MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III plasmid pST-III

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014558	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014558	CAT	2	6	23	28	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014558	ATA	2	6	29	34	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014558	CAA	2	6	80	85	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014558	GTT	2	6	348	353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014558	TTC	2	6	1238	1243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014558	AGA	2	6	1275	1280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014558	CTT	2	6	1438	1443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014558	AAC	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014558	ATT	3	9	6833	6841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014558	AAT	3	9	6849	6857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014558	CTT	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014558	AGA	2	6	8249	8254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014558	TGT	2	6	8283	8288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014558	ATT	2	6	8457	8462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014558	AAT	2	6	8544	8549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014558	TAT	2	6	8577	8582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014558	TAA	2	6	9320	9325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014558	CTA	2	6	9372	9377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014558	CGA	2	6	9565	9570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014558	GAC	2	6	9683	9688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014558	TAG	2	6	9750	9755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014558	CTA	2	6	9786	9791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014558	AAT	2	6	9882	9887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014558	ATC	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014558	TCA	2	6	10068	10073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014558	CTG	2	6	10188	10193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014558	AAG	2	6	10423	10428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014558	CAT	2	6	10488	10493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014558	CTT	2	6	10556	10561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014558	CCT	2	6	11831	11836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014558	ATT	2	6	11875	11880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014558	TTC	2	6	11915	11920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014558	GAC	2	6	11962	11967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014558	CTT	2	6	11982	11987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014558	CAC	2	6	12002	12007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014558	AAT	2	6	12141	12146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014558	CAC	2	6	12247	12252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014558	GCC	2	6	12263	12268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014558	TTA	2	6	12310	12315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014558	ATT	2	6	12433	12438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014558	TCC	2	6	14172	14177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014558	TAG	2	6	14239	14244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014558	CCT	2	6	15448	15453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014558	ATA	2	6	15546	15551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014558	TCT	2	6	15709	15714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014558	TAT	2	6	15768	15773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014558	ACT	2	6	15810	15815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014558	TTC	2	6	15902	15907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014558	GAA	2	6	15916	15921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014558	ATA	2	6	16067	16072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014558	ACC	2	6	16135	16140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_014558	TAG	2	6	16649	16654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014558	TAT	2	6	17634	17639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014558	CTT	2	6	18324	18329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014558	ACT	2	6	18362	18367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014558	TAT	2	6	18435	18440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014558	CTT	2	6	18506	18511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014558	CAT	2	6	18543	18548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014558	GTA	2	6	18559	18564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014558	TAT	2	6	19257	19262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014558	CTT	2	6	20109	20114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014558	GAT	2	6	20287	20292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014558	CTT	2	6	23433	23438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014558	ATC	2	6	24015	24020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014558	TGG	2	6	24085	24090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014558	CTA	2	6	24317	24322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014558	GAA	2	6	24427	24432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014558	AAG	2	6	24434	24439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014558	TAA	2	6	24495	24500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014558	GAG	2	6	24580	24585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014558	TTA	2	6	24714	24719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014558	CCG	2	6	25003	25008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014558	TGT	2	6	25109	25114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014558	ATA	2	6	25135	25140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014558	TCT	2	6	25150	25155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014558	CTC	2	6	25199	25204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014558	TCT	2	6	25308	25313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014558	GAA	2	6	25354	25359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014558	AGG	2	6	26518	26523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014558	CAT	2	6	26549	26554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014558	CAA	2	6	26605	26610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014558	ACA	2	6	26724	26729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014558	ATA	2	6	26754	26759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014558	CCA	2	6	26825	26830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014558	GTA	2	6	26866	26871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014558	TAA	2	6	26962	26967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014558	CGT	2	6	26980	26985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014558	TGG	2	6	27763	27768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014558	ATT	2	6	27819	27824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014558	ATA	2	6	28396	28401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014558	ACT	2	6	28452	28457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014558	TAA	2	6	28470	28475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014558	TCA	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014558	TAG	2	6	28541	28546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014558	AGC	2	6	28575	28580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014558	TTA	2	6	28642	28647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014558	TAA	2	6	28648	28653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014558	ATT	2	6	28686	28691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014558	GTT	2	6	28753	28758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014558	ACT	2	6	28767	28772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014558	ATT	2	6	30837	30842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014558	CAT	2	6	30902	30907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014558	AAG	2	6	30923	30928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014558	TCT	2	6	30971	30976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014558	AAT	2	6	35116	35121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014558	ATT	2	6	35171	35176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014558	TAA	2	6	39134	39139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014558	GTT	2	6	39234	39239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014558	ATT	2	6	39413	39418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014558	AAT	2	6	39441	39446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014558	TAA	3	9	39452	39460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014558	ATA	2	6	39602	39607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014558	CAA	2	6	39649	39654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014558	TTA	2	6	39698	39703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014558	TAT	2	6	39713	39718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014558	TGC	2	6	39728	39733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014558	TTA	2	6	39782	39787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014558	GAA	2	6	39809	39814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014558	TCA	2	6	40968	40973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014558	TTG	2	6	41054	41059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014558	CCA	2	6	41109	41114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014558	TAC	2	6	41204	41209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014558	ATA	2	6	41263	41268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014558	ATT	2	6	41351	41356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014558	GGT	2	6	41438	41443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014558	TTG	2	6	41569	41574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014558	ATT	2	6	41631	41636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014558	AAT	2	6	45036	45041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014558	TGT	2	6	45104	45109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014558	TTC	2	6	45198	45203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014558	CTC	2	6	46397	46402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014558	ATA	2	6	46505	46510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014558	GTT	2	6	46598	46603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014558	GTT	2	6	46640	46645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014558	GCA	2	6	46774	46779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014558	TTG	2	6	47013	47018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014558	TTC	2	6	47115	47120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014558	TGT	2	6	47131	47136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014558	GCT	2	6	47342	47347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014558	TCA	3	9	47348	47356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014558	CGG	2	6	47413	47418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.