MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus delbrueckii subsp. bulgaricus ND02 chromosome

Total Repeats: 351

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014727	ATAAA	2	10	8833	8842	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014727	TCGCC	2	10	15401	15410	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_014727	GCGGG	2	10	16696	16705	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014727	ATTAA	2	10	17930	17939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014727	CATTG	2	10	24469	24478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014727	GATAA	2	10	32264	32273	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014727	TCGTG	2	10	34666	34675	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014727	GGCAG	2	10	35067	35076	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014727	GGGAG	2	10	35880	35889	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014727	TTGAA	2	10	37246	37255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014727	AGCAA	2	10	38269	38278	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014727	TAGGA	2	10	38433	38442	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014727	CTTTT	2	10	38482	38491	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014727	GCTTT	2	10	43397	43406	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014727	ATTTT	2	10	52775	52784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014727	ATCAG	2	10	54188	54197	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014727	ACAAA	2	10	55540	55549	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014727	CTTTT	2	10	61673	61682	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014727	TAAAA	2	10	69705	69714	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014727	TCTTT	2	10	76589	76598	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014727	TTAAT	2	10	82415	82424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014727	ATTTT	2	10	82508	82517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014727	AGATT	2	10	89602	89611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014727	ATGTG	2	10	91786	91795	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014727	ATAAC	2	10	95283	95292	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014727	GAAGG	2	10	103777	103786	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014727	GTGAT	2	10	105338	105347	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014727	TAAAA	2	10	111133	111142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014727	CAAAA	2	10	118658	118667	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014727	TTATT	2	10	125604	125613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014727	ACTTT	2	10	134606	134615	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014727	ATCAA	2	10	136478	136487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014727	TATTT	2	10	137707	137716	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014727	TATTG	2	10	140786	140795	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014727	GATGA	2	10	150502	150511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014727	ATCTA	2	10	181240	181249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014727	TAACA	2	10	194274	194283	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014727	CTGTT	2	10	196736	196745	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014727	AAAAT	2	10	199753	199762	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014727	GAAAA	2	10	214310	214319	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014727	TGCTT	2	10	214404	214413	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014727	ATCAG	2	10	218220	218229	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014727	TCTTT	2	10	218967	218976	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014727	GATAT	2	10	236363	236372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014727	TTAAT	2	10	236637	236646	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014727	ATTAT	2	10	236714	236723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014727	CTATA	2	10	236957	236966	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014727	TACGG	2	10	238844	238853	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014727	AGTCT	2	10	252282	252291	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014727	ATTTT	2	10	258862	258871	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014727	GAAAA	2	10	264103	264112	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014727	TTGAA	2	10	267537	267546	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014727	CTTTT	2	10	275709	275718	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014727	TGATT	2	10	281725	281734	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014727	GATTT	3	15	281736	281750	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014727	TTGAT	2	10	281763	281772	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014727	AAAAG	2	10	281787	281796	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014727	TGTGA	2	10	284422	284431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014727	TAAGG	2	10	298928	298937	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014727	TAGAA	2	10	306979	306988	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014727	AAGAG	2	10	312302	312311	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014727	CTCTT	2	10	312316	312325	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014727	AAAAG	2	10	312370	312379	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014727	CTTTA	2	10	314024	314033	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014727	CTTTT	2	10	339452	339461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014727	GTTTG	2	10	362846	362855	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014727	CACGC	2	10	365067	365076	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
68	NC_014727	ATTTT	2	10	375998	376007	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014727	ATCAG	2	10	382390	382399	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014727	TAATG	2	10	382884	382893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014727	GACAA	2	10	383605	383614	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014727	GTAAC	2	10	387178	387187	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014727	AGGCC	2	10	387960	387969	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014727	AGATT	2	10	391263	391272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014727	TAGAC	2	10	391277	391286	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014727	TCTTT	2	10	402456	402465	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014727	TACTT	2	10	431768	431777	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014727	CAACT	2	10	432263	432272	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014727	TTTAT	2	10	432553	432562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014727	TTAAG	2	10	432595	432604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014727	GTTTT	2	10	432936	432945	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014727	TTAAG	2	10	436360	436369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014727	AATAT	2	10	444361	444370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014727	TTATT	2	10	490974	490983	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014727	AGAGG	2	10	510789	510798	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014727	TTCAT	2	10	511944	511953	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014727	ATTTT	2	10	526818	526827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014727	ATCAG	2	10	535501	535510	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014727	AAAAG	2	10	537344	537353	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014727	GTTGC	2	10	538006	538015	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014727	AACAA	2	10	540422	540431	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014727	TTCTT	2	10	542718	542727	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014727	TTTTC	2	10	578796	578805	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014727	GCAGA	2	10	582849	582858	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014727	AAAAG	2	10	587651	587660	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014727	CTTTC	2	10	600971	600980	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014727	AAGAA	2	10	612620	612629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014727	GTATA	2	10	624270	624279	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014727	AATAA	2	10	624350	624359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014727	ATTTT	2	10	634842	634851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014727	CTTTG	2	10	635832	635841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014727	TAGTG	2	10	652866	652875	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014727	ACACT	2	10	654128	654137	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014727	TTTTA	2	10	683886	683895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014727	TAAAA	2	10	696568	696577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014727	TTTTC	2	10	711421	711430	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014727	ACTTT	2	10	714247	714256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014727	ATTAA	2	10	721878	721887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014727	TGCAA	2	10	721918	721927	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014727	GTGAA	2	10	726455	726464	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014727	TTTTC	2	10	730724	730733	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014727	TTCTT	2	10	733491	733500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014727	AAGAA	2	10	733518	733527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014727	GACTG	2	10	736094	736103	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014727	TCGTG	2	10	737802	737811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014727	GGCAG	2	10	738203	738212	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014727	GGGAG	2	10	739016	739025	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014727	TTGAA	2	10	740382	740391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014727	ATAGA	2	10	756772	756781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014727	AGCAA	2	10	764870	764879	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014727	ATGTG	2	10	773425	773434	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014727	AAATA	2	10	782633	782642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014727	CTTTT	2	10	782670	782679	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014727	CTTTT	2	10	786542	786551	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014727	AATGG	2	10	802561	802570	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014727	CTATG	2	10	802650	802659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014727	TTTTA	2	10	809543	809552	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014727	GTAGA	2	10	823403	823412	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014727	CAAAA	2	10	826107	826116	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014727	TAAAA	2	10	832733	832742	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014727	TTAAT	2	10	835638	835647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014727	TCTTT	2	10	842829	842838	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014727	GATTT	2	10	844033	844042	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014727	TTTTA	2	10	853455	853464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014727	TCGTG	2	10	859520	859529	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014727	GGCAG	2	10	859921	859930	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014727	GGGAG	2	10	860973	860982	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014727	TTGAA	2	10	862339	862348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014727	AAAAG	2	10	866549	866558	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014727	AAAAT	2	10	879918	879927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014727	TAGTG	2	10	880000	880009	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014727	AATAT	2	10	888383	888392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014727	AAAGA	2	10	888604	888613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014727	CTAAA	2	10	889668	889677	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014727	AAGCA	2	10	890434	890443	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014727	TATTG	2	10	895799	895808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014727	TATTG	2	10	895828	895837	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014727	CTCAA	2	10	896090	896099	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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348	NC_014727	TTACT	2	10	2101361	2101370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
349	NC_014727	AAGAA	2	10	2105226	2105235	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
350	NC_014727	TAGTA	2	10	2107891	2107900	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
351	NC_014727	ACAAA	2	10	2116862	2116871	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.