MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 7274

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015214	AGT	2	6	1414836	1414841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_015214	TCC	2	6	1416647	1416652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5003	NC_015214	AAT	2	6	1416679	1416684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_015214	T	6	6	1416750	1416755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_015214	GTTA	2	8	1416758	1416765	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_015214	ATT	2	6	1416799	1416804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_015214	ATT	2	6	1418605	1418610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_015214	T	6	6	1418628	1418633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_015214	TAA	2	6	1418643	1418648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_015214	TGA	2	6	1418663	1418668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_015214	ATA	2	6	1418673	1418678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_015214	ATT	2	6	1418713	1418718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_015214	TTTTA	2	10	1418725	1418734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_015214	TAT	3	9	1418752	1418760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_015214	AT	3	6	1418803	1418808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_015214	TTA	2	6	1418809	1418814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_015214	TCT	2	6	1419754	1419759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015214	CTC	2	6	1419760	1419765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_015214	TCC	2	6	1422755	1422760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015214	TATT	2	8	1422800	1422807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_015214	T	7	7	1422855	1422861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_015214	TCC	2	6	1423119	1423124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_015214	TAA	2	6	1423129	1423134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_015214	ATT	2	6	1423135	1423140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_015214	CAC	2	6	1424155	1424160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_015214	TCC	2	6	1428257	1428262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_015214	TAT	2	6	1428286	1428291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_015214	TACT	2	8	1428302	1428309	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_015214	CAAT	2	8	1428310	1428317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_015214	A	7	7	1428334	1428340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_015214	AGG	2	6	1428405	1428410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_015214	A	6	6	1428609	1428614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_015214	T	7	7	1428644	1428650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_015214	T	6	6	1428655	1428660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_015214	TTTCTT	2	12	1429021	1429032	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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5038	NC_015214	TCAA	2	8	1438784	1438791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5041	NC_015214	ATT	2	6	1439759	1439764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_015214	GAT	2	6	1439789	1439794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_015214	TCA	2	6	1442201	1442206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_015214	A	7	7	1446343	1446349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_015214	AAT	2	6	1447813	1447818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5047	NC_015214	TAT	2	6	1449018	1449023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_015214	A	6	6	1449060	1449065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_015214	TCT	2	6	1449100	1449105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_015214	A	6	6	1449745	1449750	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_015214	CTT	2	6	1449776	1449781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_015214	AAG	2	6	1449786	1449791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_015214	TA	3	6	1449849	1449854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_015214	AAT	2	6	1449879	1449884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_015214	TAA	2	6	1451323	1451328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_015214	GAG	2	6	1451410	1451415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_015214	TCT	2	6	1452474	1452479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_015214	AGA	2	6	1452488	1452493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_015214	T	6	6	1452497	1452502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_015214	CCT	2	6	1452887	1452892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5065	NC_015214	TTAA	2	8	1453821	1453828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_015214	A	7	7	1453827	1453833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_015214	TAT	2	6	1453858	1453863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_015214	A	7	7	1453866	1453872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_015214	GC	4	8	1453873	1453880	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_015214	TCT	2	6	1455146	1455151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5073	NC_015214	TTG	2	6	1455187	1455192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5075	NC_015214	TAAAA	2	10	1456625	1456634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5080	NC_015214	A	6	6	1456837	1456842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_015214	ATTG	2	8	1456881	1456888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_015214	TTA	2	6	1460070	1460075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_015214	CATTCG	2	12	1460141	1460152	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015214	CAA	2	6	1460164	1460169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_015214	A	7	7	1460187	1460193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_015214	A	6	6	1460229	1460234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_015214	A	6	6	1460245	1460250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_015214	TTAA	2	8	1460338	1460345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_015214	ATC	2	6	1460351	1460356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5091	NC_015214	T	6	6	1461216	1461221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_015214	ATC	2	6	1461238	1461243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015214	T	6	6	1461612	1461617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_015214	ATT	2	6	1461621	1461626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_015214	T	6	6	1461699	1461704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_015214	AAG	2	6	1461732	1461737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5098	NC_015214	A	6	6	1463806	1463811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_015214	GCTT	2	8	1463882	1463889	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5100	NC_015214	TGTC	2	8	1463900	1463907	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5101	NC_015214	TCAA	2	8	1463986	1463993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_015214	GA	3	6	1464035	1464040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015214	CAT	2	6	1464390	1464395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_015214	TCC	2	6	1466922	1466927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_015214	TTA	2	6	1466933	1466938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_015214	A	6	6	1466953	1466958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_015214	GC	3	6	1466959	1466964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_015214	TGA	2	6	1467517	1467522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_015214	ATC	2	6	1467702	1467707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015214	TTTA	2	8	1467721	1467728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_015214	CTT	3	9	1467735	1467743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_015214	GGC	2	6	1467804	1467809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015214	TCC	2	6	1467985	1467990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5115	NC_015214	TTGG	2	8	1468051	1468058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_015214	TTGG	2	8	1468141	1468148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_015214	TGC	2	6	1468223	1468228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5123	NC_015214	GTCTTG	2	12	1468441	1468452	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5124	NC_015214	GTCCTT	2	12	1468464	1468475	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015214	AAC	2	6	1468545	1468550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015214	GACTT	2	10	1468554	1468563	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5127	NC_015214	ATC	2	6	1468575	1468580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_015214	TTG	2	6	1468604	1468609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_015214	TAT	2	6	1468739	1468744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_015214	ACG	2	6	1468789	1468794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_015214	CGT	2	6	1468811	1468816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_015214	TTG	2	6	1468828	1468833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_015214	TCA	2	6	1469009	1469014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5134	NC_015214	CGT	3	9	1469186	1469194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_015214	ACT	2	6	1469203	1469208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_015214	TGG	2	6	1469276	1469281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_015214	CGTT	2	8	1469297	1469304	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5138	NC_015214	AAC	2	6	1469487	1469492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5139	NC_015214	GT	3	6	1469540	1469545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5140	NC_015214	TTA	2	6	1469560	1469565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5141	NC_015214	TCA	2	6	1469569	1469574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_015214	TA	3	6	1469600	1469605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_015214	TAA	2	6	1469693	1469698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_015214	ATA	2	6	1469745	1469750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5145	NC_015214	TCG	2	6	1469776	1469781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5147	NC_015214	TGC	2	6	1469831	1469836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5148	NC_015214	ATA	2	6	1469889	1469894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5149	NC_015214	AGT	2	6	1469916	1469921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5151	NC_015214	TCC	2	6	1470110	1470115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5152	NC_015214	TGA	2	6	1470116	1470121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5153	NC_015214	TCG	2	6	1470147	1470152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5155	NC_015214	ATTCA	2	10	1470236	1470245	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5156	NC_015214	TCTG	2	8	1470306	1470313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5157	NC_015214	TCT	2	6	1470481	1470486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_015214	CAG	2	6	1470706	1470711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5167	NC_015214	TGCT	2	8	1470860	1470867	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5168	NC_015214	CTG	2	6	1470895	1470900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5173	NC_015214	A	6	6	1471443	1471448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5174	NC_015214	ATTA	2	8	1471473	1471480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5181	NC_015214	TGG	2	6	1475053	1475058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5187	NC_015214	T	6	6	1479473	1479478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5192	NC_015214	ATTTT	2	10	1479732	1479741	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5200	NC_015214	ATCT	2	8	1481896	1481903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5202	NC_015214	GTTT	2	8	1482740	1482747	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5205	NC_015214	A	7	7	1483016	1483022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5206	NC_015214	TA	3	6	1483049	1483054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5211	NC_015214	AGA	2	6	1483294	1483299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5213	NC_015214	TAAT	2	8	1483361	1483368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5221	NC_015214	ATCT	2	8	1486299	1486306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5224	NC_015214	A	6	6	1486690	1486695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5225	NC_015214	A	6	6	1487615	1487620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5227	NC_015214	A	6	6	1487665	1487670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5251	NC_015214	T	6	6	1497352	1497357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_015214	T	7	7	1499367	1499373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5264	NC_015214	GGA	2	6	1499394	1499399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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