MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL 1112 chromosome

Total Repeats: 963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014724	AAAT	2	8	7	14	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014724	TAAA	2	8	1548	1555	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014724	AAAT	2	8	9826	9833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014724	AGGA	2	8	10246	10253	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014724	ATTA	2	8	14367	14374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014724	ATTA	2	8	16390	16397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014724	CATA	2	8	16398	16405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014724	AAGA	2	8	17424	17431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014724	TTAG	2	8	17740	17747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014724	AACT	2	8	19533	19540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014724	TAAA	2	8	20633	20640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014724	TGTA	2	8	20641	20648	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014724	AAGA	2	8	20891	20898	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014724	AAAT	2	8	31125	31132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014724	GTTT	2	8	33510	33517	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014724	TAAA	2	8	35470	35477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014724	TTTG	2	8	37018	37025	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014724	TATG	2	8	43201	43208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014724	ATAA	2	8	47335	47342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014724	CTAT	2	8	47349	47356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014724	TAAT	2	8	50438	50445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014724	GAAA	2	8	53206	53213	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014724	CAAA	2	8	55881	55888	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014724	ATTT	2	8	55930	55937	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014724	AGAT	2	8	57208	57215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014724	TTAT	2	8	58587	58594	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014724	TCAA	2	8	58651	58658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014724	TGCT	2	8	59164	59171	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014724	ATTA	2	8	59711	59718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014724	TTAC	2	8	59771	59778	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014724	ATAG	2	8	65762	65769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014724	CGAA	2	8	65875	65882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014724	CGGA	2	8	66149	66156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014724	CAAA	2	8	66213	66220	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014724	GCAA	2	8	66236	66243	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014724	CGAG	2	8	66359	66366	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014724	AGCG	2	8	66405	66412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014724	GTGA	2	8	66722	66729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014724	AGCG	2	8	66892	66899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014724	AAGC	2	8	67574	67581	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014724	ATAG	2	8	68221	68228	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014724	AGAA	2	8	68280	68287	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014724	GCGA	2	8	68309	68316	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014724	GTGA	2	8	68379	68386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014724	AGTT	2	8	68752	68759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014724	TAGG	2	8	70192	70199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014724	CTGC	2	8	71129	71136	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014724	TACA	2	8	73832	73839	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014724	ATTG	2	8	81623	81630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014724	AATA	2	8	86398	86405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014724	AGCA	2	8	88017	88024	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014724	GAAA	2	8	88123	88130	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014724	ATTG	2	8	90489	90496	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014724	GAAA	2	8	92704	92711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014724	AAGA	2	8	92743	92750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014724	TTGA	2	8	95244	95251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014724	TTGA	2	8	96341	96348	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014724	AAGA	2	8	98332	98339	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014724	ATGA	2	8	98359	98366	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014724	AATC	2	8	98491	98498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014724	AAAG	2	8	99337	99344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014724	CTTT	2	8	99369	99376	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014724	TGAG	2	8	99387	99394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014724	ATTT	2	8	105912	105919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014724	AAGG	2	8	110280	110287	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014724	ATTT	2	8	111390	111397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014724	AGTT	2	8	119906	119913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014724	AATT	2	8	128260	128267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014724	ATTA	2	8	128272	128279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014724	TAAA	2	8	130749	130756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014724	AAAC	2	8	130771	130778	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014724	TAGA	2	8	140680	140687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014724	AAAG	2	8	141545	141552	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014724	TAGT	2	8	141576	141583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014724	AATT	2	8	141610	141617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014724	AGAA	2	8	142749	142756	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014724	TGAT	2	8	143929	143936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014724	ATTA	2	8	149143	149150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014724	TGTA	2	8	158579	158586	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014724	ATTT	2	8	158670	158677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014724	AATG	2	8	161409	161416	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014724	GTTT	2	8	161541	161548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014724	TATT	2	8	165578	165585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014724	AATA	2	8	172860	172867	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014724	GATT	2	8	173720	173727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014724	ATGG	2	8	181886	181893	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014724	TATC	2	8	181905	181912	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014724	AAAG	2	8	182543	182550	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014724	GATA	2	8	184110	184117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014724	TGAT	2	8	184174	184181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014724	AAAT	2	8	186296	186303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014724	CATT	2	8	186355	186362	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014724	TTAA	2	8	186488	186495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014724	TTTA	2	8	187074	187081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014724	TCTA	2	8	187112	187119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014724	GTAT	2	8	187314	187321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014724	AGTT	2	8	192099	192106	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014724	AACT	2	8	193336	193343	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014724	TATT	2	8	193599	193606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014724	GTAA	2	8	193724	193731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014724	ACCT	2	8	199533	199540	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014724	TTAC	2	8	199741	199748	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014724	CTTC	2	8	199844	199851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014724	CTTT	2	8	202020	202027	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014724	TGGG	2	8	203787	203794	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014724	TTGA	2	8	206426	206433	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014724	GATT	2	8	209655	209662	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014724	AAGA	2	8	213399	213406	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014724	ATAA	2	8	219493	219500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014724	GTGG	2	8	220860	220867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014724	GGAT	2	8	222776	222783	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014724	GCAG	2	8	224893	224900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014724	TGAT	2	8	225802	225809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014724	ACAA	2	8	232600	232607	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014724	AATA	2	8	232615	232622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014724	TTTA	2	8	232680	232687	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014724	TTAT	2	8	236863	236870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014724	AGTC	2	8	239849	239856	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014724	TAAA	2	8	240995	241002	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014724	TAGC	2	8	243321	243328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014724	TATT	2	8	250766	250773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014724	TAAA	2	8	253074	253081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014724	TATT	2	8	253149	253156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014724	AGGT	2	8	253209	253216	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014724	TAGT	2	8	255991	255998	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014724	TGAA	2	8	257599	257606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014724	GTTT	2	8	258245	258252	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014724	ACTT	2	8	258472	258479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014724	ACAA	2	8	258659	258666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014724	ATAA	2	8	262611	262618	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014724	CTAC	2	8	270750	270757	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014724	TTCA	2	8	270797	270804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014724	TTGC	2	8	272255	272262	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014724	ATTG	2	8	272338	272345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014724	AATT	2	8	273983	273990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014724	TTTC	2	8	276497	276504	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014724	ATTA	2	8	277486	277493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014724	TATG	2	8	279326	279333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014724	ATCA	2	8	282105	282112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014724	TTAC	2	8	282416	282423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014724	AATC	2	8	282747	282754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014724	GATT	2	8	282845	282852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014724	GAAA	2	8	283500	283507	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014724	TTAA	2	8	289328	289335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014724	ATTA	2	8	289338	289345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014724	AGCA	2	8	290474	290481	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014724	TTGT	2	8	290501	290508	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014724	TTAA	2	8	300166	300173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014724	TTAA	2	8	303430	303437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014724	TTAC	2	8	304332	304339	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014724	TACA	2	8	318410	318417	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_014724	AGGA	2	8	321746	321753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014724	CCTT	2	8	339503	339510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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