MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 chromosome

Total Repeats: 10220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015602	TAT	2	6	2034335	2034340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_015602	ATT	2	6	2034357	2034362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_015602	AAT	2	6	2034372	2034377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_015602	CTT	2	6	2034410	2034415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_015602	AGA	2	6	2034449	2034454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_015602	GAA	2	6	2034474	2034479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_015602	GAAAA	2	10	2034504	2034513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_015602	AGA	2	6	2034561	2034566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_015602	CT	3	6	2034715	2034720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10010	NC_015602	CAG	3	9	2034789	2034797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_015602	AAG	2	6	2034885	2034890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_015602	ATT	2	6	2034927	2034932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_015602	GTTT	2	8	2034974	2034981	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_015602	ATC	2	6	2035056	2035061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_015602	AAGA	2	8	2035092	2035099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_015602	TGA	2	6	2035103	2035108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_015602	GCA	2	6	2035127	2035132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_015602	CTT	2	6	2035139	2035144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_015602	TGA	2	6	2035289	2035294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_015602	TCATCG	2	12	2035346	2035357	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_015602	AGA	2	6	2035481	2035486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_015602	AAGA	2	8	2035625	2035632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_015602	TCA	2	6	2035655	2035660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_015602	CAG	2	6	2035681	2035686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_015602	AAAT	2	8	2035726	2035733	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_015602	AGT	2	6	2035797	2035802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_015602	TAT	2	6	2035818	2035823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_015602	TTA	2	6	2036138	2036143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_015602	T	8	8	2036156	2036163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_015602	TATT	2	8	2036177	2036184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_015602	ATT	2	6	2037074	2037079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_015602	GTTA	2	8	2037085	2037092	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_015602	AATT	2	8	2038485	2038492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_015602	AATA	2	8	2038493	2038500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_015602	ATG	2	6	2038540	2038545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_015602	TA	3	6	2038563	2038568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_015602	TA	5	10	2038592	2038601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_015602	TAAA	2	8	2038610	2038617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_015602	TA	3	6	2038663	2038668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_015602	AAAT	2	8	2038694	2038701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_015602	TTGC	2	8	2039738	2039745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10042	NC_015602	TAA	2	6	2039778	2039783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_015602	T	6	6	2039787	2039792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_015602	AGGT	2	8	2039798	2039805	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_015602	ATT	2	6	2039806	2039811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_015602	T	6	6	2040638	2040643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_015602	TGAATT	2	12	2040689	2040700	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_015602	TATT	2	8	2040719	2040726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_015602	TAAA	2	8	2042411	2042418	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_015602	CA	3	6	2042437	2042442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10051	NC_015602	TAC	2	6	2042449	2042454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10052	NC_015602	T	6	6	2042461	2042466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_015602	T	6	6	2042509	2042514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_015602	TAGT	2	8	2042524	2042531	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_015602	T	6	6	2042544	2042549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_015602	GGA	2	6	2042642	2042647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_015602	A	6	6	2044647	2044652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_015602	AGTT	2	8	2044654	2044661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_015602	TATCT	2	10	2044991	2045000	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10060	NC_015602	A	6	6	2046413	2046418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_015602	AG	3	6	2046929	2046934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_015602	CTTGA	2	10	2047493	2047502	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10063	NC_015602	ATA	2	6	2047516	2047521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_015602	TTG	2	6	2047525	2047530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_015602	T	7	7	2047571	2047577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_015602	A	6	6	2047594	2047599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_015602	T	6	6	2049296	2049301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_015602	AAT	2	6	2049313	2049318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_015602	A	6	6	2049324	2049329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_015602	CAAA	2	8	2049360	2049367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10071	NC_015602	AGT	2	6	2049374	2049379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_015602	A	6	6	2049394	2049399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_015602	T	7	7	2050902	2050908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_015602	ATT	2	6	2050926	2050931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_015602	T	7	7	2052301	2052307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_015602	A	6	6	2052842	2052847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_015602	T	6	6	2052873	2052878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_015602	CTAC	2	8	2054339	2054346	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10079	NC_015602	TA	3	6	2054347	2054352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_015602	A	6	6	2054361	2054366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_015602	ACT	2	6	2055224	2055229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_015602	TA	3	6	2055232	2055237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_015602	A	6	6	2055266	2055271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_015602	TG	3	6	2055324	2055329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_015602	TCC	2	6	2057236	2057241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10086	NC_015602	AAG	2	6	2057280	2057285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_015602	TTA	2	6	2057299	2057304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_015602	TTA	2	6	2057359	2057364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_015602	TA	3	6	2057371	2057376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_015602	AGA	2	6	2057403	2057408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_015602	CTTAA	2	10	2058449	2058458	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10092	NC_015602	A	6	6	2058465	2058470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_015602	CTG	2	6	2058526	2058531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_015602	T	6	6	2058574	2058579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10095	NC_015602	TTGGAA	2	12	2060213	2060224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_015602	TAT	2	6	2060325	2060330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_015602	TAA	2	6	2060358	2060363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_015602	AAT	2	6	2060690	2060695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_015602	GTG	2	6	2060724	2060729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_015602	AT	3	6	2060754	2060759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_015602	GATA	2	8	2060786	2060793	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_015602	TAA	2	6	2064323	2064328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_015602	TAAGC	2	10	2067513	2067522	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10107	NC_015602	AGG	2	6	2067816	2067821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_015602	T	7	7	2067867	2067873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_015602	TAAT	2	8	2067877	2067884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_015602	AAT	2	6	2068361	2068366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_015602	GAA	2	6	2068425	2068430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10113	NC_015602	CTAA	2	8	2068596	2068603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_015602	TATAA	2	10	2068604	2068613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_015602	GTT	2	6	2069973	2069978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_015602	AAGA	2	8	2069981	2069988	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_015602	A	6	6	2069998	2070003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_015602	TAG	2	6	2070607	2070612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_015602	TAAA	2	8	2070651	2070658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_015602	TAG	2	6	2070688	2070693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_015602	T	6	6	2070695	2070700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_015602	TAA	2	6	2070733	2070738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_015602	TTATA	2	10	2070784	2070793	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_015602	GAT	2	6	2070795	2070800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_015602	TTTTA	2	10	2070906	2070915	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_015602	A	6	6	2070917	2070922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_015602	AT	3	6	2070928	2070933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_015602	GAG	2	6	2070974	2070979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_015602	T	7	7	2071022	2071028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_015602	A	6	6	2071030	2071035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10132	NC_015602	CTA	2	6	2072922	2072927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.