MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 7083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_015697	CTTC	2	8	315778	315785	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1004	NC_015697	TTG	2	6	315949	315954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_015697	TTA	2	6	315965	315970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_015697	TTAA	2	8	316698	316705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_015697	ACT	2	6	316729	316734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_015697	T	6	6	316795	316800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_015697	T	7	7	316819	316825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_015697	ATT	2	6	316900	316905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_015697	A	7	7	316907	316913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_015697	T	6	6	316921	316926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_015697	GAC	2	6	316930	316935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1018	NC_015697	T	6	6	318745	318750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015697	ATA	2	6	318766	318771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015697	TGG	2	6	318772	318777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_015697	TGG	2	6	318805	318810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015697	ATA	2	6	320059	320064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_015697	T	7	7	320070	320076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_015697	A	7	7	320085	320091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_015697	ATC	2	6	320098	320103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1029	NC_015697	TTAT	2	8	320972	320979	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_015697	GTT	2	6	320998	321003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1032	NC_015697	TAA	2	6	321101	321106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_015697	ATA	3	9	321205	321213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_015697	AGA	2	6	321240	321245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1042	NC_015697	ATT	2	6	325188	325193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_015697	TATTC	2	10	325213	325222	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1047	NC_015697	TAT	2	6	325312	325317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1059	NC_015697	A	6	6	328833	328838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_015697	TTTAAT	2	12	328848	328859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1063	NC_015697	ATG	2	6	329074	329079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_015697	ATT	2	6	329103	329108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_015697	TAGCT	2	10	329163	329172	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1066	NC_015697	CTAA	2	8	329288	329295	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1072	NC_015697	TAG	2	6	329502	329507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_015697	ACC	2	6	329592	329597	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1101	NC_015697	TC	3	6	331484	331489	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_015697	TC	3	6	331504	331509	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_015697	ACT	2	6	331547	331552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1105	NC_015697	CTCGGC	2	12	331778	331789	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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1109	NC_015697	TGG	2	6	332059	332064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015697	AT	3	6	332123	332128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015697	GA	3	6	332324	332329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015697	TCC	2	6	332410	332415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1114	NC_015697	TGCA	2	8	332543	332550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1115	NC_015697	CCG	2	6	332762	332767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1117	NC_015697	CAA	2	6	332893	332898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_015697	TTG	2	6	332905	332910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_015697	TCGC	2	8	332929	332936	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_015697	TTTC	2	8	332957	332964	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_015697	CTA	2	6	332976	332981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_015697	GCTA	2	8	333012	333019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_015697	TTAA	2	8	333235	333242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_015697	TTGTT	2	10	333272	333281	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_015697	CCT	2	6	333373	333378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1127	NC_015697	AGG	2	6	333593	333598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_015697	GT	3	6	333735	333740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_015697	GT	3	6	333904	333909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_015697	ATG	2	6	333929	333934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_015697	CGT	2	6	333941	333946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_015697	TCC	2	6	333955	333960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_015697	CACGA	2	10	334054	334063	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1136	NC_015697	CAC	2	6	334080	334085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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