MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014554	GCG	2	6	1055075	1055080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_014554	AAG	2	6	1055105	1055110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014554	AG	3	6	1055109	1055114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014554	AAG	2	6	1055120	1055125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014554	AAG	2	6	1055129	1055134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014554	AAG	3	9	1055141	1055149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014554	AAG	2	6	1055156	1055161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014554	AAG	2	6	1055165	1055170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014554	CA	3	6	1055172	1055177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_014554	AGA	2	6	1055178	1055183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014554	GCT	2	6	1055186	1055191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_014554	AAG	2	6	1055192	1055197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014554	AAG	2	6	1055201	1055206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014554	CA	3	6	1055208	1055213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4015	NC_014554	AGA	2	6	1055214	1055219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014554	GCT	2	6	1055222	1055227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_014554	AAG	2	6	1055228	1055233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014554	AAG	2	6	1055237	1055242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014554	AAG	2	6	1055249	1055254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014554	TCT	2	6	1055258	1055263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_014554	AAG	2	6	1055264	1055269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014554	AAG	3	9	1055285	1055293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014554	TCT	2	6	1055294	1055299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_014554	AAG	3	9	1055318	1055326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014554	CAT	2	6	1055401	1055406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_014554	AAG	2	6	1055480	1055485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_014554	TAG	2	6	1055496	1055501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_014554	AGC	2	6	1055503	1055508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_014554	CTG	2	6	1055580	1055585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_014554	GAA	2	6	1055605	1055610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_014554	TGG	2	6	1055611	1055616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014554	AGCG	2	8	1055658	1055665	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_014554	ACC	2	6	1055702	1055707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4034	NC_014554	AAG	2	6	1055708	1055713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014554	GAC	2	6	1055815	1055820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_014554	ACA	2	6	1055827	1055832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_014554	GCAAG	2	10	1055862	1055871	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4038	NC_014554	TAA	2	6	1055902	1055907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_014554	AAG	2	6	1055909	1055914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014554	CGAAA	2	10	1055949	1055958	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4041	NC_014554	A	7	7	1055976	1055982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014554	TAA	2	6	1055992	1055997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014554	TCT	2	6	1056014	1056019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_014554	ATTT	2	8	1056027	1056034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014554	GAT	2	6	1056065	1056070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014554	GA	3	6	1056100	1056105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_014554	GGT	2	6	1056116	1056121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014554	TAT	2	6	1056161	1056166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014554	CAA	2	6	1056222	1056227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_014554	GTG	2	6	1056302	1056307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014554	G	6	6	1056342	1056347	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014554	TACC	2	8	1056350	1056357	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_014554	TGAT	2	8	1056383	1056390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_014554	GTT	2	6	1056449	1056454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014554	ATTT	2	8	1056520	1056527	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014554	TGAT	2	8	1056971	1056978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014554	GGA	2	6	1056985	1056990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_014554	TGGGCT	2	12	1057075	1057086	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4059	NC_014554	TTG	2	6	1057255	1057260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_014554	ATG	2	6	1057424	1057429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_014554	CCTGTT	2	12	1057447	1057458	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_014554	CTT	2	6	1057481	1057486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_014554	GGA	2	6	1058464	1058469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014554	ATT	2	6	1058482	1058487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014554	ATT	2	6	1058499	1058504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_014554	TGG	2	6	1058510	1058515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_014554	CGA	2	6	1058771	1058776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_014554	AAT	2	6	1058779	1058784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_014554	AGG	2	6	1058829	1058834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014554	ATG	2	6	1059164	1059169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014554	TGG	2	6	1059180	1059185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014554	ATTC	2	8	1059187	1059194	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_014554	TGGG	2	8	1060301	1060308	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014554	A	6	6	1060319	1060324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_014554	CTA	2	6	1060374	1060379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_014554	TAATGA	2	12	1060436	1060447	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_014554	ATT	2	6	1060451	1060456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014554	AGA	2	6	1060472	1060477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014554	T	6	6	1060488	1060493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_014554	TGAA	2	8	1060555	1060562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_014554	CGTAT	2	10	1060609	1060618	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_014554	GAA	2	6	1061289	1061294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014554	ATT	2	6	1061326	1061331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014554	CAA	2	6	1061671	1061676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4085	NC_014554	AAT	2	6	1062795	1062800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_014554	TGGG	2	8	1063379	1063386	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_014554	TAC	2	6	1063453	1063458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_014554	GAT	2	6	1063471	1063476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_014554	GCAT	2	8	1063557	1063564	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_014554	T	6	6	1063564	1063569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014554	GTGA	2	8	1063576	1063583	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_014554	TGAA	2	8	1063631	1063638	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_014554	TGAA	2	8	1063799	1063806	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014554	GAA	3	9	1063845	1063853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014554	ATT	2	6	1063985	1063990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_014554	ACA	2	6	1064028	1064033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_014554	ATG	2	6	1064048	1064053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014554	TAG	2	6	1064118	1064123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014554	ACTGT	2	10	1064128	1064137	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4100	NC_014554	CAAC	2	8	1064244	1064251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4101	NC_014554	GGA	2	6	1064341	1064346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014554	ATT	2	6	1064360	1064365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014554	GAT	2	6	1064404	1064409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014554	AG	3	6	1064473	1064478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014554	CG	3	6	1064479	1064484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_014554	ATTG	2	8	1064490	1064497	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014554	GAA	2	6	1064517	1064522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014554	TAA	2	6	1064548	1064553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014554	TTA	2	6	1065054	1065059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014554	GGC	2	6	1065132	1065137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_014554	ATA	2	6	1065157	1065162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014554	CGT	2	6	1065272	1065277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_014554	AT	3	6	1065296	1065301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014554	ACAA	2	8	1065383	1065390	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4115	NC_014554	TCGT	2	8	1065686	1065693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_014554	ATTA	2	8	1065748	1065755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014554	T	6	6	1065839	1065844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014554	ATT	2	6	1065885	1065890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014554	AGA	2	6	1066988	1066993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014554	AACGA	2	10	1067010	1067019	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4121	NC_014554	ATTT	2	8	1068046	1068053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014554	GAT	2	6	1068064	1068069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014554	ATT	2	6	1068102	1068107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014554	ATA	2	6	1068177	1068182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_014554	TGTT	2	8	1068279	1068286	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014554	TG	3	6	1069465	1069470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014554	TAAT	2	8	1074645	1074652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014554	ATT	2	6	1074682	1074687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014554	ATG	2	6	1074690	1074695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_014554	ACC	2	6	1075615	1075620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4131	NC_014554	TCAT	2	8	1076448	1076455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4132	NC_014554	ACA	2	6	1076458	1076463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4133	NC_014554	ATT	2	6	1076469	1076474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_014554	ATTT	2	8	1076482	1076489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_014554	GTA	2	6	1076491	1076496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4139	NC_014554	TA	3	6	1076567	1076572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_014554	T	6	6	1076669	1076674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4141	NC_014554	TTG	2	6	1080382	1080387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4144	NC_014554	TTA	2	6	1081958	1081963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_014554	TTA	2	6	1081970	1081975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4152	NC_014554	T	6	6	1082274	1082279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4153	NC_014554	TAC	2	6	1083015	1083020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4162	NC_014554	A	6	6	1083423	1083428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4165	NC_014554	TGAA	2	8	1083570	1083577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_014554	AGA	2	6	1083613	1083618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4251	NC_014554	A	6	6	1109013	1109018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_014554	ATT	2	6	1109051	1109056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_014554	TA	3	6	1109122	1109127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_014554	ATA	2	6	1109159	1109164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_014554	AAT	2	6	1109200	1109205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4257	NC_014554	GATT	2	8	1109225	1109232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4258	NC_014554	ATTT	2	8	1109236	1109243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_014554	ATA	2	6	1109244	1109249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4261	NC_014554	GGGTT	2	10	1109305	1109314	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_014554	A	6	6	1110977	1110982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4264	NC_014554	TGAA	2	8	1110999	1111006	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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