MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_014554	TGA	2	6	789885	789890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014554	TGT	2	6	791227	791232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014554	A	6	6	791287	791292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014554	GAAA	2	8	792051	792058	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014554	CAC	2	6	792064	792069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_014554	ATT	2	6	792087	792092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014554	GAT	2	6	792095	792100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3012	NC_014554	CAA	2	6	792277	792282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_014554	T	7	7	792333	792339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014554	TCC	2	6	792848	792853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_014554	TTA	2	6	792856	792861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3017	NC_014554	TAAA	2	8	792953	792960	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014554	ATAA	2	8	792985	792992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014554	GTA	2	6	793012	793017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014554	TCA	2	6	793042	793047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3022	NC_014554	A	6	6	793503	793508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014554	TAAA	2	8	793527	793534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014554	AATT	2	8	793568	793575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_014554	AAT	2	6	793687	793692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3027	NC_014554	ACTA	2	8	793718	793725	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_014554	AATG	2	8	793782	793789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3030	NC_014554	ATT	3	9	793906	793914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014554	GAA	2	6	793932	793937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014554	GGA	2	6	793966	793971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014554	ATTG	2	8	796949	796956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014554	AGAAC	2	10	796975	796984	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3035	NC_014554	CTTA	2	8	797011	797018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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3037	NC_014554	GTC	2	6	797068	797073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3039	NC_014554	AT	3	6	797124	797129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014554	TAA	2	6	797133	797138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014554	ATT	2	6	797142	797147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014554	GGAA	2	8	797160	797167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014554	A	6	6	797166	797171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_014554	TAA	2	6	798087	798092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_014554	CAGTT	2	10	798100	798109	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3051	NC_014554	ATT	2	6	798121	798126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_014554	ATT	2	6	798537	798542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014554	T	7	7	798595	798601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3055	NC_014554	TTG	2	6	799996	800001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3058	NC_014554	CAT	2	6	800156	800161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_014554	GAGT	2	8	800194	800201	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014554	ATA	2	6	803153	803158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_014554	TAG	2	6	803197	803202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014554	T	6	6	803269	803274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014554	GT	3	6	803278	803283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014554	TTG	2	6	803285	803290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014554	GGA	2	6	803304	803309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_014554	ATT	2	6	803311	803316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014554	ATA	2	6	805956	805961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_014554	A	7	7	805968	805974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014554	ATT	2	6	806038	806043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3081	NC_014554	TACGA	2	10	806485	806494	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
3082	NC_014554	ACG	2	6	806737	806742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3085	NC_014554	CAA	2	6	806983	806988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_014554	ACA	2	6	808619	808624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_014554	A	6	6	809499	809504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_014554	TA	3	6	809540	809545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014554	GGA	2	6	809553	809558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014554	ATA	2	6	809923	809928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_014554	GAA	2	6	809991	809996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_014554	GC	3	6	810031	810036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3109	NC_014554	TTG	2	6	810104	810109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_014554	A	6	6	810175	810180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014554	AGT	2	6	810222	810227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3113	NC_014554	GAT	2	6	810267	810272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3119	NC_014554	GCG	2	6	812843	812848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_014554	AAATT	2	10	812917	812926	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3122	NC_014554	GGA	2	6	813985	813990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014554	AGT	2	6	814433	814438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3127	NC_014554	ATT	2	6	815069	815074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014554	T	7	7	815989	815995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014554	ATT	2	6	816011	816016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3131	NC_014554	ATA	2	6	817122	817127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014554	TA	3	6	817191	817196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_014554	A	6	6	817200	817205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_014554	AAT	2	6	817224	817229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_014554	GAT	2	6	817351	817356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3137	NC_014554	A	6	6	817413	817418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3232	NC_014554	A	6	6	838516	838521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3259	NC_014554	A	6	6	848071	848076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3260	NC_014554	ATG	2	6	848092	848097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3264	NC_014554	TAA	2	6	851352	851357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_014554	TTGG	2	8	851405	851412	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3266	NC_014554	C	6	6	851878	851883	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3267	NC_014554	GTT	2	6	851904	851909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_014554	AGTA	2	8	852074	852081	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_014554	TAT	2	6	852083	852088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_014554	TAAAA	2	10	852143	852152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_014554	CAA	2	6	852973	852978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3272	NC_014554	TAA	2	6	853051	853056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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