MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014724	AGGAA	2	10	9284	9293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014724	GATTT	2	10	10167	10176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014724	ATAAA	2	10	14261	14270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014724	AGTTA	2	10	18600	18609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014724	TATTT	2	10	21521	21530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014724	AAATT	2	10	22691	22700	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014724	AAGGA	2	10	50457	50466	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014724	TATCT	2	10	51202	51211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014724	TAAAA	2	10	57061	57070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014724	CTTTT	2	10	57518	57527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014724	CAATT	2	10	58883	58892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014724	TCATT	2	10	58970	58979	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014724	GGTAA	2	10	66572	66581	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014724	TCGTG	2	10	67389	67398	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014724	GGCAG	2	10	67788	67797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014724	AAGGC	2	10	69445	69454	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014724	TTGAA	2	10	69955	69964	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014724	GCCAG	2	10	70287	70296	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014724	AGCGA	2	10	70972	70981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014724	AGGAA	2	10	71138	71147	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014724	ATCAT	2	10	86375	86384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014724	TTCTT	2	10	98312	98321	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014724	GTAAA	2	10	105563	105572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014724	TATAA	2	10	110240	110249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014724	ATACT	2	10	117222	117231	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014724	AGGTT	2	10	119734	119743	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014724	CAATA	2	10	130734	130743	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014724	AACAA	2	10	133461	133470	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014724	TTTCT	2	10	137164	137173	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014724	GCTTG	2	10	141989	141998	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014724	TAATG	2	10	142094	142103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014724	ATTTT	2	10	165616	165625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014724	ATTAA	2	10	179838	179847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014724	TAACT	2	10	182353	182362	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014724	AAAAG	2	10	184074	184083	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014724	ATATC	2	10	187657	187666	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014724	AAGTC	2	10	189775	189784	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014724	CTTTT	2	10	195335	195344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014724	GGTGT	2	10	203741	203750	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014724	TATAT	2	10	213358	213367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014724	TTATT	2	10	222371	222380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014724	ATCTA	2	10	222864	222873	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014724	AAGTC	2	10	225490	225499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014724	CAAAA	2	10	238249	238258	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014724	TTTAT	2	10	240302	240311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014724	ATAGA	2	10	246170	246179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014724	AATTT	2	10	254092	254101	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014724	CTTGG	2	10	257858	257867	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014724	TCATT	2	10	258605	258614	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014724	TAGAA	2	10	258744	258753	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014724	TTAAT	2	10	261406	261415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014724	TTTAA	2	10	274018	274027	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014724	AGGAT	2	10	279345	279354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014724	GTGAT	2	10	282643	282652	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014724	ACTTA	2	10	294886	294895	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014724	ACGTT	2	10	330883	330892	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014724	CATTA	2	10	339515	339524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014724	TAAAA	2	10	350104	350113	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014724	ATAAA	2	10	368357	368366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014724	TAAAA	2	10	388909	388918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014724	AAAAT	2	10	396233	396242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014724	AATTG	2	10	432558	432567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014724	ATTTT	2	10	438606	438615	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014724	TGAGA	2	10	441702	441711	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014724	GGTAA	2	10	450404	450413	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014724	TCGTG	2	10	451221	451230	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014724	GGCAG	2	10	451620	451629	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014724	GAGAA	2	10	452123	452132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014724	AAGGC	2	10	453525	453534	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014724	TTGAA	2	10	454035	454044	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014724	GCCAG	2	10	454367	454376	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014724	AGCGA	2	10	455052	455061	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014724	AGGAA	2	10	455218	455227	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014724	TCTAA	2	10	457295	457304	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014724	AATAG	2	10	457401	457410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014724	GTGGC	2	10	459006	459015	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014724	GAGAG	2	10	462266	462275	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014724	GGTAA	2	10	470230	470239	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014724	TCGTG	2	10	471047	471056	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014724	GGCAG	2	10	471446	471455	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014724	AAGGC	2	10	473103	473112	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014724	TTGAA	2	10	473613	473622	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014724	GCCAG	2	10	473945	473954	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014724	AGCGA	2	10	474630	474639	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014724	AGGAA	2	10	474796	474805	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014724	GCTTA	2	10	480867	480876	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014724	TATAA	2	10	495804	495813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014724	ATATA	2	10	508303	508312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014724	AATTA	2	10	509961	509970	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014724	TTAAG	2	10	515391	515400	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014724	TTTAA	2	10	515590	515599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014724	CTTAA	2	10	516411	516420	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014724	AAGCA	2	10	521774	521783	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014724	AAAGA	2	10	526896	526905	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014724	AAGTC	2	10	534108	534117	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014724	AGAAA	2	10	537485	537494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014724	AATTT	2	10	537657	537666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014724	AGCCA	2	10	546880	546889	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014724	AGCCA	2	10	546893	546902	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014724	GAGGG	2	10	548663	548672	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014724	GTAAA	2	10	550342	550351	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014724	TAATT	2	10	552452	552461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014724	ATAAA	2	10	559291	559300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014724	ATATT	2	10	591171	591180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014724	TGGCC	2	10	604890	604899	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014724	TAATA	2	10	618525	618534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014724	AAATT	2	10	621202	621211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014724	ATTTT	2	10	622429	622438	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014724	TAGAT	2	10	624516	624525	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014724	ATTTA	2	10	633051	633060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014724	AGCTT	2	10	636891	636900	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014724	TAAAA	2	10	654291	654300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014724	GCAAA	2	10	666020	666029	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014724	ATTAT	2	10	666064	666073	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014724	AAATT	2	10	731468	731477	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014724	GAAAA	2	10	732367	732376	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014724	GACTT	2	10	743552	743561	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014724	TAGAT	2	10	745001	745010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014724	TAAAA	2	10	746918	746927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014724	CAAGA	2	10	760019	760028	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014724	GTTTG	2	10	760777	760786	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014724	TTACC	2	10	761231	761240	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_014724	TTGAT	2	10	761845	761854	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014724	AGATA	2	10	762061	762070	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014724	TAAAA	2	10	763601	763610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014724	TCTAT	2	10	766523	766532	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014724	TAAAA	2	10	770191	770200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014724	GCTTG	2	10	792436	792445	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014724	TTTAG	2	10	806800	806809	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014724	ATTTT	2	10	806848	806857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014724	ACTAT	2	10	806861	806870	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014724	GTTAT	2	10	810512	810521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014724	AAAAT	2	10	825173	825182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014724	TTGAA	2	10	830711	830720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014724	TTTTA	2	10	830788	830797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014724	CAGTG	2	10	831505	831514	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014724	TTTTG	2	10	864708	864717	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014724	TAAAA	2	10	871164	871173	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014724	ATAAA	2	10	874066	874075	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014724	TTAAG	2	10	883808	883817	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014724	TTTAT	2	10	885372	885381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014724	AGATT	2	10	885421	885430	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014724	CTTAA	2	10	885445	885454	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014724	TAAAT	3	15	898059	898073	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014724	CTAAT	2	10	907729	907738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014724	AAATT	2	10	908943	908952	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014724	AATAA	2	10	910971	910980	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014724	TAACT	2	10	910996	911005	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014724	TATAT	2	10	917512	917521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_014724	GAGTT	2	10	944128	944137	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_014724	TTAAG	2	10	1693480	1693489	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014724	AATCT	2	10	1693504	1693513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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332	NC_014724	ATAAA	2	10	1878063	1878072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_014724	AGTAA	2	10	1895509	1895518	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
334	NC_014724	GACTT	2	10	1898262	1898271	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
335	NC_014724	TAGAT	2	10	1899711	1899720	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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338	NC_014724	TAGAT	2	10	1932558	1932567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
339	NC_014724	TTGAA	2	10	1952133	1952142	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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360	NC_014724	CGAAA	2	10	2060085	2060094	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.