MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 plasmid pWW2

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015603	CAG	2	6	26	31	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015603	TCA	2	6	66	71	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015603	ACA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015603	ATA	2	6	2288	2293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015603	AGG	2	6	2650	2655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015603	GGA	2	6	12223	12228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015603	GTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015603	AAC	2	6	16122	16127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015603	CCG	2	6	17556	17561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_015603	CTT	2	6	17842	17847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015603	ATA	2	6	17888	17893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015603	ATG	2	6	17911	17916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015603	ATA	2	6	17988	17993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015603	TAA	2	6	21810	21815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015603	CAA	2	6	21820	21825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015603	AGA	2	6	21857	21862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015603	AAT	2	6	21895	21900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015603	AGT	2	6	22157	22162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015603	ATT	2	6	22224	22229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015603	GAC	2	6	22924	22929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015603	ACT	2	6	22971	22976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_015603	ATA	2	6	23052	23057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015603	TAA	3	9	25559	25567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015603	CAA	2	6	25620	25625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015603	GAT	2	6	25634	25639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015603	AGG	2	6	25645	25650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015603	AAG	2	6	25814	25819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015603	TGC	2	6	25826	25831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015603	GTC	2	6	27528	27533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015603	GAC	2	6	27540	27545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015603	CCA	3	9	27638	27646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015603	TAA	2	6	28060	28065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015603	TAA	2	6	28110	28115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015603	TCT	2	6	28126	28131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015603	AAT	2	6	28298	28303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015603	AAT	2	6	29710	29715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015603	AAT	2	6	30030	30035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015603	TTA	2	6	30100	30105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015603	ACA	2	6	30124	30129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015603	CAA	2	6	30217	30222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015603	CTT	2	6	30234	30239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015603	AAG	2	6	30280	30285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015603	TAA	2	6	30288	30293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015603	GAT	2	6	30299	30304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015603	TAG	2	6	30305	30310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015603	ATC	2	6	30351	30356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015603	CGA	3	9	30687	30695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015603	TGT	2	6	30721	30726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015603	CTC	2	6	30765	30770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015603	TGG	2	6	30836	30841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015603	GAA	2	6	30908	30913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015603	GAA	2	6	30917	30922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015603	AAG	2	6	36082	36087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015603	CTT	2	6	36102	36107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_015603	TGC	2	6	36144	36149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015603	AGG	2	6	36276	36281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015603	ATT	2	6	36365	36370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015603	TAT	2	6	37414	37419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015603	ATT	2	6	37452	37457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015603	TAT	3	9	40402	40410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015603	TAC	2	6	40974	40979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015603	TAA	2	6	41015	41020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015603	ACA	2	6	41101	41106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015603	CAA	2	6	41193	41198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015603	CTT	2	6	41210	41215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015603	AAG	2	6	41256	41261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015603	TAA	2	6	41264	41269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015603	GAT	2	6	41275	41280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015603	TAG	2	6	41281	41286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015603	ATC	2	6	41327	41332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015603	CGA	3	9	41663	41671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_015603	TGT	2	6	41697	41702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015603	CTC	2	6	41741	41746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015603	TGG	2	6	41812	41817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015603	AAC	2	6	41870	41875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015603	AAC	2	6	41952	41957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015603	TGG	2	6	42141	42146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015603	TTA	2	6	42424	42429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015603	TTA	2	6	42526	42531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015603	AGT	2	6	42552	42557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015603	TGG	2	6	42626	42631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015603	TGG	2	6	42978	42983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015603	CAT	2	6	43040	43045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015603	GGT	2	6	43075	43080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015603	ACT	2	6	43476	43481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_015603	AGA	2	6	43526	43531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015603	AAG	2	6	43859	43864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015603	CTT	2	6	43890	43895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015603	CTT	2	6	44287	44292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015603	TGA	2	6	44296	44301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015603	ACT	2	6	44344	44349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015603	CAA	2	6	44372	44377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015603	GTA	2	6	44904	44909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015603	GTA	3	9	44915	44923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015603	ACC	2	6	45975	45980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_015603	AAT	2	6	46221	46226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.