MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leadbetterella byssophila DSM 17132 chromosome

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014655	CCTTAT	2	12	103611	103622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014655	TTGAAT	2	12	103778	103789	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014655	ATTTTT	2	12	116751	116762	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014655	TCGGTT	2	12	159498	159509	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014655	TTATCC	2	12	205800	205811	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014655	ATTTGA	2	12	278082	278093	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014655	AAATAT	2	12	288526	288537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014655	TTTCGC	2	12	303278	303289	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014655	CTTTTT	2	12	338230	338241	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014655	TATAGA	2	12	343696	343707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014655	AAGTTA	2	12	345276	345287	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014655	TTATAG	2	12	420789	420800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014655	GAAAGT	2	12	448777	448788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014655	TCAAAT	2	12	456595	456606	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014655	GAAAGT	2	12	459429	459440	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014655	AATATA	2	12	517998	518009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014655	ATTTTC	2	12	520288	520299	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014655	TTTTTA	2	12	575827	575838	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014655	ATTTTC	2	12	602059	602070	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014655	CCACAG	2	12	612190	612201	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014655	TGAAAG	2	12	688442	688453	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014655	CGTTTT	2	12	715958	715969	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014655	TACTTT	2	12	776593	776604	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014655	TCTTTT	2	12	780197	780208	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014655	AAAATT	2	12	838073	838084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014655	AAAAAT	2	12	843503	843514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014655	CGGAAA	2	12	844129	844140	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014655	TAAAAA	2	12	844180	844191	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014655	CCCATA	2	12	859014	859025	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014655	TTCCTT	2	12	864241	864252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014655	TTTCTT	2	12	873484	873495	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014655	TTCTAA	2	12	965250	965261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014655	AAAGAA	2	12	967438	967449	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014655	TAGCTT	2	12	967999	968010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014655	TAAAAT	2	12	976606	976617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014655	TAAAAA	2	12	995816	995827	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014655	GATGTA	2	12	1015661	1015672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014655	TCAATG	2	12	1081958	1081969	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014655	GAGATT	2	12	1084612	1084623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014655	ACCAAA	2	12	1086667	1086678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014655	GTATCG	2	12	1095567	1095578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014655	CAAGTT	2	12	1101890	1101901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014655	TACAGA	2	12	1120838	1120849	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014655	CAATGT	2	12	1121057	1121068	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014655	AACGAA	2	12	1329386	1329397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014655	TACTTC	2	12	1333829	1333840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014655	TTTATA	2	12	1391015	1391026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014655	CCATTC	2	12	1400172	1400183	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014655	CTGAAA	2	12	1408276	1408287	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014655	GTTATA	2	12	1420914	1420925	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014655	TTTTTC	2	12	1430975	1430986	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014655	AATAGA	2	12	1482865	1482876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014655	TCTACA	2	12	1539880	1539891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014655	TTTAAA	2	12	1564792	1564803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014655	AAGAGA	2	12	1564848	1564859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014655	TAAATA	2	12	1581690	1581701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014655	GTTTTT	2	12	1674982	1674993	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014655	TAAATA	2	12	1730696	1730707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014655	AATTTC	2	12	1791132	1791143	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014655	CTTATA	2	12	1804235	1804246	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014655	AAACAA	2	12	1843387	1843398	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014655	ATAAAT	2	12	1862279	1862290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014655	AAAGAT	2	12	1916149	1916160	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014655	GGCATA	2	12	2096326	2096337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014655	AAATAT	2	12	2150370	2150381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014655	TAAAAC	2	12	2254727	2254738	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014655	AAACGG	2	12	2287120	2287131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014655	CCACTT	2	12	2290274	2290285	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014655	AGCATA	2	12	2306144	2306155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014655	AGTAAC	2	12	2321307	2321318	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014655	TGTATT	2	12	2337075	2337086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014655	GTTGGG	2	12	2347246	2347257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014655	ATTGGC	2	12	2347698	2347709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014655	GTTGGG	2	12	2352896	2352907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014655	ATTGGC	2	12	2353348	2353359	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014655	TTAAAC	2	12	2358205	2358216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014655	CTCGGA	2	12	2376533	2376544	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014655	TCGCTT	2	12	2376868	2376879	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014655	CTTACG	2	12	2377161	2377172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014655	AATTAA	2	12	2402922	2402933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014655	GAATTA	2	12	2411791	2411802	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014655	GAAACT	2	12	2420558	2420569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014655	TTATCT	2	12	2420649	2420660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014655	TCCATA	2	12	2428088	2428099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014655	TTTTTA	2	12	2435795	2435806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014655	AACCAA	2	12	2438280	2438291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014655	TCATAT	2	12	2444977	2444988	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014655	CCAAGG	2	12	2465966	2465977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014655	ATTAAT	2	12	2468285	2468296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014655	TTTAAC	2	12	2643219	2643230	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014655	AAAATA	2	12	2708025	2708036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014655	TTAATC	2	12	2717930	2717941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014655	CAATAC	2	12	2722487	2722498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014655	ATTTAA	2	12	2725684	2725695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014655	CTCGGA	2	12	2757114	2757125	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014655	TCGCTT	2	12	2757449	2757460	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014655	CTTACG	2	12	2757742	2757753	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014655	GAAGGT	2	12	2778192	2778203	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014655	TAACCG	2	12	2778925	2778936	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014655	TTAGGT	2	12	2780851	2780862	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014655	TTTCCT	2	12	2782031	2782042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014655	CAAGAA	2	12	2844232	2844243	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014655	TATTTG	2	12	2884324	2884335	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014655	TAATTA	2	12	2988659	2988670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014655	TCTTAG	2	12	3067018	3067029	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014655	ACTTAA	2	12	3116106	3116117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014655	TTTTAT	2	12	3136469	3136480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014655	CGTAAG	2	12	3154993	3155004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014655	CGAAGC	2	12	3155278	3155289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014655	GTCCGA	2	12	3155620	3155631	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014655	TAAATC	2	12	3388180	3388191	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014655	AATTTT	2	12	3412289	3412300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014655	AAAAAG	2	12	3471505	3471516	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014655	CAAGGA	2	12	3472395	3472406	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014655	TATTTT	2	12	3483525	3483536	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014655	TACTCC	2	12	3495122	3495133	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014655	CTATAT	2	12	3528492	3528503	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014655	AGTTTA	2	12	3647626	3647637	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014655	AAATTA	2	12	3648488	3648499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014655	GCTTTT	2	12	3652985	3652996	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014655	CAATAG	2	12	3656688	3656699	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014655	TACACA	2	12	3678993	3679004	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014655	AATATT	2	12	3682760	3682771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014655	ATATGA	2	12	3683223	3683234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014655	ACCTAT	2	12	3683680	3683691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014655	ATTTTA	2	12	3749324	3749335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014655	TTTTTG	2	12	3768525	3768536	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014655	TTTGCA	2	12	3810033	3810044	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014655	TTTTGA	2	12	3820511	3820522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014655	AAAATA	2	12	3830031	3830042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014655	TTCAAT	2	12	3830254	3830265	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014655	TTTTAC	2	12	4011775	4011786	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014655	TTTAAT	2	12	4016453	4016464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014655	TTTAAT	2	12	4016682	4016693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014655	TTTAAT	2	12	4016909	4016920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.