MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 plasmid2

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015322	TCA	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015322	TAT	2	6	32	37	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015322	ATAC	2	8	119	126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_015322	AAC	2	6	151	156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015322	AC	3	6	155	160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015322	ACT	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015322	T	7	7	364	370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015322	TAAA	2	8	402	409	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015322	TA	3	6	492	497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015322	TTC	2	6	539	544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015322	TAC	2	6	548	553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015322	ATG	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015322	AGC	2	6	676	681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015322	TC	3	6	770	775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015322	CG	3	6	790	795	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015322	TGA	2	6	924	929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015322	ATC	2	6	936	941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015322	A	6	6	1427	1432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015322	ATG	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015322	T	6	6	1460	1465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015322	AGGTT	2	10	1491	1500	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015322	AG	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015322	GA	3	6	1560	1565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015322	CTGAT	2	10	1581	1590	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_015322	GCT	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015322	T	6	6	1740	1745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015322	A	6	6	1834	1839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015322	T	6	6	1906	1911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015322	TTC	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_015322	TTC	2	6	7207	7212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_015322	CAC	2	6	7266	7271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015322	A	6	6	7273	7278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015322	GCCC	2	8	7398	7405	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
34	NC_015322	AATG	2	8	7508	7515	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015322	TCA	2	6	7622	7627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015322	CTGC	2	8	7648	7655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_015322	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015322	TTTTA	2	10	7665	7674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015322	A	6	6	7808	7813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015322	ATC	2	6	7848	7853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015322	A	7	7	7882	7888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015322	TAT	2	6	7889	7894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015322	ATT	2	6	7907	7912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015322	AT	3	6	7925	7930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015322	TTG	2	6	7953	7958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015322	T	6	6	8019	8024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015322	GTT	2	6	8041	8046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015322	ATA	2	6	8146	8151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015322	AT	3	6	8762	8767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015322	ATT	2	6	8788	8793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015322	ATG	2	6	8812	8817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015322	T	6	6	8826	8831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015322	CAT	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015322	T	7	7	8855	8861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015322	AT	3	6	8885	8890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015322	GA	3	6	8919	8924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015322	AGAA	2	8	9153	9160	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015322	TTA	2	6	9426	9431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015322	TTCCC	2	10	9462	9471	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_015322	T	6	6	9473	9478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015322	AC	3	6	9839	9844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_015322	T	7	7	10728	10734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015322	T	7	7	11087	11093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015322	A	6	6	11097	11102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015322	AATT	2	8	11191	11198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015322	TGCC	2	8	11203	11210	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_015322	GCG	2	6	11213	11218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015322	GAA	3	9	11223	11231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015322	G	6	6	11269	11274	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015322	TAA	2	6	11275	11280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015322	TC	3	6	13111	13116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015322	CG	3	6	13131	13136	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_015322	TGA	2	6	13265	13270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015322	ATC	2	6	13277	13282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015322	A	6	6	13768	13773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015322	ATG	2	6	13782	13787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015322	T	6	6	13801	13806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015322	AGGTT	2	10	13832	13841	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015322	AG	3	6	13895	13900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015322	GA	3	6	13901	13906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015322	CTGAT	2	10	13922	13931	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015322	GCT	2	6	13955	13960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015322	T	6	6	14081	14086	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015322	A	7	7	14175	14181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015322	TA	3	6	14204	14209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015322	A	6	6	14213	14218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015322	ATTTT	2	10	14234	14243	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015322	T	6	6	14240	14245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015322	A	7	7	14251	14257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015322	AT	3	6	15822	15827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015322	A	6	6	15841	15846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015322	CCT	2	6	17085	17090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_015322	TA	3	6	17099	17104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015322	A	6	6	17144	17149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015322	TGC	2	6	17151	17156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015322	ATC	2	6	17837	17842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_015322	CCA	2	6	17874	17879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_015322	TTGAAC	2	12	17925	17936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_015322	A	6	6	17961	17966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015322	CTTT	2	8	19281	19288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_015322	T	7	7	19300	19306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015322	ATT	2	6	19307	19312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015322	TAC	2	6	19324	19329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015322	TAAT	2	8	19366	19373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015322	ATT	2	6	19382	19387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015322	GTA	2	6	19392	19397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015322	AT	4	8	19399	19406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015322	GTA	2	6	19409	19414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015322	TTAT	2	8	19417	19424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015322	TA	3	6	19434	19439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015322	GTA	2	6	19443	19448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015322	A	6	6	19448	19453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015322	TATT	2	8	19521	19528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015322	TAC	2	6	19529	19534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015322	TA	3	6	19538	19543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015322	TA	3	6	19555	19560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015322	TAC	2	6	19563	19568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015322	AATT	2	8	19569	19576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015322	T	6	6	19578	19583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015322	AAT	2	6	19605	19610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015322	TGT	2	6	19620	19625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015322	A	7	7	19653	19659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015322	TTA	2	6	20606	20611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015322	ATT	2	6	20623	20628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015322	T	6	6	20627	20632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015322	ATTG	2	8	20637	20644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015322	CTA	2	6	20652	20657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015322	TA	3	6	20662	20667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015322	TAAA	2	8	20674	20681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015322	TTA	2	6	20696	20701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015322	TA	3	6	20754	20759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015322	GTA	2	6	20762	20767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015322	TA	3	6	20771	20776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015322	TAAA	2	8	20783	20790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015322	CAA	2	6	20801	20806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015322	A	6	6	20896	20901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015322	A	7	7	20916	20922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015322	CTT	2	6	20995	21000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015322	CAA	2	6	21022	21027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_015322	TAA	2	6	21050	21055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015322	TAT	2	6	21062	21067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015322	GTA	2	6	21071	21076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015322	A	7	7	21102	21108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015322	AT	3	6	21147	21152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015322	CTA	2	6	21161	21166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015322	AT	3	6	21169	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015322	TTTGA	2	10	21214	21223	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015322	TG	3	6	21266	21271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015322	AGGC	2	8	21330	21337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
150	NC_015322	ATGTG	2	10	21342	21351	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015322	GAAA	2	8	21414	21421	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015322	AAC	2	6	21462	21467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_015322	TGT	2	6	21473	21478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015322	TAG	2	6	21486	21491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015322	T	6	6	21535	21540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015322	AAT	2	6	21617	21622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015322	TTTA	2	8	21624	21631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015322	AAGA	2	8	21698	21705	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015322	AGAAA	2	10	21720	21729	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015322	ATG	2	6	21737	21742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015322	T	7	7	21751	21757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015322	CAT	2	6	21772	21777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_015322	T	7	7	21781	21787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_015322	AT	3	6	21811	21816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015322	GA	3	6	21846	21851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015322	AT	3	6	22078	22083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015322	AGAA	2	8	22084	22091	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_015322	TAG	2	6	22371	22376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015322	TTCCC	2	10	22403	22412	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
170	NC_015322	T	7	7	22414	22420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_015322	AC	3	6	22781	22786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_015322	T	7	7	23670	23676	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015322	T	7	7	24029	24035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015322	A	6	6	24039	24044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015322	AATT	2	8	24133	24140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_015322	TGCC	2	8	24145	24152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
177	NC_015322	GCG	2	6	24155	24160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_015322	GAA	3	9	24165	24173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015322	G	6	6	24211	24216	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
180	NC_015322	TAA	2	6	24217	24222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015322	GAA	2	6	24397	24402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015322	CCAA	2	8	24428	24435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
183	NC_015322	TGA	2	6	24436	24441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_015322	TGA	2	6	24604	24609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_015322	ATTA	2	8	24626	24633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015322	GCT	2	6	24650	24655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_015322	CAA	2	6	24717	24722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_015322	TCGG	2	8	24732	24739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
189	NC_015322	AAG	2	6	24807	24812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015322	AAAG	2	8	24870	24877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_015322	CAT	2	6	24899	24904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
192	NC_015322	CAAA	2	8	24982	24989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_015322	TGG	2	6	25011	25016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015322	TGT	2	6	25021	25026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_015322	AAG	2	6	25166	25171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015322	AT	3	6	25229	25234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015322	GGCT	2	8	25275	25282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.