MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 3709

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015214	CTT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015214	CTA	4	12	1486	1497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015214	AGG	2	6	1541	1546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015214	CTT	2	6	2709	2714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015214	TTC	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015214	TAA	2	6	8764	8769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015214	AGG	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015214	TAA	2	6	10171	10176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015214	TTA	2	6	14167	14172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015214	AAT	2	6	14244	14249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015214	TGA	2	6	14320	14325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015214	GGA	2	6	14346	14351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015214	ATT	2	6	15316	15321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015214	GTA	2	6	17437	17442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015214	TTA	2	6	17464	17469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015214	GAA	2	6	17691	17696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015214	AAT	2	6	17989	17994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015214	TAA	2	6	19282	19287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015214	ATT	2	6	19301	19306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015214	TAA	2	6	20151	20156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015214	TGT	2	6	20161	20166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015214	ATG	2	6	20225	20230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015214	TCC	2	6	20285	20290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015214	TAA	2	6	20307	20312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015214	TAT	2	6	21775	21780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015214	ACA	2	6	21848	21853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015214	TTA	2	6	21907	21912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015214	ATT	2	6	22197	22202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015214	TGA	2	6	22210	22215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015214	AGA	2	6	22266	22271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015214	CTC	2	6	23244	23249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_015214	TAA	2	6	23251	23256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015214	TAA	2	6	23292	23297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015214	TAA	2	6	23947	23952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015214	CTA	2	6	23965	23970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015214	TGT	2	6	25280	25285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015214	AGC	2	6	25305	25310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015214	ATT	2	6	25311	25316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015214	AAT	2	6	25351	25356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015214	AGG	2	6	25400	25405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015214	CAT	2	6	28418	28423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015214	ACT	2	6	28491	28496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015214	ATC	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015214	TAA	2	6	28596	28601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015214	GAT	2	6	28696	28701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015214	TAA	2	6	29931	29936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015214	TTA	2	6	29974	29979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015214	TAA	2	6	32334	32339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015214	ATT	3	9	34594	34602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015214	TAA	2	6	34729	34734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015214	TAC	2	6	36704	36709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_015214	TGC	2	6	36739	36744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015214	TTA	2	6	38740	38745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015214	TAT	2	6	38829	38834	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015214	TTA	2	6	41627	41632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015214	ATT	2	6	41798	41803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015214	TGT	2	6	41804	41809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015214	TTA	2	6	41826	41831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015214	CTT	2	6	44612	44617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_015214	GAA	2	6	46693	46698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015214	TTA	2	6	48403	48408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015214	CAA	2	6	48444	48449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015214	ATT	2	6	48522	48527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015214	TAT	2	6	48599	48604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015214	CAA	2	6	48628	48633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015214	AAG	2	6	48649	48654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015214	TCT	2	6	48663	48668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015214	TTA	2	6	48675	48680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015214	TTA	2	6	48700	48705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015214	GAA	2	6	48781	48786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015214	TGA	2	6	48832	48837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015214	TGA	2	6	48857	48862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015214	AAT	2	6	49827	49832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015214	GCT	2	6	50011	50016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015214	GAA	2	6	50468	50473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015214	TTC	2	6	50529	50534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015214	TGT	2	6	53579	53584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015214	ATT	2	6	54801	54806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015214	TAT	2	6	56076	56081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015214	TAA	2	6	56579	56584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015214	GTA	2	6	56608	56613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015214	AAG	2	6	56692	56697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015214	TAA	2	6	56716	56721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015214	AAG	2	6	56754	56759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015214	GAA	2	6	56810	56815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015214	GTC	2	6	56835	56840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015214	GTA	2	6	56954	56959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015214	AAT	2	6	57062	57067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015214	GGC	2	6	57130	57135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_015214	ATA	2	6	57284	57289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015214	GGC	2	6	57318	57323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015214	CGA	2	6	57391	57396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_015214	GCA	2	6	57465	57470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015214	CGC	2	6	57512	57517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_015214	TGT	2	6	57551	57556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015214	GAA	2	6	57561	57566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015214	GTA	2	6	57575	57580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015214	CAG	2	6	57633	57638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015214	AGA	2	6	57774	57779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015214	GAA	2	6	57825	57830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015214	GGC	2	6	57844	57849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_015214	TGC	2	6	57969	57974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015214	GAA	2	6	58088	58093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015214	GGT	2	6	58162	58167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015214	GTC	2	6	58176	58181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_015214	TTA	2	6	58233	58238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015214	GGA	2	6	58288	58293	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015214	TCA	2	6	58313	58318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015214	CGC	2	6	58478	58483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_015214	CCT	2	6	58649	58654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015214	GTA	2	6	58749	58754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015214	AGG	2	6	58957	58962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015214	AAG	2	6	59000	59005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015214	ATT	2	6	59250	59255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015214	ATG	2	6	59258	59263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015214	TAG	2	6	59345	59350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015214	AGT	2	6	59669	59674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015214	AGC	2	6	60210	60215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_015214	CAT	2	6	60216	60221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015214	GCG	2	6	60344	60349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_015214	CCG	2	6	60430	60435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_015214	AGG	2	6	60574	60579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015214	AGC	2	6	60611	60616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015214	TGA	2	6	60662	60667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015214	GAA	2	6	60837	60842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015214	AAC	2	6	60887	60892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_015214	CGG	2	6	61020	61025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015214	AGG	2	6	61273	61278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015214	TAC	2	6	61290	61295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_015214	CCT	2	6	61378	61383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_015214	TGG	2	6	61513	61518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015214	TCG	2	6	61629	61634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_015214	CGT	2	6	61709	61714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_015214	CGT	2	6	61735	61740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015214	GAG	2	6	61758	61763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015214	GTT	2	6	61812	61817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015214	GAA	2	6	61971	61976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015214	GTA	2	6	62068	62073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015214	AAG	2	6	62100	62105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015214	CTT	2	6	62142	62147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_015214	TGG	2	6	62163	62168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_015214	GTC	2	6	72699	72704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_015214	TAA	2	6	78470	78475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_015214	TGA	2	6	245151	245156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
409	NC_015214	AAT	2	6	247005	247010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_015214	ATT	2	6	247018	247023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_015214	TTA	2	6	247024	247029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_015214	ATT	2	6	247032	247037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_015214	TAA	2	6	247078	247083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_015214	GTT	2	6	247132	247137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
415	NC_015214	GCG	2	6	248750	248755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_015214	TAA	2	6	258279	258284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_015214	ATT	2	6	260308	260313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_015214	CTT	2	6	263226	263231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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450	NC_015214	TAT	2	6	266777	266782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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