MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lacinutrix sp. 5H-3-7-4 chromosome

Total Repeats: 8112

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015638	T	7	7	3236381	3236387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_015638	GAAAA	2	10	3236394	3236403	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_015638	TAA	2	6	3237080	3237085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_015638	CTT	2	6	3237102	3237107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_015638	ATA	2	6	3237126	3237131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_015638	TTGGT	2	10	3237191	3237200	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_015638	AAT	2	6	3237201	3237206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_015638	A	7	7	3238441	3238447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_015638	A	7	7	3238489	3238495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_015638	CTAC	2	8	3238502	3238509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8011	NC_015638	GGA	2	6	3238553	3238558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_015638	T	6	6	3238627	3238632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_015638	TAA	2	6	3238644	3238649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_015638	ATTA	2	8	3238664	3238671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_015638	A	7	7	3241753	3241759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_015638	T	7	7	3241777	3241783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_015638	ATA	2	6	3241790	3241795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_015638	TAA	3	9	3241796	3241804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_015638	T	7	7	3243091	3243097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_015638	T	8	8	3243128	3243135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_015638	TTA	2	6	3243165	3243170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_015638	AT	3	6	3243196	3243201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_015638	T	6	6	3243220	3243225	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_015638	A	8	8	3243248	3243255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_015638	A	6	6	3243284	3243289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_015638	T	6	6	3244591	3244596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_015638	T	6	6	3244646	3244651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_015638	TGGCA	2	10	3244657	3244666	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8029	NC_015638	AAG	2	6	3244704	3244709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_015638	A	7	7	3245894	3245900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_015638	TA	3	6	3245941	3245946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_015638	T	6	6	3246340	3246345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_015638	A	7	7	3246359	3246365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_015638	ATT	2	6	3246390	3246395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_015638	T	7	7	3246394	3246400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_015638	A	6	6	3246403	3246408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_015638	ATA	2	6	3249808	3249813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_015638	T	6	6	3249931	3249936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_015638	GGTAA	2	10	3249952	3249961	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_015638	TAA	2	6	3249991	3249996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_015638	TA	3	6	3252625	3252630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_015638	ATAAA	2	10	3252673	3252682	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_015638	GTTA	3	12	3252712	3252723	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_015638	T	6	6	3252763	3252768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_015638	ATTT	2	8	3252769	3252776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_015638	T	8	8	3252774	3252781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_015638	T	7	7	3255726	3255732	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_015638	A	6	6	3256216	3256221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_015638	TTTTTA	2	12	3256250	3256261	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_015638	A	6	6	3256268	3256273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_015638	A	8	8	3256292	3256299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_015638	TAA	2	6	3256309	3256314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_015638	T	7	7	3256325	3256331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_015638	AT	3	6	3258804	3258809	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_015638	AGC	2	6	3258822	3258827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_015638	TTAAT	2	10	3260048	3260057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_015638	A	6	6	3260066	3260071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_015638	A	7	7	3260126	3260132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_015638	ATG	2	6	3261141	3261146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_015638	TAT	2	6	3261147	3261152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_015638	TAA	3	9	3261160	3261168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_015638	ATA	2	6	3261196	3261201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_015638	T	7	7	3261202	3261208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_015638	A	6	6	3262139	3262144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_015638	TAA	2	6	3262155	3262160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_015638	ATT	2	6	3263440	3263445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_015638	TAG	2	6	3267897	3267902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_015638	A	6	6	3269186	3269191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_015638	T	7	7	3269216	3269222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_015638	TACA	2	8	3274145	3274152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8071	NC_015638	A	7	7	3274163	3274169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_015638	TA	3	6	3274201	3274206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_015638	TTA	2	6	3274213	3274218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_015638	TAT	2	6	3276568	3276573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_015638	ATA	2	6	3276593	3276598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_015638	TA	3	6	3276641	3276646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_015638	T	7	7	3276669	3276675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_015638	ATTA	2	8	3276684	3276691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_015638	ATT	2	6	3276694	3276699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_015638	TTAT	2	8	3276706	3276713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_015638	A	6	6	3276716	3276721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_015638	AT	3	6	3276756	3276761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_015638	GTT	2	6	3277600	3277605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_015638	TAGT	2	8	3277609	3277616	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8085	NC_015638	CTA	2	6	3277618	3277623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8086	NC_015638	T	6	6	3277635	3277640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_015638	AAT	2	6	3277666	3277671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_015638	TAA	2	6	3279332	3279337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8089	NC_015638	TAT	2	6	3282648	3282653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_015638	TG	3	6	3282706	3282711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_015638	CTAA	2	8	3284178	3284185	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_015638	TAA	2	6	3284201	3284206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_015638	AAACC	2	10	3285923	3285932	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8094	NC_015638	TGT	2	6	3287102	3287107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8095	NC_015638	GT	3	6	3287106	3287111	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8096	NC_015638	ATAA	2	8	3287147	3287154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_015638	T	8	8	3287885	3287892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_015638	AAC	2	6	3287899	3287904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_015638	A	6	6	3287908	3287913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_015638	TATT	2	8	3287944	3287951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_015638	TTA	2	6	3287959	3287964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_015638	CT	3	6	3291986	3291991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8103	NC_015638	A	6	6	3292018	3292023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_015638	ACT	2	6	3292492	3292497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8105	NC_015638	ATT	2	6	3296003	3296008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_015638	T	6	6	3296007	3296012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_015638	A	9	9	3296041	3296049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_015638	T	10	10	3296072	3296081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_015638	T	6	6	3296085	3296090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_015638	A	6	6	3296113	3296118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_015638	ATT	2	6	3296126	3296131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_015638	A	6	6	3296160	3296165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.