2	6	1306999	1307004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015697	TCC	2	6	1307096	1307101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_015697	GCCGAG	2	12	1307122	1307133	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_015697	AGG	2	6	1307203	1307208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015697	AGT	2	6	1307359	1307364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015697	GAG	2	6	1307399	1307404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015697	GA	3	6	1307422	1307427	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015697	CGG	2	6	1307648	1307653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_015697	GA	3	6	1307746	1307751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015697	TGAAAT	2	12	1307757	1307768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015697	TAGG	2	8	1307864	1307871	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015697	TGG	2	6	1307910	1307915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_015697	TAC	2	6	1307918	1307923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4057	NC_015697	CCT	2	6	1308006	1308011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_015697	GACA	2	8	1308099	1308106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4059	NC_015697	GGT	2	6	1308142	1308147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015697	CGT	2	6	1308337	1308342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_015697	GTT	2	6	1308440	1308445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015697	TATG	2	8	1308470	1308477	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015697	GAGAT	2	10	1308521	1308530	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015697	GAT	2	6	1308566	1308571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015697	TGGAAG	2	12	1308585	1308596	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015697	ATAG	2	8	1308674	1308681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015697	GTG	2	6	1308728	1308733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015697	ATG	2	6	1308734	1308739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015697	AGT	2	6	1308799	1308804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015697	TCTTT	2	10	1308876	1308885	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4071	NC_015697	TAAT	2	8	1308903	1308910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015697	TTA	2	6	1308920	1308925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_015697	TTA	2	6	1309019	1309024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_015697	AT	3	6	1309032	1309037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_015697	TATT	2	8	1309072	1309079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_015697	A	8	8	1309110	1309117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015697	AT	3	6	1309160	1309165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4085	NC_015697	T	6	6	1309343	1309348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_015697	GTT	2	6	1309369	1309374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4089	NC_015697	AGTTT	2	10	1309704	1309713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015697	TTA	2	6	1309722	1309727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015697	TGA	2	6	1309732	1309737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015697	ATT	2	6	1309768	1309773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015697	TAA	2	6	1309824	1309829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015697	T	8	8	1309882	1309889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_015697	ATG	2	6	1309910	1309915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015697	GTATT	2	10	1309924	1309933	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015697	TGAC	2	8	1309975	1309982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_015697	TGA	2	6	1310010	1310015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015697	T	6	6	1310038	1310043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015697	GAG	2	6	1310056	1310061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015697	AATT	2	8	1318579	1318586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015697	GGGAT	2	10	1318597	1318606	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015697	CA	3	6	1318681	1318686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4104	NC_015697	CTAA	2	8	1318707	1318714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_015697	GGA	2	6	1318724	1318729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015697	TTG	2	6	1318767	1318772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4108	NC_015697	CGTA	2	8	1318948	1318955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4109	NC_015697	GGT	2	6	1318957	1318962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015697	GT	3	6	1318961	1318966	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015697	CCT	2	6	1318994	1318999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_015697	TA	3	6	1319018	1319023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015697	AGAGT	2	10	1319068	1319077	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015697	TCG	2	6	1319082	1319087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4118	NC_015697	TA	3	6	1319127	1319132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015697	TATAA	2	10	1319136	1319145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015697	TAA	2	6	1322357	1322362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015697	TAG	2	6	1322389	1322394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015697	T	6	6	1322414	1322419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015697	GTTT	2	8	1322421	1322428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015697	GAA	2	6	1322529	1322534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4126	NC_015697	TTTG	2	8	1322629	1322636	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_015697	GAT	2	6	1322685	1322690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015697	GCAC	2	8	1322710	1322717	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4129	NC_015697	TTGT	2	8	1322733	1322740	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_015697	ATG	2	6	1322815	1322820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4132	NC_015697	TTC	2	6	1322942	1322947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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