MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 390

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015638	CTAAA	2	10	8253	8262	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_015638	TAAAG	2	10	12161	12170	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015638	ATTTA	2	10	14745	14754	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015638	AAAAT	2	10	17029	17038	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015638	TTTTA	2	10	17260	17269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015638	ATTAT	2	10	20390	20399	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015638	TCCGA	2	10	34972	34981	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_015638	CTACA	2	10	35589	35598	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_015638	TCAAT	2	10	36383	36392	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_015638	TTTTA	2	10	36768	36777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015638	CTTAA	2	10	40460	40469	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_015638	ATTTA	2	10	83678	83687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015638	TAAAA	2	10	90484	90493	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015638	TTTTC	2	10	100128	100137	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_015638	TTAAA	2	10	105182	105191	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015638	AATAC	2	10	135130	135139	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_015638	AATTT	2	10	148434	148443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015638	TTTTA	2	10	157846	157855	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015638	TTTTA	2	10	171915	171924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015638	ATTTA	2	10	201778	201787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015638	AATTT	2	10	201817	201826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015638	TGTTT	2	10	229684	229693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015638	AATTT	2	10	249199	249208	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015638	AAATT	2	10	250283	250292	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015638	AAAAC	2	10	274718	274727	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_015638	AAATT	2	10	276612	276621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015638	TTGCT	2	10	283648	283657	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_015638	TGCGT	2	10	298091	298100	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_015638	TTATA	2	10	298152	298161	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015638	TAAAC	2	10	331929	331938	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_015638	ATTTT	2	10	373316	373325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015638	ATTTA	2	10	385376	385385	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015638	TGCAT	2	10	401891	401900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_015638	ATATT	2	10	407652	407661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015638	TAATT	2	10	418841	418850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015638	TTAAA	2	10	431315	431324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015638	CAAAA	2	10	432498	432507	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015638	TAAAT	2	10	458543	458552	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015638	TAAAA	2	10	458587	458596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015638	AAATA	2	10	458697	458706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015638	TTTAA	2	10	480493	480502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015638	TTTAA	2	10	480957	480966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015638	TTAGT	2	10	485315	485324	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015638	AATTA	2	10	501442	501451	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015638	ATATT	2	10	505340	505349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015638	ACTTT	2	10	511543	511552	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015638	TTTTA	2	10	519237	519246	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015638	AATTA	2	10	526033	526042	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015638	TTGGT	2	10	533191	533200	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015638	AAAAC	2	10	534212	534221	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_015638	ATATA	2	10	549421	549430	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015638	ATAGT	2	10	560163	560172	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015638	AAACT	2	10	565110	565119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_015638	ATTTT	2	10	574677	574686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015638	TAATA	2	10	575365	575374	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015638	TAAAA	2	10	587153	587162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015638	AACAA	2	10	590343	590352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_015638	TTGGG	2	10	597517	597526	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015638	TGCAA	2	10	599574	599583	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_015638	GATTT	2	10	613447	613456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015638	TCTTA	2	10	619167	619176	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_015638	TAAAA	2	10	619210	619219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015638	TTTAG	2	10	626401	626410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015638	AATAA	2	10	630279	630288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015638	TACTT	2	10	641978	641987	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015638	AGAAA	2	10	643847	643856	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015638	CGCTA	2	10	646128	646137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_015638	GCTTC	2	10	646188	646197	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_015638	TGAAT	2	10	647225	647234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015638	AGAAA	2	10	649256	649265	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015638	TAAAT	2	10	654038	654047	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015638	AAATT	2	10	664253	664262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015638	CTAAA	2	10	670618	670627	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_015638	ATTAA	2	10	680211	680220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015638	TAAAT	2	10	687337	687346	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015638	CTATT	2	10	687432	687441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_015638	AAATT	2	10	694964	694973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015638	TTTAG	2	10	695238	695247	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015638	TATAT	2	10	728070	728079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015638	TGTTT	2	10	733873	733882	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015638	AAACA	2	10	744038	744047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015638	TTTTA	2	10	750694	750703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015638	TATTT	2	10	767519	767528	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015638	AAGTA	2	10	786276	786285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015638	ATTTA	2	10	789353	789362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015638	AATTT	3	15	789401	789415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015638	AAATA	2	10	789522	789531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015638	ACAAA	2	10	790504	790513	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_015638	TTTAG	2	10	790554	790563	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015638	TTCTT	2	10	791444	791453	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_015638	TAAAA	2	10	815874	815883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015638	ATTTT	2	10	816655	816664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015638	AAAAT	2	10	816897	816906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015638	AATAT	2	10	822857	822866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015638	TTAAT	2	10	846908	846917	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015638	ATATT	2	10	851741	851750	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015638	AACAT	2	10	851937	851946	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_015638	TAAAC	2	10	851993	852002	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_015638	TATAA	2	10	870725	870734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015638	AAAAT	2	10	879623	879632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015638	TTTTA	2	10	888753	888762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015638	AATTT	2	10	908907	908916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015638	TTGAA	2	10	927905	927914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015638	AGGTT	2	10	932739	932748	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015638	TTTAC	2	10	935378	935387	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015638	ACCAA	2	10	943116	943125	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_015638	TAAAA	2	10	945883	945892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015638	TTTTA	2	10	963677	963686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015638	TAAAT	2	10	970946	970955	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015638	ATTAA	2	10	970956	970965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015638	AAAGT	2	10	1007559	1007568	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015638	TATTT	2	10	1008160	1008169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015638	AATTT	2	10	1010968	1010977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015638	AGGTT	2	10	1031593	1031602	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015638	TAATA	2	10	1031647	1031656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015638	ATATT	2	10	1043048	1043057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015638	TGCTA	2	10	1048228	1048237	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_015638	AAAAC	2	10	1058759	1058768	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_015638	AACAT	2	10	1062473	1062482	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_015638	ATTAT	2	10	1083558	1083567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015638	TAAAA	2	10	1083898	1083907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015638	TCTTT	2	10	1083916	1083925	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015638	ACACT	2	10	1085049	1085058	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_015638	TTACT	2	10	1087885	1087894	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_015638	TTTTG	2	10	1103414	1103423	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015638	TAAAA	2	10	1107509	1107518	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015638	TTATG	2	10	1107574	1107583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015638	TTATG	2	10	1107811	1107820	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015638	TTTAA	2	10	1110867	1110876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015638	TTATT	2	10	1114607	1114616	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015638	TAAAG	2	10	1159982	1159991	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015638	TATAT	2	10	1163531	1163540	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015638	GTAGT	2	10	1163827	1163836	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015638	AGCTA	2	10	1164015	1164024	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015638	TCAAT	2	10	1175979	1175988	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015638	AACTT	2	10	1187613	1187622	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015638	CCTTT	2	10	1207548	1207557	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015638	GTAAA	2	10	1222083	1222092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015638	TAAAT	2	10	1227184	1227193	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015638	AAACC	2	10	1229438	1229447	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_015638	ATTTT	2	10	1235403	1235412	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015638	ATCAA	2	10	1236900	1236909	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_015638	AAAAC	2	10	1236964	1236973	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015638	TATAT	2	10	1240753	1240762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015638	AATAG	2	10	1241895	1241904	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015638	TTCTT	2	10	1250517	1250526	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_015638	TTAAA	2	10	1252672	1252681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_015638	TTTAA	2	10	1300047	1300056	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_015638	TAAAA	2	10	2506599	2506608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_015638	TTGAC	2	10	2526983	2526992	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
285	NC_015638	TATTT	2	10	2531598	2531607	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.