MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 7274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015214	TAAA	2	8	1142315	1142322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_015214	CCAA	2	8	1142331	1142338	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_015214	TTA	2	6	1142350	1142355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_015214	TTG	2	6	1142374	1142379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015214	AGA	2	6	1142408	1142413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_015214	ACAA	2	8	1142429	1142436	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4007	NC_015214	TAA	2	6	1142471	1142476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_015214	TCAGGC	2	12	1142495	1142506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015214	CAAA	2	8	1142507	1142514	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_015214	AGT	2	6	1142519	1142524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015214	AGAT	2	8	1142527	1142534	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_015214	TAA	2	6	1142535	1142540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015214	TCT	2	6	1142558	1142563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015214	TTC	2	6	1142565	1142570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015214	AGA	2	6	1142624	1142629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015214	TAA	2	6	1142702	1142707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_015214	AAGT	2	8	1142730	1142737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_015214	GA	3	6	1142738	1142743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015214	CTT	2	6	1142757	1142762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_015214	TGA	2	6	1142798	1142803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_015214	ACC	2	6	1142849	1142854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_015214	GTGA	2	8	1142967	1142974	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015214	AGC	2	6	1142984	1142989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015214	ATC	2	6	1143054	1143059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_015214	CAA	2	6	1143064	1143069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015214	TGA	2	6	1143095	1143100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015214	ACT	2	6	1143159	1143164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_015214	TTG	2	6	1143223	1143228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_015214	ATC	2	6	1143273	1143278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_015214	TTTCC	2	10	1143313	1143322	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
4031	NC_015214	T	6	6	1143325	1143330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015214	ATA	2	6	1143331	1143336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_015214	CAGA	2	8	1143357	1143364	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4034	NC_015214	ATA	2	6	1143382	1143387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_015214	TTA	2	6	1143407	1143412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_015214	AAT	2	6	1143419	1143424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015214	AGT	2	6	1143433	1143438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_015214	AG	3	6	1144472	1144477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_015214	T	7	7	1144497	1144503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015214	TTTG	2	8	1144512	1144519	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015214	TAT	2	6	1144540	1144545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015214	AGT	2	6	1144574	1144579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015214	TGA	2	6	1145103	1145108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015214	ATT	2	6	1145174	1145179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_015214	AGT	2	6	1145204	1145209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015214	CAT	2	6	1145283	1145288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_015214	CAT	2	6	1145359	1145364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_015214	ATG	2	6	1145399	1145404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015214	GCT	2	6	1145429	1145434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_015214	TGG	2	6	1145455	1145460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015214	TCA	2	6	1145466	1145471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_015214	GCT	2	6	1145475	1145480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_015214	AAG	2	6	1145505	1145510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_015214	AAAT	2	8	1145546	1145553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4056	NC_015214	CTT	2	6	1145612	1145617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_015214	CAA	2	6	1145642	1145647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4059	NC_015214	TGG	2	6	1145717	1145722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_015214	ACTT	2	8	1145725	1145732	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4061	NC_015214	TGA	2	6	1145776	1145781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015214	TCA	2	6	1145833	1145838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_015214	CAA	2	6	1145961	1145966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_015214	TAG	2	6	1146091	1146096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015214	ATT	2	6	1146099	1146104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015214	GTA	2	6	1146158	1146163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015214	GATA	2	8	1146803	1146810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015214	TAA	2	6	1147226	1147231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015214	ATTG	2	8	1147272	1147279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015214	TAGA	2	8	1147297	1147304	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_015214	ATT	2	6	1147339	1147344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015214	AAGCTA	2	12	1147430	1147441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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4077	NC_015214	AAG	2	6	1147582	1147587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_015214	A	6	6	1147979	1147984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_015214	T	7	7	1148006	1148012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4082	NC_015214	T	6	6	1149428	1149433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_015214	GAG	2	6	1149482	1149487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_015214	A	6	6	1149499	1149504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_015214	ATTT	2	8	1149550	1149557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4087	NC_015214	ATC	2	6	1149581	1149586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4089	NC_015214	A	6	6	1149614	1149619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_015214	AAAT	2	8	1152449	1152456	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015214	TAAT	2	8	1152500	1152507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015214	A	6	6	1155052	1155057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015214	AAT	2	6	1155086	1155091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_015214	AATC	2	8	1155104	1155111	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_015214	AGAA	2	8	1155122	1155129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_015214	TAATT	2	10	1155133	1155142	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_015214	AAG	2	6	1155233	1155238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4099	NC_015214	GGT	2	6	1155331	1155336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015214	T	7	7	1155383	1155389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_015214	T	6	6	1155403	1155408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015214	AGG	2	6	1155410	1155415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015214	AGA	2	6	1155416	1155421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_015214	TAA	2	6	1156804	1156809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_015214	GA	3	6	1156833	1156838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015214	T	6	6	1156843	1156848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015214	GAA	2	6	1157190	1157195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015214	TGT	2	6	1157207	1157212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_015214	AACC	2	8	1157308	1157315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_015214	GGT	2	6	1157328	1157333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015214	AGA	2	6	1157399	1157404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_015214	TAA	2	6	1157423	1157428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_015214	CTT	2	6	1157429	1157434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_015214	AT	3	6	1158051	1158056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015214	AGA	2	6	1158065	1158070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4120	NC_015214	T	6	6	1158149	1158154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015214	TTC	2	6	1158164	1158169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_015214	AGATG	2	10	1158185	1158194	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015214	GAA	2	6	1158211	1158216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_015214	A	6	6	1158227	1158232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_015214	ATT	2	6	1158240	1158245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015214	TCGC	2	8	1158262	1158269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4127	NC_015214	AAT	2	6	1158291	1158296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_015214	TAT	2	6	1158374	1158379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_015214	AGA	2	6	1158401	1158406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4131	NC_015214	GAT	2	6	1158604	1158609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015214	GAA	2	6	1158637	1158642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4155	NC_015214	A	6	6	1162318	1162323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4398	NC_015214	AAT	2	6	1210732	1210737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4399	NC_015214	ATT	2	6	1210740	1210745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4401	NC_015214	CT	3	6	1210867	1210872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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