MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014554	A	6	6	1376	1381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014554	CTA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014554	TAC	2	6	1480	1485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014554	TAT	2	6	1493	1498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014554	AT	4	8	1501	1508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014554	AATA	2	8	2693	2700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014554	TAAA	2	8	2709	2716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014554	GAT	2	6	2798	2803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014554	ATATT	2	10	2830	2839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014554	GCT	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014554	CTA	2	6	2879	2884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014554	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014554	CGCT	2	8	2934	2941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014554	AATG	2	8	2949	2956	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014554	A	6	6	2982	2987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014554	TTA	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014554	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014554	A	6	6	3120	3125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014554	TATAA	2	10	3130	3139	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014554	GT	4	8	3150	3157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014554	ACG	2	6	6583	6588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014554	AGG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014554	T	7	7	9282	9288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014554	ATT	2	6	9302	9307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014554	GT	3	6	9321	9326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014554	GAA	2	6	9398	9403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014554	CTG	2	6	9412	9417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014554	TCA	2	6	9423	9428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014554	ACA	2	6	9483	9488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014554	CAG	2	6	9548	9553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014554	TG	3	6	9593	9598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014554	A	6	6	9635	9640	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014554	ATTG	2	8	9687	9694	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014554	CAA	2	6	9745	9750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014554	AAG	2	6	9823	9828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014554	AGG	2	6	9844	9849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014554	AG	3	6	10178	10183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014554	GAG	2	6	10821	10826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014554	TTTA	2	8	11115	11122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014554	GTG	2	6	11144	11149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014554	GGT	2	6	11200	11205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014554	GAGT	2	8	13267	13274	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014554	T	6	6	15227	15232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014554	TTGG	2	8	15269	15276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014554	ATA	2	6	15300	15305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014554	TAAA	2	8	15338	15345	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014554	ATG	2	6	15353	15358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014554	TAA	2	6	15374	15379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014554	TGG	2	6	15380	15385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014554	TTA	2	6	18706	18711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014554	T	7	7	18735	18741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014554	G	6	6	18752	18757	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014554	CTT	2	6	18781	18786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014554	CCA	2	6	18798	18803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_014554	ATA	2	6	18883	18888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014554	ATCTT	2	10	18949	18958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014554	GGA	2	6	18979	18984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014554	ATG	3	9	18988	18996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014554	TGT	3	9	19081	19089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014554	CAT	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014554	TCA	2	6	19144	19149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014554	TCAG	2	8	20770	20777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014554	ATT	2	6	20784	20789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014554	CTT	2	6	21039	21044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014554	ATA	2	6	21045	21050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014554	AAGG	2	8	29153	29160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014554	TGA	2	6	31000	31005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014554	GTATA	2	10	31025	31034	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014554	GTT	2	6	31175	31180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014554	TAA	2	6	31196	31201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014554	TCA	2	6	31245	31250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014554	TGG	2	6	31269	31274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014554	ATTA	2	8	31298	31305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014554	AAACA	2	10	32157	32166	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014554	GTTT	2	8	32205	32212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014554	TGA	2	6	32215	32220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014554	CCT	2	6	32917	32922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014554	TGA	2	6	35759	35764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014554	GTT	2	6	35794	35799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014554	TGAA	2	8	35808	35815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014554	TGA	2	6	35836	35841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014554	TAA	2	6	35888	35893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014554	GTT	2	6	35931	35936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014554	TGAT	2	8	36612	36619	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014554	TGT	2	6	36641	36646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014554	CAGT	2	8	36652	36659	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014554	A	7	7	37313	37319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014554	ATG	2	6	37371	37376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014554	CAA	2	6	37454	37459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014554	A	6	6	37458	37463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014554	ACA	2	6	37490	37495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014554	T	6	6	37508	37513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014554	A	7	7	37515	37521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014554	T	6	6	37526	37531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014554	TAAT	2	8	37535	37542	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014554	TAC	2	6	37587	37592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014554	AAAG	2	8	37613	37620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014554	CAAC	2	8	37666	37673	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014554	AT	3	6	37705	37710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014554	AGG	2	6	37755	37760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014554	GAA	2	6	42588	42593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014554	T	6	6	42617	42622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014554	GC	3	6	42743	42748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014554	GCTT	2	8	42822	42829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014554	A	7	7	43749	43755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014554	TAG	2	6	43793	43798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014554	T	7	7	45139	45145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014554	TAG	2	6	45150	45155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014554	A	6	6	45167	45172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014554	GAA	2	6	45174	45179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014554	AAT	2	6	45189	45194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014554	ATA	2	6	45454	45459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014554	TAAA	2	8	45540	45547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014554	AT	3	6	45575	45580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014554	ATT	2	6	45583	45588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014554	TAA	2	6	45616	45621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014554	TTA	2	6	46154	46159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014554	TA	3	6	46257	46262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014554	AAT	2	6	46281	46286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014554	A	6	6	46295	46300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014554	ATTG	2	8	46373	46380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014554	ATA	2	6	46381	46386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014554	CTC	2	6	46406	46411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014554	TA	4	8	46473	46480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014554	T	6	6	46489	46494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014554	TAA	2	6	46524	46529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014554	TTA	2	6	46543	46548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014554	TAT	2	6	46561	46566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014554	T	6	6	47198	47203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014554	CTT	2	6	48438	48443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014554	TG	3	6	48454	48459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014554	AT	3	6	48531	48536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014554	AAG	2	6	48538	48543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014554	TAC	2	6	48560	48565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014554	TTC	2	6	49771	49776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014554	GAT	2	6	49895	49900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014554	AT	3	6	49912	49917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014554	TTG	2	6	50609	50614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014554	TAGC	2	8	50718	50725	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014554	CTTG	2	8	50734	50741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014554	TCA	2	6	50786	50791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014554	GCA	2	6	51486	51491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014554	CAG	2	6	51508	51513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014554	CCA	2	6	51968	51973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_014554	TGG	2	6	51997	52002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014554	TGT	2	6	52831	52836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014554	T	6	6	55405	55410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014554	A	6	6	55463	55468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014554	TA	3	6	55688	55693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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433	NC_014554	ACC	2	6	142220	142225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
434	NC_014554	TTAA	2	8	142235	142242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_014554	TAAT	2	8	142248	142255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_014554	ACC	2	6	142257	142262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
437	NC_014554	GT	3	6	142796	142801	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
438	NC_014554	TTG	2	6	142822	142827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014554	ATT	2	6	142846	142851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_014554	CTT	2	6	144519	144524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_014554	TAT	2	6	144543	144548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_014554	ATT	2	6	144607	144612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014554	AGGA	2	8	144656	144663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
444	NC_014554	CAA	2	6	144664	144669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
445	NC_014554	TTG	2	6	147374	147379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
446	NC_014554	T	6	6	147387	147392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_014554	TAAA	2	8	147408	147415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_014554	G	6	6	147491	147496	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
449	NC_014554	G	7	7	148530	148536	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
450	NC_014554	TA	4	8	151232	151239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_014554	TTAA	2	8	151256	151263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014554	TA	3	6	151276	151281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_014554	ATTT	2	8	151335	151342	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014554	GTTAAC	2	12	151356	151367	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
455	NC_014554	ATA	2	6	151405	151410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_014554	AGG	2	6	151442	151447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014554	ATTT	2	8	152790	152797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_014554	TAG	2	6	155006	155011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_014554	TAG	2	6	157273	157278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_014554	ACG	2	6	158425	158430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_014554	GAG	2	6	158431	158436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
463	NC_014554	ATTC	2	8	160785	160792	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
464	NC_014554	TCC	2	6	163783	163788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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466	NC_014554	ATT	2	6	163995	164000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_014554	TTC	2	6	164127	164132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_014554	TG	3	6	164206	164211	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
474	NC_014554	AAT	2	6	164212	164217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_014554	TTG	2	6	164224	164229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
476	NC_014554	AACG	2	8	164247	164254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
477	NC_014554	TGA	2	6	164267	164272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
478	NC_014554	GTA	2	6	164280	164285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
479	NC_014554	TAA	2	6	164286	164291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_014554	CTAG	2	8	164292	164299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
481	NC_014554	ATT	2	6	164307	164312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_014554	CGG	2	6	164690	164695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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484	NC_014554	CCT	2	6	165585	165590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
485	NC_014554	TTAT	2	8	165609	165616	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014554	ATT	2	6	167692	167697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_014554	AAT	2	6	167731	167736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_014554	AATTG	2	10	167773	167782	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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492	NC_014554	ACC	2	6	172190	172195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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495	NC_014554	GC	3	6	172246	172251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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499	NC_014554	TCG	2	6	172338	172343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
500	NC_014554	GGC	2	6	172387	172392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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